常見(jiàn)鱈科鱈魚(yú)的3種分子鑒定技術(shù)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-03 16:33
鱈魚(yú)通常指鱈形目魚(yú)類(lèi),包含大西洋鱈魚(yú)、太平洋鱈魚(yú)、黑線鱈等經(jīng)濟(jì)價(jià)值較高的重要魚(yú)類(lèi)。在我國(guó),鱈魚(yú)的消費(fèi)量逐年遞增,市售鱈魚(yú)種類(lèi)繁多,其市場(chǎng)價(jià)格也差異懸殊。然而,大多數(shù)鱈魚(yú)被加工制成冷凍魚(yú)片等產(chǎn)品進(jìn)行銷(xiāo)售,而且產(chǎn)品包裝缺乏正確的學(xué)名標(biāo)注。消費(fèi)者難以從外觀上辨別出鱈魚(yú)的真假和所屬種類(lèi),由此造成了鱈魚(yú)市場(chǎng)命名混亂,以次充好的復(fù)雜現(xiàn)狀。因此,急需建立一些快速準(zhǔn)確、簡(jiǎn)便實(shí)用的檢測(cè)方法應(yīng)用于市售鱈魚(yú)成分的檢測(cè)。本文以鱈科鱈魚(yú)為研究對(duì)象,選擇易與鱈魚(yú)混淆的南極犬牙魚(yú)和異鱗蛇鯖為陰性對(duì)照,采用熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qPCR)體系、環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)以及膠體金(AuNPs)比色檢測(cè)技術(shù)對(duì)其進(jìn)行種類(lèi)鑒定與分析。主要研究結(jié)果如下:1.選擇16S rDNA基因設(shè)計(jì)區(qū)分鱈科和非鱈科魚(yú)類(lèi)的引物,選用線粒體Cytb基因分別設(shè)計(jì)針對(duì)大西洋鱈魚(yú)、太平洋鱈魚(yú)、黑線鱈、南極犬牙魚(yú)以及異鱗蛇鯖的物種特異性引物,建立qPCR體系,對(duì)其進(jìn)行物種鑒定分析。檢測(cè)結(jié)果表明,所建立的qPCR體系具有良好的特異性和重復(fù)性,其中16S rDNA qPCR體系能夠快速有效區(qū)分鱈科與非鱈科物種,5種物種特異性qPCR體系能有效鑒定目...
【文章來(lái)源】:浙江工商大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
6SrDNAqPCR體系和物種特異性qPCR體系的絕對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線
18圖2.316SrDNAqPCR體系和物種特異性qPCR體系的相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.2.3Relativequantitativestandardcurvesofspecies-specificand16SrDNAgenesinqPCRassay注:a:混合鱈魚(yú)樣品在16SrDNAqPCR體系中的相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線;b:混合鱈魚(yú)樣品在物種特異性qPCR體系中的相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線。GMO:大西洋鱈魚(yú);GMA:太平洋鱈魚(yú);MA:黑線鱈;DE:南極犬牙魚(yú);FL:異鱗蛇鯖。Note:a:Relativequantitativestandardofmixedsamplesin16SrDNAqPCRsystem;b:Relativequantitativestandardcurveofmixedsamplesinaspecies-specificqPCRsystem.GMO:G.morhua;GMA:G.macrocephalus;MA:M.aeglefinus;DE:D.eleginoides;LF:L.flavobrunneum.2.2.6市售鱈魚(yú)及鱈魚(yú)深加工制品的檢測(cè)從當(dāng)?shù)厥袌?chǎng)購(gòu)得20種鱈魚(yú)產(chǎn)品(其中包括5種深加工制品),采用本研究建立的qPCR體系進(jìn)行物種檢測(cè)。檢測(cè)結(jié)果如表2.4所示,20種檢測(cè)樣品中有14種在16SrDNA體系中顯示陽(yáng)性,表明其確實(shí)屬于鱈科(與產(chǎn)品標(biāo)簽一致)。其中挪威北極鱈(8號(hào)和9號(hào)樣品)是大西洋鱈魚(yú)中的一種,是挪威海產(chǎn)局為了強(qiáng)調(diào)產(chǎn)地和物種另起的商品名稱。2種深加工樣品(1號(hào)和5號(hào))中出現(xiàn)大西洋鱈魚(yú)和太平洋鱈魚(yú)同時(shí)檢出的現(xiàn)象,由于國(guó)內(nèi)市場(chǎng)中太平洋鱈魚(yú)價(jià)格低于大西洋鱈魚(yú),說(shuō)明在市售鱈魚(yú)的加工制品中存在以次充好的現(xiàn)象。值得注意的是,3、6、7、11、17、19號(hào)樣品產(chǎn)品名稱分別為鱈魚(yú)餅、鱈魚(yú)切片、無(wú)頭鱈魚(yú)、黑鱈魚(yú)、南極犬牙魚(yú)和鱈魚(yú)柳,但檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)其不屬于常見(jiàn)的大西洋鱈、太平洋鱈和黑線鱈,也不屬于鱈科魚(yú)類(lèi)。為進(jìn)一步驗(yàn)證qPCR體系的檢測(cè)結(jié)果,采用常規(guī)PCR方法對(duì)20種檢測(cè)樣品進(jìn)行擴(kuò)增并將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序(2.1.4.2)。結(jié)果顯示,qPCR體系檢測(cè)出的陽(yáng)性結(jié)果與DNA測(cè)序結(jié)果一致。二者的區(qū)別在于:1號(hào)和5號(hào)樣品測(cè)序結(jié)果顯示為單一
28果一致,說(shuō)明了本研究中設(shè)計(jì)的針對(duì)3種鱈魚(yú)以及鱈科鱈魚(yú)的4種LAMP體系具有較強(qiáng)的特異性,可用于鱈魚(yú)物種的快速鑒定。圖3.1LAMP熒光法(上)和LAMP指示劑法(下)的特異性檢測(cè)Fig.3.1SpecificitytestoffluorescenceLAMP(top)andvisualLAMP(bottom)assays.注:1.在A,B,C中,“其它”代表除該體系針對(duì)的目標(biāo)鱈魚(yú)外的物種;lane1:目標(biāo)鱈魚(yú);lane2-3:非目標(biāo)鱈魚(yú);lane4-5:非鱈魚(yú)物種;lane6:空白對(duì)照。2.在D中,“其它”代表除3種目標(biāo)鱈魚(yú)物種外的非鱈科物種;lane1:大西洋鱈魚(yú);lane2:太平洋鱈魚(yú);lane3:黑線鱈;lane4:南極犬牙魚(yú);lane5:異鱗蛇鯖;lane6:空白對(duì)照。3.GMO:大西洋鱈;GMA:太平洋鱈;MA:黑線鱈;DE:南極犬牙魚(yú);FL:異鱗蛇鯖;CK:空白對(duì)照。Note:1.In(A,B,andC),othersrepresentedthenon-targetcodspeciesandnon-codspecies;lane1:targetcodDNA,lane2-3:non-targetcodspecies;lane4-5:non-codspecies;lane6:theblankcontrol.2.In(D),othersrepresentedthenon-codspeciestestedinthisstudy.lane1:G.morhua;lane2:G.macrocephalus;lane3:M.aeglefinus;lane4:D.eleginoides;lane5:L.flavobrunneum;lane6:theblankcontrol.3.GMO:G.morhua;GMA:G.macrocephalus;MA:M.aeglefinus.DE:D.eleginoides;LF:L.flavobrunneum;CK:notemplatecontrols.3.2.3LAMP體系的靈敏度分析通過(guò)紫外-可見(jiàn)分光光度計(jì)在260nm波長(zhǎng)下的測(cè)定,大西洋鱈魚(yú)DNA平均濃度為285ng/μL,太平洋鱈魚(yú)DNA平均濃度為370ng/μL,黑線鱈DNA平均濃度197ng/μL。將3種鱈魚(yú)樣品的DNA進(jìn)行10倍連續(xù)梯度稀釋,用于絕對(duì)靈敏度分析。如圖3.2所示,LAMP熒光法和LAMP指示劑法的檢測(cè)限一致,在3種鱈魚(yú)的物種特異性LAMP體系中(圖3.2
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)食品安全的研究進(jìn)展[J]. 王靜,許鑫,王雪雨,姚倫廣,闞云超,冀君. 中國(guó)生物工程雜志. 2018(11)
[2]鱈魚(yú)副產(chǎn)品的綜合利用[J]. 王鴻澤,趙聰穎,蘭海銘,趙叢枝,馬玉青. 食品安全導(dǎo)刊. 2018(09)
[3]石首魚(yú)科海洋魚(yú)類(lèi)DNA條形碼的構(gòu)建[J]. 蔣芝華,丁棒棒,王熠,丁艷菲,朱誠(chéng). 核農(nóng)學(xué)報(bào). 2018(04)
[4]環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)在食品檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 趙彩紅,高強(qiáng),李明生,徐紅偉. 農(nóng)業(yè)科技與信息. 2017(22)
[5]魚(yú)類(lèi)DNA條形碼技術(shù)的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 陳信忠,郭書(shū)林,龔艷清. 水產(chǎn)科學(xué). 2017(06)
[6]即食鱈魚(yú)骨的工藝及其風(fēng)味外撒粉的配方研究[J]. 王文勇,張英慧,賴長(zhǎng)生. 食品工業(yè). 2017(10)
[7]建立一種快速鑒定大西洋鱈魚(yú)及其制品的SYBR Green熒光PCR方法[J]. 孫曉飛,蔣丹,萬(wàn)超,劉淑艷,吳斌. 東北師大學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(03)
[8]等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的原理及其在病原檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 高瑤,孟星宇,羅玉子,胡永浩,仇華吉. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(08)
[9]黑線鱈魚(yú)皮膠原蛋白胰蛋白酶酶解多肽對(duì)UVB誘導(dǎo)HaCaT光損傷的抑制作用[J]. 董麗莎,李妍妍,張紅燕,崔晨茜,韓姣姣,王朝陽(yáng),司開(kāi)學(xué),周君,蘆晨陽(yáng),蘇秀榕. 食品科學(xué). 2018(10)
[10]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在肉及肉制品中的應(yīng)用[J]. 陳益春,牛海力,孔保華. 食品工業(yè)科技. 2017(17)
博士論文
[1]鱈魚(yú)等海產(chǎn)品物種防偽及保護(hù)的分子鑒定技術(shù)[D]. 方紹慶.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]常見(jiàn)柔魚(yú)科魷魚(yú)品種的分子鑒定技術(shù)研究[D]. 葉劍.浙江工商大學(xué) 2017
[2]基于DNA條形碼的魚(yú)片(肉)真?zhèn)舞b別技術(shù)研究[D]. 李新光.上海海洋大學(xué) 2013
[3]鱈魚(yú)排加工關(guān)鍵技術(shù)研究[D]. 王桓.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]松江鱸(Trachidermus fasciatus)種群的形態(tài)學(xué)與遺傳學(xué)研究及四種鱈魚(yú)的遺傳學(xué)研究[D]. 畢瀟瀟.中國(guó)海洋大學(xué) 2009
本文編號(hào):3319952
【文章來(lái)源】:浙江工商大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:76 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
6SrDNAqPCR體系和物種特異性qPCR體系的絕對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線
18圖2.316SrDNAqPCR體系和物種特異性qPCR體系的相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.2.3Relativequantitativestandardcurvesofspecies-specificand16SrDNAgenesinqPCRassay注:a:混合鱈魚(yú)樣品在16SrDNAqPCR體系中的相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線;b:混合鱈魚(yú)樣品在物種特異性qPCR體系中的相對(duì)定量標(biāo)準(zhǔn)曲線。GMO:大西洋鱈魚(yú);GMA:太平洋鱈魚(yú);MA:黑線鱈;DE:南極犬牙魚(yú);FL:異鱗蛇鯖。Note:a:Relativequantitativestandardofmixedsamplesin16SrDNAqPCRsystem;b:Relativequantitativestandardcurveofmixedsamplesinaspecies-specificqPCRsystem.GMO:G.morhua;GMA:G.macrocephalus;MA:M.aeglefinus;DE:D.eleginoides;LF:L.flavobrunneum.2.2.6市售鱈魚(yú)及鱈魚(yú)深加工制品的檢測(cè)從當(dāng)?shù)厥袌?chǎng)購(gòu)得20種鱈魚(yú)產(chǎn)品(其中包括5種深加工制品),采用本研究建立的qPCR體系進(jìn)行物種檢測(cè)。檢測(cè)結(jié)果如表2.4所示,20種檢測(cè)樣品中有14種在16SrDNA體系中顯示陽(yáng)性,表明其確實(shí)屬于鱈科(與產(chǎn)品標(biāo)簽一致)。其中挪威北極鱈(8號(hào)和9號(hào)樣品)是大西洋鱈魚(yú)中的一種,是挪威海產(chǎn)局為了強(qiáng)調(diào)產(chǎn)地和物種另起的商品名稱。2種深加工樣品(1號(hào)和5號(hào))中出現(xiàn)大西洋鱈魚(yú)和太平洋鱈魚(yú)同時(shí)檢出的現(xiàn)象,由于國(guó)內(nèi)市場(chǎng)中太平洋鱈魚(yú)價(jià)格低于大西洋鱈魚(yú),說(shuō)明在市售鱈魚(yú)的加工制品中存在以次充好的現(xiàn)象。值得注意的是,3、6、7、11、17、19號(hào)樣品產(chǎn)品名稱分別為鱈魚(yú)餅、鱈魚(yú)切片、無(wú)頭鱈魚(yú)、黑鱈魚(yú)、南極犬牙魚(yú)和鱈魚(yú)柳,但檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)其不屬于常見(jiàn)的大西洋鱈、太平洋鱈和黑線鱈,也不屬于鱈科魚(yú)類(lèi)。為進(jìn)一步驗(yàn)證qPCR體系的檢測(cè)結(jié)果,采用常規(guī)PCR方法對(duì)20種檢測(cè)樣品進(jìn)行擴(kuò)增并將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序(2.1.4.2)。結(jié)果顯示,qPCR體系檢測(cè)出的陽(yáng)性結(jié)果與DNA測(cè)序結(jié)果一致。二者的區(qū)別在于:1號(hào)和5號(hào)樣品測(cè)序結(jié)果顯示為單一
28果一致,說(shuō)明了本研究中設(shè)計(jì)的針對(duì)3種鱈魚(yú)以及鱈科鱈魚(yú)的4種LAMP體系具有較強(qiáng)的特異性,可用于鱈魚(yú)物種的快速鑒定。圖3.1LAMP熒光法(上)和LAMP指示劑法(下)的特異性檢測(cè)Fig.3.1SpecificitytestoffluorescenceLAMP(top)andvisualLAMP(bottom)assays.注:1.在A,B,C中,“其它”代表除該體系針對(duì)的目標(biāo)鱈魚(yú)外的物種;lane1:目標(biāo)鱈魚(yú);lane2-3:非目標(biāo)鱈魚(yú);lane4-5:非鱈魚(yú)物種;lane6:空白對(duì)照。2.在D中,“其它”代表除3種目標(biāo)鱈魚(yú)物種外的非鱈科物種;lane1:大西洋鱈魚(yú);lane2:太平洋鱈魚(yú);lane3:黑線鱈;lane4:南極犬牙魚(yú);lane5:異鱗蛇鯖;lane6:空白對(duì)照。3.GMO:大西洋鱈;GMA:太平洋鱈;MA:黑線鱈;DE:南極犬牙魚(yú);FL:異鱗蛇鯖;CK:空白對(duì)照。Note:1.In(A,B,andC),othersrepresentedthenon-targetcodspeciesandnon-codspecies;lane1:targetcodDNA,lane2-3:non-targetcodspecies;lane4-5:non-codspecies;lane6:theblankcontrol.2.In(D),othersrepresentedthenon-codspeciestestedinthisstudy.lane1:G.morhua;lane2:G.macrocephalus;lane3:M.aeglefinus;lane4:D.eleginoides;lane5:L.flavobrunneum;lane6:theblankcontrol.3.GMO:G.morhua;GMA:G.macrocephalus;MA:M.aeglefinus.DE:D.eleginoides;LF:L.flavobrunneum;CK:notemplatecontrols.3.2.3LAMP體系的靈敏度分析通過(guò)紫外-可見(jiàn)分光光度計(jì)在260nm波長(zhǎng)下的測(cè)定,大西洋鱈魚(yú)DNA平均濃度為285ng/μL,太平洋鱈魚(yú)DNA平均濃度為370ng/μL,黑線鱈DNA平均濃度197ng/μL。將3種鱈魚(yú)樣品的DNA進(jìn)行10倍連續(xù)梯度稀釋,用于絕對(duì)靈敏度分析。如圖3.2所示,LAMP熒光法和LAMP指示劑法的檢測(cè)限一致,在3種鱈魚(yú)的物種特異性LAMP體系中(圖3.2
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)食品安全的研究進(jìn)展[J]. 王靜,許鑫,王雪雨,姚倫廣,闞云超,冀君. 中國(guó)生物工程雜志. 2018(11)
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[4]環(huán)介導(dǎo)恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)在食品檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 趙彩紅,高強(qiáng),李明生,徐紅偉. 農(nóng)業(yè)科技與信息. 2017(22)
[5]魚(yú)類(lèi)DNA條形碼技術(shù)的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 陳信忠,郭書(shū)林,龔艷清. 水產(chǎn)科學(xué). 2017(06)
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[7]建立一種快速鑒定大西洋鱈魚(yú)及其制品的SYBR Green熒光PCR方法[J]. 孫曉飛,蔣丹,萬(wàn)超,劉淑艷,吳斌. 東北師大學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(03)
[8]等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的原理及其在病原檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 高瑤,孟星宇,羅玉子,胡永浩,仇華吉. 動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2017(08)
[9]黑線鱈魚(yú)皮膠原蛋白胰蛋白酶酶解多肽對(duì)UVB誘導(dǎo)HaCaT光損傷的抑制作用[J]. 董麗莎,李妍妍,張紅燕,崔晨茜,韓姣姣,王朝陽(yáng),司開(kāi)學(xué),周君,蘆晨陽(yáng),蘇秀榕. 食品科學(xué). 2018(10)
[10]實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在肉及肉制品中的應(yīng)用[J]. 陳益春,牛海力,孔保華. 食品工業(yè)科技. 2017(17)
博士論文
[1]鱈魚(yú)等海產(chǎn)品物種防偽及保護(hù)的分子鑒定技術(shù)[D]. 方紹慶.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]常見(jiàn)柔魚(yú)科魷魚(yú)品種的分子鑒定技術(shù)研究[D]. 葉劍.浙江工商大學(xué) 2017
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[4]松江鱸(Trachidermus fasciatus)種群的形態(tài)學(xué)與遺傳學(xué)研究及四種鱈魚(yú)的遺傳學(xué)研究[D]. 畢瀟瀟.中國(guó)海洋大學(xué) 2009
本文編號(hào):3319952
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