靶向c-MYC和KRAS啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的喹啉類化合物設(shè)計(jì)與活性評(píng)價(jià)
發(fā)布時(shí)間:2021-05-22 01:57
G-四鏈體是由鳥嘌呤富集序列折疊成的特殊的核酸結(jié)構(gòu)。G-四鏈體可形成序列廣泛存在于生物體的基因組中。它的形成或拆散可調(diào)節(jié)端粒長(zhǎng)度,調(diào)控某些重要基因的表達(dá),從而對(duì)體內(nèi)一些重要的生理過程產(chǎn)生影響。采用小分子穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)G-四鏈體,調(diào)控相關(guān)基因表達(dá),成為疾病治療的新思路。腫瘤是一種難以治愈的疾病,多基因突變導(dǎo)致腫瘤的形成,同時(shí)調(diào)節(jié)多個(gè)與腫瘤相關(guān)基因的活性,呈現(xiàn)了很強(qiáng)的抗腫瘤潛力。G-四鏈體可形成序列在多個(gè)原癌基因的啟動(dòng)子區(qū)域均存在,同時(shí)調(diào)節(jié)原癌基因啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的穩(wěn)定性,有望對(duì)多通路基因活性進(jìn)行調(diào)節(jié),進(jìn)而控制腫瘤。本工作針對(duì)原癌基因c-MYC和KRAS啟動(dòng)子區(qū)G-四鏈體,發(fā)現(xiàn)了一類結(jié)構(gòu)新穎的喹啉類化合物,具體過程如下:(1)基于結(jié)構(gòu)的化合物虛擬篩選基于c-MYC和KRAS啟動(dòng)子區(qū)G-四鏈體結(jié)構(gòu),從商業(yè)化合物庫(kù)中篩選到穩(wěn)定兩個(gè)G-四鏈體結(jié)構(gòu)的喹啉類化合物;基于活性化合物結(jié)構(gòu),通過相似性搜索,購(gòu)買結(jié)構(gòu)多樣性化合物,并進(jìn)行活性測(cè)試;分析結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系,確定合成改造方向;(2)化合物合成改造優(yōu)化基于結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系,合成一系列在含氮六元環(huán)上進(jìn)行取代的喹啉衍生物,發(fā)現(xiàn)高活性化合物PQ8;(3)結(jié)合模...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語(yǔ)表
第一章 前言
1 G-四鏈體生物學(xué)功能與結(jié)構(gòu)
2 G-四鏈體的形成調(diào)控腫瘤相關(guān)生理過程
3 G-四鏈體作為潛在抗腫瘤藥物靶點(diǎn)
3.1 端粒末端G-四鏈體的生物學(xué)功能
3.2 c-MYC啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的生物學(xué)功能
3.3 KRAS啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的生物學(xué)功能
4 靶向多通路G-四鏈體的抗腫瘤治療策略
4.1 靶向多個(gè)啟動(dòng)子區(qū)G-四鏈體的腫瘤治療
4.2 靶向啟動(dòng)子區(qū)與端粒末端G-四鏈體的抗腫瘤治療
5 本論文研究意義及內(nèi)容
5.1 研究意義
5.2 研究?jī)?nèi)容及方案
第二章 靶向c-MYC和 KRAS啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的喹啉類化合物設(shè)計(jì)與活性評(píng)價(jià)
1 前言
2 試劑與儀器
2.1 化學(xué)藥品與生物試劑
2.2 儀器
3 材料與方法
3.1 虛擬篩選同時(shí)穩(wěn)定c-MYC和 KRAS G-四鏈體的化合物
3.2 FRET實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)G-四鏈體的穩(wěn)定性
3.3 細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)腫瘤細(xì)胞的抑制率
3.4 CD熔融實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)G-四鏈體的穩(wěn)定性
3.5 分析化合物PQ8與c-MYC/KRAS G-四鏈體的結(jié)合模式
3.6 細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)細(xì)胞周期分布的影響
3.7 細(xì)胞凋亡實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)腫瘤細(xì)胞增殖的影響
3.8 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)小分子穩(wěn)定G-四鏈體對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響
3.9 Western blot檢測(cè)小分子穩(wěn)定G-四鏈體對(duì)翻譯的影響
3.10 小鼠模型上檢測(cè)PQ8的抗腫瘤活性
4 結(jié)果與分析
4.1 同時(shí)穩(wěn)定c-MYC和 KRAS G-四鏈體的化合物的虛擬篩選
4.2 多樣化取代化合物的活性測(cè)試及結(jié)構(gòu)活性關(guān)系分析
4.3 含氮六元環(huán)上取代的化合物合成
4.4 活性測(cè)試及結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系分析
4.5 穩(wěn)定c-MYC/KRAS G-四鏈體的化合物PQ8
4.6 化合物PQ8與c-MYC/KRAS G-四鏈體結(jié)合模式分析
4.7 化合物PQ8 對(duì)三陰性乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231 細(xì)胞增殖的影響
4.8 化合物PQ8對(duì)mRNA表達(dá)水平的影響
4.9 化合物PQ8對(duì)蛋白翻譯水平的影響
4.10 化合物PQ8在小鼠模型上的抗腫瘤活性
5 本章小結(jié)
第三章 討論與展望
1 討論
2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄 S1引物表
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)的信息整合及穩(wěn)定G—四鏈的農(nóng)藥小分子類似物發(fā)掘[D]. 鄧華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]多喹啉衍生物靶向雙倍體G-四鏈體DNA及其生物活性研究[D]. 廖廷聰.南方醫(yī)科大學(xué) 2019
[3]分子對(duì)接程序重構(gòu)G-四鏈體—配體小分子復(fù)合物的能力評(píng)價(jià)[D]. 侯海濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3200762
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:73 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語(yǔ)表
第一章 前言
1 G-四鏈體生物學(xué)功能與結(jié)構(gòu)
2 G-四鏈體的形成調(diào)控腫瘤相關(guān)生理過程
3 G-四鏈體作為潛在抗腫瘤藥物靶點(diǎn)
3.1 端粒末端G-四鏈體的生物學(xué)功能
3.2 c-MYC啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的生物學(xué)功能
3.3 KRAS啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的生物學(xué)功能
4 靶向多通路G-四鏈體的抗腫瘤治療策略
4.1 靶向多個(gè)啟動(dòng)子區(qū)G-四鏈體的腫瘤治療
4.2 靶向啟動(dòng)子區(qū)與端粒末端G-四鏈體的抗腫瘤治療
5 本論文研究意義及內(nèi)容
5.1 研究意義
5.2 研究?jī)?nèi)容及方案
第二章 靶向c-MYC和 KRAS啟動(dòng)子區(qū)域G-四鏈體的喹啉類化合物設(shè)計(jì)與活性評(píng)價(jià)
1 前言
2 試劑與儀器
2.1 化學(xué)藥品與生物試劑
2.2 儀器
3 材料與方法
3.1 虛擬篩選同時(shí)穩(wěn)定c-MYC和 KRAS G-四鏈體的化合物
3.2 FRET實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)G-四鏈體的穩(wěn)定性
3.3 細(xì)胞毒性實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)腫瘤細(xì)胞的抑制率
3.4 CD熔融實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)G-四鏈體的穩(wěn)定性
3.5 分析化合物PQ8與c-MYC/KRAS G-四鏈體的結(jié)合模式
3.6 細(xì)胞周期實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)細(xì)胞周期分布的影響
3.7 細(xì)胞凋亡實(shí)驗(yàn)測(cè)試小分子對(duì)腫瘤細(xì)胞增殖的影響
3.8 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)小分子穩(wěn)定G-四鏈體對(duì)轉(zhuǎn)錄的影響
3.9 Western blot檢測(cè)小分子穩(wěn)定G-四鏈體對(duì)翻譯的影響
3.10 小鼠模型上檢測(cè)PQ8的抗腫瘤活性
4 結(jié)果與分析
4.1 同時(shí)穩(wěn)定c-MYC和 KRAS G-四鏈體的化合物的虛擬篩選
4.2 多樣化取代化合物的活性測(cè)試及結(jié)構(gòu)活性關(guān)系分析
4.3 含氮六元環(huán)上取代的化合物合成
4.4 活性測(cè)試及結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系分析
4.5 穩(wěn)定c-MYC/KRAS G-四鏈體的化合物PQ8
4.6 化合物PQ8與c-MYC/KRAS G-四鏈體結(jié)合模式分析
4.7 化合物PQ8 對(duì)三陰性乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231 細(xì)胞增殖的影響
4.8 化合物PQ8對(duì)mRNA表達(dá)水平的影響
4.9 化合物PQ8對(duì)蛋白翻譯水平的影響
4.10 化合物PQ8在小鼠模型上的抗腫瘤活性
5 本章小結(jié)
第三章 討論與展望
1 討論
2 展望
參考文獻(xiàn)
附錄 S1引物表
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
碩士論文
[1]農(nóng)藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)的信息整合及穩(wěn)定G—四鏈的農(nóng)藥小分子類似物發(fā)掘[D]. 鄧華.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]多喹啉衍生物靶向雙倍體G-四鏈體DNA及其生物活性研究[D]. 廖廷聰.南方醫(yī)科大學(xué) 2019
[3]分子對(duì)接程序重構(gòu)G-四鏈體—配體小分子復(fù)合物的能力評(píng)價(jià)[D]. 侯海濤.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3200762
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/huaxue/3200762.html
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