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超高效液相色譜-三重四極桿質(zhì)譜聯(lián)用檢測紅色糖多孢菌胞內(nèi)中間代謝物同位素豐度

發(fā)布時間:2019-09-28 21:56
【摘要】:采用超高效液相色譜-三重四極桿串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀(LC-MS/MS),建立了能精確檢測紅色糖多孢菌胞內(nèi)代謝物~(13)C同位素豐度的方法。在優(yōu)化的超高效液相色譜的條件及三重四極桿串聯(lián)質(zhì)譜的離子傳輸電壓和碰撞池電壓下,篩選出各胞內(nèi)代謝物的最佳離子對。根據(jù)物質(zhì)在LC-MS/MS中生成的母離子和子離子碳鏈長短及子離子是否含有~(13)C等特性,建立了"一對一"法、"一對多"法和單級質(zhì)譜SIM法等同位素豐度檢測方法。利用這些方法,檢測了自然標(biāo)記標(biāo)準(zhǔn)品和~(13)C標(biāo)記實(shí)驗(yàn)樣品,根據(jù)實(shí)驗(yàn)值與理論值的接近程度篩選出最優(yōu)方法。結(jié)果表明,對于以磷酸糖類為代表的子離子不含有~(13)C的代謝物,"一對一"法最有效;對于以有機(jī)酸類為代表的母離子和子離子都含有~(13)C的短碳鏈代謝物,"一對多"法更有優(yōu)勢;對于以輔酶A類為代表的母離子和子離子都含有~(13)C且碳鏈較長的代謝物,單級質(zhì)譜SIM法才能發(fā)揮作用。建立的同位素豐度檢測方法具有較好的準(zhǔn)確度,可應(yīng)用于紅色糖多孢菌胞內(nèi)代謝物同位素豐度的檢測,為后續(xù)研究菌體的代謝機(jī)理,實(shí)現(xiàn)紅霉素的高效表達(dá)奠定了基礎(chǔ)。
【圖文】:

原理圖,“一對一”,原理,母離子


圖1“一對一”法的原理。黑色圓代表碳原子帶13C標(biāo)記,白色圓代表碳原子不帶13C標(biāo)記Fig.1Principleofone-to-onemethod.Blackcirclesmeancarbonatomswith13Clabel,whitecirclesmeancar-bonatomswithout13Clabel2.5.2“一對多”法“一對多”法的原理如圖2,同樣以帶4個碳原子的母離子碰撞形成帶2個碳原子的子離子為例,當(dāng)母離子為M+2時,子離子可能是m+0、m+1、m+2,子離子的設(shè)定值為三者的中間值,降低Q3的分辨率,也就是增大Q3檢測的半高峰寬(FWHM),擴(kuò)大了Q3的檢測范圍,將3種情況一次性檢測出來。檢測帶4個碳原子的母離子需要的離子對有5個,等于母離子碳原子數(shù)加1,較“一對一”法有大幅度的減少!耙粚Χ唷狈ǖ脑O(shè)置如附錄2,掃描模式為SRM,負(fù)離子模式。由于MAL的母離子與子離子所含的碳原子數(shù)一樣,故母離子與子離子所帶的標(biāo)記信息一致,MAL不存在“一對多”法。2.5.3單級質(zhì)譜SIM方法單級質(zhì)譜SIM方法的設(shè)置如附錄3,F(xiàn)WHM設(shè)為0.3amu。2.6同位素豐度檢測方法的驗(yàn)證用Isopro軟件來計算胞內(nèi)代謝物自然標(biāo)記同位素豐度理論值,然后用建好的方法,進(jìn)樣標(biāo)準(zhǔn)品,得到實(shí)測值,將理論值與實(shí)測值對比,差距用殘差平方和(SSR)表示。在進(jìn)行標(biāo)記實(shí)驗(yàn)時,底物中標(biāo)記的葡萄糖經(jīng)過菌體代謝,會將13C轉(zhuǎn)移到胞內(nèi)代謝物的碳骨架上,圖2“一對多”法的原理,黑色圓代表碳原子帶13C標(biāo)記,白色圓代表碳原子不帶13C標(biāo)記。Fig.2Principleofmany-to-onemethod.Blackcirclesmeancarbonatomswith13Clabel,whitecirclesmeancarbonatomswithout13Clabel.當(dāng)同位素穩(wěn)態(tài)時,胞內(nèi)代謝物的FL值固定,將理論的FL值與實(shí)測的FL值對比,對方法進(jìn)行評估。FL=∑ni=0i·Min·∑ni=0Mi

碳原子,“一對多”,黑色,白色


圖1“一對一”法的原理。黑色圓代表碳原子帶13C標(biāo)記,白色圓代表碳原子不帶13C標(biāo)記Fig.1Principleofone-to-onemethod.Blackcirclesmeancarbonatomswith13Clabel,whitecirclesmeancar-bonatomswithout13Clabel2.5.2“一對多”法“一對多”法的原理如圖2,同樣以帶4個碳原子的母離子碰撞形成帶2個碳原子的子離子為例,當(dāng)母離子為M+2時,子離子可能是m+0、m+1、m+2,子離子的設(shè)定值為三者的中間值,降低Q3的分辨率,也就是增大Q3檢測的半高峰寬(FWHM),擴(kuò)大了Q3的檢測范圍,將3種情況一次性檢測出來。檢測帶4個碳原子的母離子需要的離子對有5個,等于母離子碳原子數(shù)加1,較“一對一”法有大幅度的減少!耙粚Χ唷狈ǖ脑O(shè)置如附錄2,掃描模式為SRM,負(fù)離子模式。由于MAL的母離子與子離子所含的碳原子數(shù)一樣,故母離子與子離子所帶的標(biāo)記信息一致,MAL不存在“一對多”法。2.5.3單級質(zhì)譜SIM方法單級質(zhì)譜SIM方法的設(shè)置如附錄3,F(xiàn)WHM設(shè)為0.3amu。2.6同位素豐度檢測方法的驗(yàn)證用Isopro軟件來計算胞內(nèi)代謝物自然標(biāo)記同位素豐度理論值,然后用建好的方法,進(jìn)樣標(biāo)準(zhǔn)品,得到實(shí)測值,將理論值與實(shí)測值對比,差距用殘差平方和(SSR)表示。在進(jìn)行標(biāo)記實(shí)驗(yàn)時,,底物中標(biāo)記的葡萄糖經(jīng)過菌體代謝,會將13C轉(zhuǎn)移到胞內(nèi)代謝物的碳骨架上,圖2“一對多”法的原理,黑色圓代表碳原子帶13C標(biāo)記,白色圓代表碳原子不帶13C標(biāo)記。Fig.2Principleofmany-to-onemethod.Blackcirclesmeancarbonatomswith13Clabel,whitecirclesmeancarbonatomswithout13Clabel.當(dāng)同位素穩(wěn)態(tài)時,胞內(nèi)代謝物的FL值固定,將理論的FL值與實(shí)測的FL值對比,對方法進(jìn)行評估。FL=∑ni=0i·Min·∑ni=0Mi
【作者單位】: 華東理工大學(xué)生物反應(yīng)器工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.21276081) 國家科技支撐項(xiàng)目(No.2011BAF02B05)資助~~
【分類號】:O657.63;TQ927

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本文編號:2543512

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