本文關(guān)鍵詞：生物多樣性信息學(xué)研究進(jìn)展，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

生物多樣性

生物多樣性 2010, 18 (5): 429–443

Biodiversity Science http: //http://www.wendangwang.com 生物多樣性信息學(xué)研究進(jìn)展

王利松1 陳 彬1 紀(jì)力強(qiáng)2 馬克平1*

1 (中國(guó)科學(xué)院植物研究所, 北京 100093) 2 (中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所, 北京 100101)

摘要: 生物多樣性信息學(xué)是一門(mén)蓬勃發(fā)展的新學(xué)科。它將現(xiàn)代的信息技術(shù)帶入生物多樣性及其相關(guān)學(xué)科的研究領(lǐng)域。它在生物多樣性基礎(chǔ)數(shù)據(jù)的數(shù)字化、模型工具和各種工具軟件的開(kāi)發(fā)、數(shù)據(jù)整合, 以及全球、地區(qū)和國(guó)家尺度生物多樣性信息網(wǎng)絡(luò)等多個(gè)方面的發(fā)展, 向我們展示了未來(lái)在全球范圍內(nèi)自由、免費(fèi)共享生物多樣性數(shù)據(jù)和信息, 以及人們行動(dòng)起來(lái)共同關(guān)注、調(diào)查與監(jiān)測(cè)野外生物多樣性的前景。目前, 已有大量數(shù)字化的物種編目、標(biāo)本館標(biāo)本、多媒體影像、研究文獻(xiàn)等生物多樣性基礎(chǔ)信息可以通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)檢索和利用。其中, 最值得關(guān)注的是一些成功的國(guó)際性研究項(xiàng)目, 如物種2000、全球生物多樣性信息網(wǎng)絡(luò)、生命條形碼以及網(wǎng)絡(luò)生命大百科全書(shū)。這些項(xiàng)目的成功不僅體現(xiàn)在對(duì)大量基礎(chǔ)信息和數(shù)據(jù)的發(fā)布, 而且它們通過(guò)與生物多樣性信息標(biāo)準(zhǔn)TDWG(Biodiversity In-formation Standards: TDWG)的合作, 推動(dòng)了達(dá)爾文核心標(biāo)準(zhǔn)(Darwin Core)等一些重要的生物多樣性信息標(biāo)準(zhǔn)的應(yīng)用, 以及地區(qū)和國(guó)家性生物多樣性信息節(jié)點(diǎn)的建立, 這些都為將來(lái)全球范圍生物多樣性信息的共享和數(shù)據(jù)交換奠定了重要基礎(chǔ)。在數(shù)字化信息的基礎(chǔ)上, 研究人員也開(kāi)發(fā)了一些在特定研究領(lǐng)域應(yīng)用的數(shù)據(jù)挖掘和模型工具, 例如基于數(shù)字化標(biāo)本的地理分布預(yù)測(cè)工具M(jìn)AXENT, 分類(lèi)學(xué)專(zhuān)家知識(shí)管理的LifeDesk。公民科學(xué)理念的發(fā)展則向我們展示了公眾和科學(xué)愛(ài)好者廣泛參與以互聯(lián)網(wǎng)為基礎(chǔ)的生物多樣性信息學(xué)研究活動(dòng)。因此, 生物多樣性信息學(xué)的發(fā)展前景廣闊, 它將為我們實(shí)現(xiàn)全球保護(hù)戰(zhàn)略目標(biāo), 應(yīng)對(duì)生物多樣性危機(jī), 解決全球氣候變化條件下生物多樣性資源管理和利用建立堅(jiān)實(shí)的信息基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞: 生物多樣性, 信息學(xué), 數(shù)據(jù)庫(kù), 物種, 標(biāo)本, 地理信息系統(tǒng)

Progress in Biodiversity Informatics

Lisong Wang1, Bin Chen1, Liqiang Ji2, Keping Ma1*

1 Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093 2 Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101

Abstract: Biodiversity Informatics is a young and rapidly growing field that brings information science and technologies to bear on the data and information generated by the study of biodiversity and related subjects. Recent years, biodiversity informatics community has made an extraordinary effort to digitize primary bio-diversity data, and develop modelling tools, data integration, and county/regional/global biodiversity net-works. In doing so, the community is creating an unprecedented global sharing of information and data pro-duced by biodiversity science, and encouraging people to consider, survey and monitor natural biodiversity. Due to success of several international biodiversity informatics projects, such as Species 2000, Global Bio-diversity Information Facility, Barcoding of Life and Encyclopedia of Life, digitized information on species inventories, herbarium specimens, multimedia and literature is available through internet. These projects not only make great contributions to sharing digitized biodiversity data, but also in prompting the implementa-tion of important biodiversity information standards, such as Darwin Core, and in the establishment of re-gional and national biodiversity networks. These efforts will facilitate the future establishment of a strong information infrastructure for data sharing and exchange at a global scale. Besides focusing on browsing and searching digitized data, scientists should also work on building data mining and modeling, such as MAX-—————————————————— 收稿日期: 2010-04-19; 接受日期: 2010-05-30

基金項(xiàng)目: 中國(guó)科學(xué)院信息化專(zhuān)項(xiàng)項(xiàng)目(INFO-115-C01-SDB1-02)和國(guó)家自然科學(xué)基金(No. 30800057) * 通訊作者 Author for correspondence. E-mail: kpma@

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