本文選題：阿爾茨海默癥 + 乙酰膽堿酯酶　； 參考：《無機化學(xué)學(xué)報》2017年11期

【摘要】：通過分子對接、分子動力學(xué)(MD)模擬以及成鍵自由能分析方法,從原子水平上模擬研究了3種1,7-二氮雜咔唑衍生物(分別記為M1、M2和M3)與ACh E的結(jié)合模式及相互作用機理,分析和討論了研究體系的靜電相互作用和范德華相互作用(vd W)。用MM-PBSA方法計算的3種抑制劑與ACh E之間的結(jié)合自由能與抑制劑的實驗生物活性數(shù)據(jù)(IC50值)相對應(yīng)。分析結(jié)果表明,殘基S286與抑制劑之間形成的氫鍵作用有利于抑制劑與ACh E之間的結(jié)合。范德華相互作用,尤其是抑制劑與關(guān)鍵殘基W279和Y334的作用,對抑制劑與ACh E之間的結(jié)合自由能有較大的貢獻,在區(qū)分抑制劑M1(或M2)和M3的生物活性上發(fā)揮著重要的作用。
[Abstract]:By means of molecular docking, molecular dynamics (MDD) simulation and bond free energy analysis, the binding modes and interaction mechanisms of three derivatives (M _ 1M _ 2 and M _ 3) with ach were simulated at atomic level. The electrostatic interaction and van der Waals interaction are analyzed and discussed. The binding free energy between the three inhibitors and ache calculated by the MM-PBSA method corresponds to the experimental bioactivity data (IC50) of the inhibitors. The results show that the hydrogen bond between S286 residue and inhibitor is favorable to the binding between the inhibitor and ache. Van der Waals interaction, especially the interaction of inhibitors with key residues W279 and Y334, contributes greatly to the binding free energy between inhibitors and ach, and plays an important role in distinguishing the biological activities of inhibitors M1 (or M2) and M3.
【作者單位】： 南京工業(yè)大學(xué)化工學(xué)院材料化學(xué)工程國家重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.21276122);國家自然科學(xué)基金重大研究計劃培育項目(No.91434109)資助
【分類號】：O626;TQ460.1

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本文編號：2028815