Y220C突變體影響p53C蛋白質(zhì)構(gòu)象轉(zhuǎn)換的分子動力學模擬
本文關鍵詞:Y220C突變體影響p53C蛋白質(zhì)構(gòu)象轉(zhuǎn)換的分子動力學模擬
更多相關文章: 癌癥 p 殘基突變 構(gòu)象轉(zhuǎn)換 分子動力學模擬
【摘要】:p53是迄今發(fā)現(xiàn)突變頻率最高的一種腫瘤抑制蛋白質(zhì),突變會導致p53抑癌功能喪失并誘導癌癥的發(fā)生。絕大多數(shù)的突變發(fā)生在p53的核心DNA結(jié)合區(qū)域(p53C),其中Y220C是研究較多的一種突變體。雖然已有研究表明該突變能夠降低p53C的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性,但其影響p53C構(gòu)象轉(zhuǎn)換的分子機制尚不清晰。本文利用分子動力學(MD)模擬方法研究了p53C突變體Y220C(p53C-Y220C)的結(jié)構(gòu)變化,發(fā)現(xiàn)Y220C突變主要影響Y220C cluster區(qū)域(包括殘基138-164和215-238),且Y220C突變減少了Y220C cluster的β-折疊含量。進一步分析發(fā)現(xiàn),Y220C突變不僅直接破壞突變氨基酸與周圍氨基酸Leu145和Thr155之間的氫鍵,而且降低了Y220C cluster區(qū)域的折疊片S3和S8之間的氫鍵數(shù)量,使Y220C突變所形成的親水性空腔變大,加速了水分子進入該蛋白質(zhì)內(nèi)部,并最終導致了p53C-Y220C變性。MD模擬結(jié)果揭示了Y220C突變影響p53C結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)換的分子機制,該研究對p53C-Y220C突變體高效穩(wěn)定劑的篩選和設計具有重要意義。
【作者單位】: 天津大學化工學院生物工程系;天津科技大學海洋與環(huán)境學院;天津科技大學生物工程學院;
【關鍵詞】: 癌癥 p 殘基突變 構(gòu)象轉(zhuǎn)換 分子動力學模擬
【基金】:國家自然科學基金(21576199)資助項目~~
【分類號】:O629.73
【正文快照】: 1引言p53是一種重要的腫瘤抑制蛋白質(zhì)。p53通過與DNA或其他蛋白質(zhì)(如MDM2等1)發(fā)生相互作用從而在細胞生長周期的調(diào)控、細胞分化和細胞凋亡等生命過程中發(fā)揮著重要的作用2。因此p53具有阻滯腫瘤細胞周期,促進腫瘤細胞凋亡以及抑制腫瘤血管生成等多種抑癌功能。人類p53蛋白質(zhì)含
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,本文編號:551054
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