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赭曲霉毒素A核酸適配體的篩

發(fā)布時間:2020-11-13 09:47
   赭曲霉毒素A(Ochratoxin A,OTA)是由各種曲霉屬和青霉屬等真菌產(chǎn)生的次生代謝產(chǎn)物,廣泛存在于谷物和食品中,對人類和動物都有很大的危害。核酸適配體是通過指數(shù)富集的配體進(jìn)化技術(shù)(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)經(jīng)體外篩選得到的單鏈寡核苷酸(ssDNA或RNA),它們可通過自身形成特定復(fù)雜的空間三維結(jié)構(gòu)以高親和力和特異性結(jié)合靶標(biāo)分子。本研究通過改良的氧化石墨烯(Graphene Oxide,GO)的SELEX篩選方法,獲得OTA的核苷酸適配體,結(jié)合GO淬滅熒光和膠體金分光光度法技術(shù),構(gòu)建了兩種基于適配體識別OTA的快速靈敏的檢測方法。首先,基于GO吸附單鏈寡核苷酸ssDNA的原理,采用免固定化的GO-SELEX方法篩選OTA毒素適配體。經(jīng)過10輪篩選獲得適配體富集文庫,經(jīng)克隆測序后得到23條適配體候選序列,經(jīng)一級、二級結(jié)構(gòu),親和性和特異性分析,得到一條特異識別OTA毒素的最佳適配體Seq.14,其解離常數(shù)為138.9±4.9 nmol/L。其次,基于羧基熒光素(FAM)標(biāo)記的適配體與GO之間的熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)技術(shù),構(gòu)建了一種熒光傳感器。當(dāng)無OTA存在時,FAM標(biāo)記的適配體被GO吸附并淬滅其熒光信號;當(dāng)有OTA存在時,適配體與OTA結(jié)合,從GO上脫落,引起熒光的重新恢復(fù)。在最優(yōu)條件下,OTA毒素濃度在20~3000nmol/L之間與熒光強(qiáng)度呈線性相關(guān)性(R2=0.995),檢測限為21.8nmol/L,加標(biāo)回收率范圍在96.0~119.7%之間,相對標(biāo)準(zhǔn)偏差為3.8%。該方法可用于紅酒樣品中OTA毒素的檢測。最后,基于核酸適配體對靶標(biāo)的特異性和膠體金分光光度法的靈敏性,建立了一種簡單快速檢測OTA的方法。利用核酸適配體能夠抑制膠體金在高鹽溶液中的聚集,當(dāng)OTA存在時,其與適配體特異性結(jié)合,使膠體金發(fā)生聚集,膠體金的顏色發(fā)生變化。在最優(yōu)的條件下,吸光度的比值(A656nm/A520nm)與OTA濃度在0~300 ng/mL的范圍內(nèi)呈良好的線性關(guān)系,其線性回歸方程為y=0.001x+0.2264,線性相關(guān)系數(shù)R2為0.9962,加標(biāo)回收率為99.2~103.1%,相對標(biāo)準(zhǔn)偏差為4.4%。該方法穩(wěn)定性和重復(fù)性較好,可作為OTA的快速檢測方法。
【學(xué)位單位】:天津科技大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:Q503;O657.3
【部分圖文】:

示意圖,光檢測,無標(biāo)記,示意圖


天津科技大學(xué)碩士學(xué)位論文OTA的特異性識別能力,雜交鏈反應(yīng)模擬脫氧核酶技術(shù)開發(fā)了一種比色法檢測OTA。該方法的線性范圍至?0.01?nmol/L。??的有效性已經(jīng)被廣泛證實(shí),通過物質(zhì)所具有的的特性質(zhì)進(jìn)行定性定量分析。Qian等利用FRET原則,設(shè)過熒光傳感和肉眼觀察雙重模式檢測OTA。Lv等測雙鏈DNA這一特定性,建立了一種OTA檢測方法。其互補(bǔ)鏈配對形成雙螺旋結(jié)構(gòu),通過PicoGreen作為指部分適配體與OTA結(jié)合,加入其互補(bǔ)鏈與PicoGreenA的適配體雜交形成雙螺旋結(jié)構(gòu),PicoGreen插入到雙號。根據(jù)熒光信號與OTA濃度的相關(guān)性,定量檢測O檢測范圍超過5個數(shù)量級。??

示意圖,適配,信號放大,阻抗


Aptamer?Ochratoxin?A?Complementary?PicoGreen??strand??圖1-2無標(biāo)記焚光檢測OTA示意圖??Fig.?1-2?Label-free?fluorescence?detection?OTA??經(jīng)典的電化學(xué)傳感器是以電極表面作為一個固定化傳感元件的平臺,結(jié)合在其上??面的分析物通過對電流、電位或電阻變化的監(jiān)控來進(jìn)行檢測。Ling等H|]基于金納米粒??子(AuNPs)共價結(jié)合石墨烯片的電化學(xué)阻抗用于檢測皮摩爾級OTA,原理如圖丨-3:金??納米顆粒共價鍵合還原氧化石墨烯(AuNPs-rGO)在石墨烯片上產(chǎn)生了大量分散良好??的AuNP,其具有巨大的DNA結(jié)合位點(diǎn),因為單個rGO片和每個AuNP可以裝載數(shù)??百個DNA鏈。制作了一個夾心模型的適體傳感器,其中包含固定在金電極上的硫化??的捕獲DNA以捕獲適配體,然后將傳感界面與所需濃度的OTA共同孵育,后將??AuNPs-rGO官能化的DNA與殘留的適配體雜交。通過信號放大平臺,檢測電荷轉(zhuǎn)移??電阻(Rct)〇該方法檢測限為0.3?pg/mL或0.74?pmol/L。Huang等[42]基于滾環(huán)擴(kuò)增技術(shù)??(RCA)來實(shí)現(xiàn)電化學(xué)信號擴(kuò)大進(jìn)而進(jìn)行檢測OTA。其原理是:用于RCA的引物由兩??部分組成,一部分為OTA的核酸適配體,而另一部分與電極表面上的捕獲探針互補(bǔ)。??當(dāng)OTA存在時

原理圖,探針,原理,膠體金


能夠被GO保護(hù)抵抗不受核酸酶降解,當(dāng)ssDNA脫離GO表面后,由于不再受到??GO的保護(hù),能被核酸酶的降解。除此之外,GO同樣能夠?qū)Γ遥危廉a(chǎn)生保護(hù)能力;??于GO對核酸分子的保護(hù)效果,建立了?GO穩(wěn)定RNA的方法,其原理如圖1-4所示,??并基于該方法發(fā)展了?RNase?H輔助的信號放大方法用于檢測DNA,檢測限為0.1??pmol/L〇??*■?r\1B?<3^?ISurleaw,?f?\/?\?Target??圖1-4?GO保護(hù)RNA探針的原理??Fig.?1-4?Principle?of?protection?of?RNA?probe?with?GO??1.4.2納米金粒子??納米金(gold?nanoparticles,AuNPs),是一種直徑1 ̄100?nm之間的金的微小顆粒。??在溶液中,金納米粒子通過氯金酸(HAuCU)由還原劑如檸檬酸三鈉、抗壞血酸等還原??成金顆粒,形成由負(fù)電荷包裹的穩(wěn)定、均勻、呈單一分散狀態(tài)的金顆粒懸浮液,并在??靜電條件下形成穩(wěn)定的疏水膠體狀態(tài),故而又稱之為膠體金(colloidalgold)。不同粒徑??的膠體金溶液具有不同的光的散射作用,膠體金溶液會呈現(xiàn)不同的顏色,最小的膠體??金(2?5?nm)是橙色的
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本文編號:2882055

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