基于分子模擬的離子液體修飾Porcine Pancreas脂肪酶催化性能和穩(wěn)定性的相關(guān)研究
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【摘要】:采用分子模擬手段研究了功能性離子液體[HOOCBMIm]Cl修飾Porcine Pancreas脂肪酶(PPL)結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性與催化性能增強(qiáng)的機(jī)理.在335和300 K下比較研究兩種脂肪酶的一系列相互作用特點(diǎn)與結(jié)構(gòu)性質(zhì),包括靜電勢(electrostatic potential,ESP)、均方根偏差(Root Mean Square Deviation,RMSD)、能量變化、溶劑化面積等等.分析結(jié)果表明:在335K下,修飾后的脂肪酶(Engineered PPL)的RMSD值(0.537?)小于未修飾的脂肪酶(Wild-type PPL)的RMSD值(0.68?),同時(shí)Engineered PPL的自由能也低于Wild-type PPL的自由能,說明Engineered PPL的構(gòu)象更加穩(wěn)定.修飾劑的引入使得Engineered PPL的疏水性面積和溶劑可及性面積(Solvent Accessible Surface Area,SASA)增大,增強(qiáng)了Engineered PPL的穩(wěn)定性和水解活力.修飾劑的正電性與修飾位點(diǎn)附近的負(fù)電勢氨基酸形成靜電吸引作用,優(yōu)化了蛋白表面電荷的相互作用,進(jìn)一步提高了蛋白穩(wěn)定性;同時(shí)也穩(wěn)定了蛋白蓋子結(jié)構(gòu)的打開狀態(tài),有利于底物進(jìn)入蛋白空腔催化位點(diǎn),實(shí)現(xiàn)催化活性提升.本文從分子水平展示了離子液體修飾脂肪酶并提供了一種解析化學(xué)修飾改變酶學(xué)性質(zhì)的方法.
【作者單位】: 南京工業(yè)大學(xué)材料化學(xué)工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室生物與制藥工程學(xué)院;華東理工大學(xué)生物反應(yīng)器工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室生物工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 豬胰脂肪酶 分子動力學(xué)模擬 離子液體 催化性能 穩(wěn)定性
【基金】:國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(No.2011AA02A209) 國家杰出青年科學(xué)基金(No.21225626)資助~~
【分類號】:O629.8
【正文快照】: Received July 18,2015;published October 22,2015.Project supported by the Hi-Tech Research and Development Program of China(No.2011AA02A209)and The National Science Fund for DistinguishedYoung Scholars(No.21225626).1引言脂肪酶(EC3.1.1.3)能催化水解、酯化、
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