天堂国产午夜亚洲专区-少妇人妻综合久久蜜臀-国产成人户外露出视频在线-国产91传媒一区二区三区

當前位置:主頁 > 科技論文 > 化學論文 >

非經(jīng)典氫鍵驅(qū)動的DNA動態(tài)組裝

發(fā)布時間:2020-08-05 15:09
【摘要】:利用粘性末端介導的DNA鏈置換反應(Toehold-mediated DNA strand displacement reaction,TSDR)可以合理地構(gòu)建一系列動態(tài)的DNA模型,而小分子物質(zhì)三聚氰酸可以通過與poly(adenine)(poly(A))之間形成非經(jīng)典氫鍵使其組裝成穩(wěn)定的纖維結(jié)構(gòu)。本研究以三聚氰酸與poly(A)之間的非經(jīng)典氫鍵所驅(qū)動的DNA動態(tài)自組裝為基礎構(gòu)建出一種新的DNA模型,并探究內(nèi)部因素與外部因素對其速率的影響,同時利用此模型實現(xiàn)對micro RNA較好的分型效果和在DNA四面體組裝中的應用。通過對反應條件、反應物濃度及寡核苷酸鏈的長度進行優(yōu)化,使得構(gòu)建的DNA模型成立的同時,其發(fā)生動態(tài)自組裝的產(chǎn)率和速率最大。在對反應條件進行優(yōu)化時,發(fā)現(xiàn)當反應體系中的緩沖溶液的pH值為4.5、緩沖溶液的鎂離子濃度為10 mmol·L-1時,并在室溫下(25℃)動態(tài)自組裝的產(chǎn)率和速率最大,即體系的熒光值上升量最大;在對反應物濃度進行優(yōu)化時,若寡核苷酸鏈的初始濃度為1 μmol·L-1,發(fā)現(xiàn)當三聚氰酸的濃度為500μmol·L-1時反應產(chǎn)率和速率最大;在對寡核苷酸鏈的長度進行優(yōu)化時,分別對該DNA模型的頭部,中間及尾部進行優(yōu)化,發(fā)現(xiàn)在此模型的頭部增加兩個堿基,即侵入鏈的長度為31 bp時反應產(chǎn)率最大。除了通過反應體系熒光強度的變化來對反應結(jié)果進行表征,還可以通過原子力顯微鏡、聚丙烯酰胺凝膠電泳、反應產(chǎn)物的發(fā)射光譜、圓二色譜以及熔解曲線的測量等方法對其進行表征。研究結(jié)果表明,較之經(jīng)典氫鍵驅(qū)動的鏈置換反應,該模型的反應速率較高,且能被內(nèi)部和外部因素影響。若利用此最佳模型對micro RNA let-7a和let-7c進行檢測,分別將let-7a和let-7c替換掉模型的保護鏈,并使其在最佳條件下進行反應,發(fā)現(xiàn)當目標鏈不同時,體系的熒光值下降的速率和程度不同,說明該模型可以較好的應用于micro RNA的分型。實驗結(jié)果表明該模型也可以應用到DNA四面體組裝中,在構(gòu)建納米結(jié)構(gòu)方面有一定的應用性。
【學位授予單位】:北京化工大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:O629.74;O641.3
【圖文】:

核酸序列,演示圖,金屬


1.2.2基于DNA四鏈體的Toehold活化方式逡逑除了經(jīng)典的雙螺旋結(jié)構(gòu),DNA還可以形成四鏈體,比如分子內(nèi)或者分子間的能逡逑響應環(huán)境刺激因素的G-四鏈體[43]和i-motift441結(jié)構(gòu),由于DNA四鏈體具有獨一無二的逡逑生物功能,因此己經(jīng)在核酸研宄領域成為一個逐漸擴大的研宄課題|45l邋DNA四鏈體逡逑具有更高級的結(jié)構(gòu),被視為DNA納米技術(shù)中的很有前景的材料1461。目前,已經(jīng)研發(fā)逡逑出基于DNA四鏈體(G-四鏈體或者i-motil)的Toehold活化方法,這類方法可以通過調(diào)逡逑節(jié)多種環(huán)境刺激因素,進而有效地調(diào)控DNA鏈置換反應的動力學,此種方法也為合逡逑理地設計動態(tài)DNA反應模型提供了更多的可能性。逡逑G-四鏈體具有調(diào)控細胞生長或調(diào)亡的重要功能,存在于端粒的重復序列中。若在逡逑互補鏈和侵入鏈的Toehold區(qū)加入兩端含鳥嘌呤的重復序列和一段相關(guān)的核酸序列,逡逑其中我們將重復序列稱為G-四鏈體的子單位,將另一段相關(guān)的核酸序列稱為輔助序逡逑列,當體系中引入Sr2+時,侵入鏈與互補鏈的Toehold區(qū)的含鳥嘌呤的重復序列可結(jié)逡逑

原理圖,置換反應,凝血酶,原理圖


移邐Q.逡逑圖1-2基于G-四鏈體的Toehold活化原理[46]逡逑Fig.邋1-2邋Principle邋of邋the邋G-quadruplex-based邋toehold邋activation邋strategy逡逑Aptamer逡逑+邋ft逡逑l邐f逡逑> ̄^邋i邋i邋it邋\邋un邐J逡逑QI邐Q逡逑>"邋N邋Cycles邋)邐雪邋%逡逑W^-***%.邐、邐--一邐一逡逑ffiraxrammi^邋《^annmrmD^/逡逑Apumm邐從HTCG邋.m(U、如KKK'邐沁邋TGa邋c!、4*逡逑Inirktioti邋stmadUS)邋5VAGTCAI邋AVuU\#保埽醶rP埽蓿潁]3?mt邋s^in^rr邋n邋^邋iak;邋ire邋!邋-1<邋\邋i邋>邐a邋i'Mtu邋\邋on邋,逡逑A(邐f沁邋CU.…」.汀邋v.逡逑UP2邋5V^?0邋Hu邋<5Ai''UT邋i邋U邋Av;i邋^邋CA邋I邋AG邋'。停В粒ǎ澹欤海海吝;逡逑圖1-3基于G-四鏈體驅(qū)動的DNA鏈置換反應檢測凝血酶的原理圖[4I]逡逑Fig.邋1-3邋Schematic邋representation邋of邋the邋enzyme-free,邋non-label邋and邋sensitive邋fluorescent邋detection邋of逡逑thrombin邋based邋on邋the邋toehold邋strand邋displacement-driven邋as

原理圖,原理,置換反應,胞嘧啶


邐第一章緒論邐逡逑相比于G-四鏈體,我們把富含胞嘧啶的寡核苷酸鏈形成的DNA四鏈體稱為逡逑在接近中性的溶液中,由于C-C錯配所以Toehold區(qū)域分開,導致了極其逡逑緩慢的鏈置換反應。當體系的PH值下降時,胞嘧啶部分質(zhì)子化,形成了邋i-motif從而逡逑加快了鏈置換反應的速率。此類反應的速率可以通過對C-C+的數(shù)目和CS的長度進行逡逑調(diào)控得以實現(xiàn)。逡逑

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 李文送;;DNA甲基化及其生物學功能[J];生物學教學;2014年09期

2 劉慶華;茹慧香;;“DNA是主要的遺傳物質(zhì)”教學設計[J];中學生物教學;2016年07期

3 丁思思;袁華;羅小虎;李高峰;;植物DNA粗提取與鑒定的簡便方法[J];中學生物教學;2016年19期

4 周苑;;《DNA分子的結(jié)構(gòu)》微課程設計[J];中國信息技術(shù)教育;2016年24期

5 吳久宏;;追尋人類思維的脈絡——蘇教版“DNA分子的結(jié)構(gòu)”一節(jié)科學史料教學設計[J];中學生物教學;2016年21期

6 唐琳;;《DNA是主要的遺傳物質(zhì)》教學設計(第一課時)[J];課程教育研究;2016年35期

7 王佳惠;;“觀察DNA和RNA在細胞中的分布”實驗改進[J];中學生物教學;2016年18期

8 劉雪梅;;作圖法解決“放射性同位素標記DNA與細胞增殖”問題[J];中學生物教學;2016年18期

9 陳云;;“DNA是主要的遺傳物質(zhì)”一節(jié)的教學設計[J];生物學教學;2017年02期

10 霍靜;李妞妞;曾令江;;提高“DNA粗提與鑒定”實驗開出率的思考與探索[J];生物學教學;2017年02期

相關(guān)會議論文 前10條

1 劉冰;王旭;趙夢真;晁潔;樊春海;;基于DNA折紙術(shù)的納米金棒精密修飾[A];中國化學會第30屆學術(shù)年會摘要集-第二十八分會:化學生物學[C];2016年

2 劉冬生;李闖;程恩雋;邢永政;金娟;;DNA超分子水凝膠及其應用[A];中國化學會第30屆學術(shù)年會摘要集-第二十四分會:超分子組裝與軟物質(zhì)材料[C];2016年

3 Kaiying Cheng;Hong Xu;Xuanyi Chen;Liangyan Wang;Bing Tian;Ye Zhao;Yuejin Hua;;Structural basis for DNA 5′-end resection by RecJ[A];第五屆中國結(jié)構(gòu)生物學學術(shù)討論會摘要集[C];2016年

4 陳南迪;覃詩雅;羊小海;王青;翦立新;王柯敏;;“傳感-治療”的DNA納米裝置在協(xié)同殺傷循環(huán)腫瘤細胞的應用[A];中國化學會第30屆學術(shù)年會摘要集-第三十八分會:納米生物效應與納米藥物化學[C];2016年

5 劉曄華;陳錦艷;江雁;張堅磊;穆紅;;磁珠法提取金黃色葡萄球菌基因組DNA的評價[A];第七屆中國臨床微生物學大會暨微生物學與免疫學論壇論文匯編[C];2016年

6 譚磊;孫悅;周湘;劉偉;;多頭蚴核糖體DNA及線粒體DNA多態(tài)性研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學會獸醫(yī)寄生蟲學分會第十三次學術(shù)研討會論文集[C];2015年

7 葉俏;沈潔;嚴婷婷;王宙政;;原發(fā)性干燥綜合征患者血漿循環(huán)DNA與疾病活動相關(guān)性研究[A];2015年浙江省風濕病學學術(shù)年會論文匯編[C];2015年

8 周嘉嘉;FriederikeSchmid;;計算模擬研究DNA和聚電解質(zhì)的結(jié)合[A];2015年全國高分子學術(shù)論文報告會論文摘要集——主題E 高分子理論計算模擬[C];2015年

9 Yuan Zhang;Yanlong Chen;Gaigai Xu;Chen Lan;Shaige Xia;Wenjie Zhao;Shusheng Zhang;;Endogenous DNA adducts method establishment and Human Biomonitoring[A];河南省化學會2016年學術(shù)年會論文摘要集[C];2016年

10 孫覓;辛麗斐;劉宏;;基于濃差電池原理高靈敏檢測DNA的傳感器[A];中國化學會第30屆學術(shù)年會摘要集-第四分會:生物分析和生物傳感[C];2016年

相關(guān)重要報紙文章 前10條

1 黃辛;DNA骨架硫修飾研究又獲新成果[N];科學時報;2011年

2 本報記者 辛明;鄧亞軍:災難現(xiàn)場的DNA斗士[N];中國青年報;2011年

3 本報記者 歐陽曉紅 韓宋輝;“可怕”的友邦DNA 267億港元凈利從何而來[N];經(jīng)濟觀察報;2015年

4 深圳特區(qū)報首席記者 孫錦;解讀DNA惠及世界患癌兒童[N];深圳特區(qū)報;2018年

5 本報記者 陸成寬;DNA到底能不能預測外貌[N];科技日報;2018年

6 陸成寬;DNA到底能不能預測外貌[N];科學導報;2018年

7 記者 劉霞;人體細胞內(nèi)存在全新DNA結(jié)構(gòu)[N];科技日報;2018年

8 強天林 王佳樂;DNA存儲技術(shù):掌握信息控制權(quán)的利器[N];解放軍報;2018年

9 柯文;人體細胞內(nèi)存在全新DNA結(jié)構(gòu)[N];江蘇科技報;2018年

10 本報記者 秦珍子;是不是另一半,DNA說了算?[N];中國青年報;2014年

相關(guān)博士學位論文 前10條

1 袁瑩;一種間接標記的高靈敏度DNA電化學傳感器的研究[D];中國醫(yī)科大學;2018年

2 王琳;鐮孢菌DNA條形碼及多樣性研究[D];山西農(nóng)業(yè)大學;2017年

3 王倩倩;雙加氧酶Tet對DNA甲基化修飾的影響及相關(guān)調(diào)控機制研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學;2018年

4 王丹;DNA損傷應答中長非編碼RNA LRIK、ncRNA0301及蛋白質(zhì)XPF的功能研究[D];湖南大學;2018年

5 田茜;黃單胞菌屬DNA條形碼篩選及其重要致病變種檢測技術(shù)研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學院;2018年

6 吳成超;序列復雜度方法在DNA調(diào)控元件預測中的應用研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2018年

7 吳丹;CRISPR/C2c1的結(jié)構(gòu)與功能機制研究[D];哈爾濱工業(yè)大學;2017年

8 王泉博;基于卟啉及二維納米材料的DNA檢測新方法研究[D];南京大學;2015年

9 任克維;基于DNA組裝的電化學免疫分析及siRNA特異性運載[D];南京大學;2015年

10 周航;聚酰胺—聯(lián)吡啶及雙苯并咪唑與DNA相互作用及催化性能研究[D];北京化工大學;2017年

相關(guān)碩士學位論文 前10條

1 王從華;細胞應對DNA損傷調(diào)控機制的動力學分析[D];云南師范大學;2018年

2 田鶴楓;Fe_3O_4@Au納米復合材料的合成及對質(zhì)粒DNA的純化研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2015年

3 鄭悅;黃色粘球菌生物被膜中胞外DNA的整合機制與生物學功能[D];山東大學;2018年

4 李曉燕;表面活性劑對DNA空間結(jié)構(gòu)及其液晶態(tài)影響的研究[D];西北大學;2018年

5 鄭小芳;基于DNA三棱柱納米探針的生物傳感及分子邏輯計算研究[D];湖南大學;2017年

6 趙曉勇;鼠李糖陽離子脂質(zhì)體的合成與性能研究及功能性DNA固相合成試劑的設計與合成[D];湖南師范大學;2018年

7 任明;細胞內(nèi)尿嘧啶-DNA糖基化酶的超靈敏檢測研究[D];山東師范大學;2018年

8 嚴玉婷;富含鳥嘌呤DNA分子組裝及結(jié)構(gòu)的多樣性[D];吉林大學;2018年

9 張羚菲;鋅指蛋白WT1與DNA識別機制的分子動力學模擬研究[D];吉林大學;2018年

10 李永飛;無金屬緩沖體系開發(fā)及新型DNA模塊設計與組裝[D];合肥工業(yè)大學;2018年



本文編號:2781660

資料下載
論文發(fā)表

本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/huaxue/2781660.html


Copyright(c)文論論文網(wǎng)All Rights Reserved | 網(wǎng)站地圖 |

版權(quán)申明:資料由用戶5d451***提供,本站僅收錄摘要或目錄,作者需要刪除請E-mail郵箱bigeng88@qq.com