本文關(guān)鍵詞：RYBP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系

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【摘要】：目的肺癌是當(dāng)今世界范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤之一,其死亡率位居于惡性腫瘤之首。目前非小細(xì)胞肺癌(Non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)占全部肺癌的80%左右,總體的五年生存率較低(大約16%)。除了環(huán)境因素,越來越多的研究表明遺傳因素在肺癌的易感性和預(yù)后中起到了重要作用。非小細(xì)胞肺癌的主要治療手段是通過外科手術(shù)治療輔助以新輔助化療、放射治療、輔助化療、和靶向治療等多種方式。盡管這些年醫(yī)學(xué)界在非小細(xì)胞肺癌的早期診斷、根治術(shù)式、輔助化療、放射化療和靶向治療等方面取得了一定的發(fā)展,但是非小細(xì)胞肺癌的發(fā)病率和死亡率依然居高不下,因此,尋找非小細(xì)胞肺癌新的診斷與治療靶點(diǎn),是一項非常重要且有實驗室和臨床意義的工作。RYBP是近年新識別的多梳蛋白(Pc G)家族成員,除了參與Pc G抑制復(fù)合物1(PRC1)的組成和抑制逆轉(zhuǎn)錄功能外,還與細(xì)胞凋亡和侵襲有關(guān)。截至目前RYBP在腫瘤領(lǐng)域的研究不多而且存在矛盾,作為新的候選抑癌基因,其臨床意義有待闡明。在本研究中,我們以Tag SNP結(jié)合潛在功能學(xué)SNP為選點(diǎn)策略,通過病例-對照研究設(shè)計和前瞻性隊列研究設(shè)計探討RYBP基因多態(tài)性的改變與非小細(xì)胞肺癌遺傳易感性、預(yù)后之間的關(guān)聯(lián),確定真正有意義的SNP位點(diǎn),并確定RYBP m RNA和蛋白表達(dá)與SNP的關(guān)系,再用TCGA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行驗證分析,以期為非小細(xì)胞肺癌的三級預(yù)防提供科學(xué)依據(jù),為合理的臨床決策和個體化治療提供線索。方法1.在天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院分子流行病學(xué)研究平臺中選取原發(fā)性非小細(xì)胞肺癌603例,社區(qū)來源的按照性別、年齡匹配正常對照661例。采用雙盲法,由專業(yè)人員進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查。2.利用生物信息學(xué)技術(shù),篩選出RYBP基因的多態(tài)位點(diǎn),進(jìn)行連鎖不平衡位點(diǎn)預(yù)測,應(yīng)用Taq Man基因分型技術(shù)檢測SNP位點(diǎn)基因型。通過比較病例組和對照組基因型分布頻率的差別,計算各種基因型所致非小細(xì)胞肺癌的相對危險度,分析RYBP基因SNP與非小細(xì)胞肺癌發(fā)病、預(yù)后的關(guān)系。分別用組織芯片技術(shù)和實時定量PCR技術(shù)測量蛋白的表達(dá)和m RNA的表達(dá)情況。3.所有數(shù)據(jù)采用SPSS統(tǒng)計軟件包(Version 19.0,SPSS Inc.,Chicago,IL,USA)和Graphpad Prism 5.0(Graphpad Software Inc,La Jolla,CA)進(jìn)行統(tǒng)計分析。病例組和對照組的一般人口學(xué)特征、主要環(huán)境因素、研究對象基因型的比較采用χ2檢驗。NSCLC危險因素分析分別應(yīng)用單因素和多因素的非條件Logistic回歸分析估計危險度(Odds Ratio,OR),調(diào)整OR值(Adjusted Odds Ratio,ORa)及其95%置信區(qū)間(95%Confidence Intervals,95%CI)。以Kaplan-Meier方法繪制生存曲線并以Log-rank法檢驗生存時間之間的差異。單因素和多因素Cox回歸計算風(fēng)險回歸比例(Hazard Ratio,HR),調(diào)整HR值(Adjusted Hazard Ratio,HRa)及其95%置信區(qū)間分析各種因素對非小細(xì)胞肺癌預(yù)后的影響。全部檢驗均為雙側(cè)檢驗,檢驗水準(zhǔn)α=0.05,P0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。結(jié)果1、RYBP rs4676875,RYBP rs12631820,RYBP rs2118593,RYBP rs4677152基因多態(tài)性與降低非小細(xì)胞肺癌發(fā)病的危險性有關(guān)。2、分層分析發(fā)現(xiàn),rs4676875位點(diǎn)和男性、年齡≤60、年齡60、無吸煙史與無腫瘤家族史的NSCLC發(fā)病相關(guān);rs12631820位點(diǎn)和男性、年齡≤60、年齡60、無吸煙史與無腫瘤家族史的NSCLC發(fā)病相關(guān);rs2118593位點(diǎn)和男性、女性、年齡≤60、年齡60、無吸煙史、有吸煙史與無腫瘤家族史的NSCLC發(fā)病相關(guān);rs4677152和男性、年齡≤60、年齡60、無吸煙史、有腫瘤家族史與無腫瘤家族史的NSCLC發(fā)病相關(guān);rs17009699和男性、年齡≤60與無腫瘤家族史的NSCLC發(fā)病相關(guān)�；蛭稽c(diǎn)-位點(diǎn)聯(lián)合作用分析表明,與不攜帶保護(hù)型的個體相比,攜帶高保護(hù)基因型的數(shù)量多達(dá)到3個位點(diǎn)時,NSCLC的患病風(fēng)險減少了91%(OR=0.09,95%CI:0.03-0.27)。3、RYBP位點(diǎn)rs4676875、rs12631820、rs2118593、rs4677152、rs12956、rs17009699基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后無關(guān)(P0.05)。4、分層分析發(fā)現(xiàn),RYBP位點(diǎn)rs4676875與BMI24非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后相關(guān);rs12631820與BMI24非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后相關(guān);rs2118593與臨床Ⅰ+Ⅱ期的非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后相關(guān);rs4677152與女性、腺癌的非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后相關(guān)。5、在女性組中RYBP rs2118593的基因型與RYBP m RNA的表達(dá)相關(guān)(P0.05)。RYBP rs2118593的基因型與RYBP基因TMA得分相關(guān)(P0.05)。6、TCGA數(shù)據(jù)庫中RYBP在NSCLC中的平均表達(dá)水平低于癌旁組織(P0.05)。結(jié)論1、RYBP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌發(fā)病相關(guān)。2、RYBP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌預(yù)后相關(guān)。3、RYBP基因多態(tài)性與RYBP m RNA和蛋白表達(dá)相關(guān)。
【關(guān)鍵詞】：非小細(xì)胞肺癌 RYBP 單核苷酸多態(tài)性 遺傳易感性 預(yù)后
【學(xué)位授予單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R734.2
【目錄】：

• 中文摘要4-7
• Abstract7-12
• 縮略語/符號說明12-14
• 前言14-20
• 研究現(xiàn)狀、成果14-18
• 研究目的、方法18-20
• 一、RYBP基因SNP與NSCLC發(fā)病的關(guān)系20-44
• 1.1 對象和方法20-29
• 1.1.1 研究對象20-22
• 1.1.2 實驗方法22-29
• 1.1.3 統(tǒng)計分析29
• 1.2 結(jié)果29-40
• 1.2.1 研究對象的基本情況29-30
• 1.2.2 RYBP基因相關(guān)位點(diǎn)的SNP與NSCLC易感性的分析30-40
• 1.3 討論40-43
• 1.3.1 非小細(xì)胞肺癌與環(huán)境因素的易感性40-41
• 1.3.2 RYBP基因多態(tài)性與NSCLC發(fā)病的相關(guān)性41-42
• 1.3.3 RYBP基因位點(diǎn)-位點(diǎn)聯(lián)合作用的分析42-43
• 1.4 小結(jié)43-44
• 二、RYBP基因SNP與NSCLC預(yù)后的關(guān)系44-57
• 2.1 對象和方法44-46
• 2.1.1 研究對象44-45
• 2.1.2 實驗方法45
• 2.1.3 統(tǒng)計分析45-46
• 2.2 結(jié)果46-54
• 2.2.1 研究對象的一般特征描述46-47
• 2.2.2 RYBP基因SNP與NSCLC患者總體生產(chǎn)率的關(guān)系47-48
• 2.2.3 相關(guān)因素分層分析RYBP基因的SNP與NSCLC預(yù)后的關(guān)系48-54
• 2.3 討論54-55
• 2.4 小結(jié)55-57
• 三、RYBP表達(dá)與SNP關(guān)系及其在TCGA中的研究57-66
• 3.1 對象和方法57-58
• 3.1.1 研究對象57
• 3.1.2 實驗方法57-58
• 3.1.3 統(tǒng)計分析58
• 3.2 結(jié)果58-64
• 3.2.1 RYBP mRNA的表達(dá)與SNP的表達(dá)58-61
• 3.2.2 RYBP基因TMA得分與SNP的關(guān)系61
• 3.2.3 TCGA中RYBP在癌與癌旁的表達(dá)及其與NSCLC預(yù)后的關(guān)系61-63
• 3.2.4 SNP的功能預(yù)測63-64
• 3.3 討論64-65
• 3.4 小結(jié)65-66
• 結(jié)論66-67
• 參考文獻(xiàn)67-76
• 發(fā)表論文和參加科研情況說明76-77
• 綜述 PcG蛋白復(fù)合體與癌癥77-96
• 綜述參考文獻(xiàn)87-96
• 致謝96-97
• 個人簡歷97

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 Wanqing Chen;Rongshou Zheng;Siwei Zhang;Ping Zhao;Hongmei Zeng;Xiaonong Zou;Jie He;;Annual report on status of cancer in China,2010[J];Chinese Journal of Cancer Research;2014年01期

2 Wanqing Chen;Rongshou Zheng;Siwei Zhang;Ping Zhao;Guanglin Li;Lingyou Wu;Jie He;;Report of incidence and mortality in China cancer registries, 2009[J];Chinese Journal of Cancer Research;2013年01期

3 陳萬青;張思維;鄒小農(nóng);;中國肺癌發(fā)病死亡的估計和流行趨勢研究[J];中國肺癌雜志;2010年05期

4 Dasari Vasanthi;Rakesh K Mishra;;Epigenetic regulation of genes during development: A conserved themefrom flies to mammals[J];遺傳學(xué)報;2008年07期

5 劉民培,吳祖澤;腫瘤基因的一種新的功能分類與概念[J];中國腫瘤臨床;2004年21期

6 高豐,張學(xué),宋今丹;p53家族新成員研究進(jìn)展[J];國外醫(yī)學(xué).遺傳學(xué)分冊;2000年02期

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本文編號：998119