本文關(guān)鍵詞：腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1（MTA1）對mRNA可變剪接調(diào)控的作用研究

  更多相關(guān)文章： 轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1 可變剪接 高通量測序

【摘要】：目的mRNA可變剪接是高等生物生命活動復(fù)雜性和多樣性的基礎(chǔ)。目前對mRNA轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的研究尚處于初期階段。我們的研究顯示轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1(MTA1)結(jié)合了大量RNA調(diào)控蛋白,在nRNA轉(zhuǎn)錄至翻譯全過程的各個(gè)部位均有分布(核仁一核膜一胞漿—核糖體——RNA顆粒)�；谝陨暇�索,我們擬探索MTA1在]mRNA剪接調(diào)控中的作用及這一機(jī)制帶來的下游生物學(xué)表型改變,從而更清晰的了解MTA1在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中的作用。方法采用大數(shù)據(jù)分析明確MTA1是否參與mRNA剪接調(diào)控過程；利用分子生物學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)方法聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)技術(shù)確定MTA1對轉(zhuǎn)錄組可變剪接的影響；采用紫外交聯(lián)免疫共沉淀聯(lián)合高通量測序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing, CLIP-seq)技術(shù)及可獲得的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)分析MTA1對mRNA進(jìn)行剪接加工的可能機(jī)制及基序；利用多層次組學(xué)分析聯(lián)合免疫互作技術(shù)明確MTA1在mRNA剪接加工中的生物學(xué)功能和分子機(jī)制。結(jié)果大數(shù)據(jù)分析結(jié)果表明MTA1在多種類型腫瘤的RNA剪接過程中發(fā)揮調(diào)控功能；RNA-seq獲得MTA1調(diào)控下的mRNA可變剪接譜,顯示MTA1具有比較廣泛的mRNA可變剪接調(diào)控作用；CLIP-seq獲得與MTA1相互作用的mRNA譜,顯示MTA1具有廣泛的RNA結(jié)合能力；多層次組學(xué)分析聯(lián)合免疫互作技術(shù)篩選MTA1在RNA可變剪接調(diào)控中的關(guān)鍵相關(guān)分子,結(jié)果顯示PTBP1與MTA1在mRNA剪接調(diào)控過程中具有協(xié)同作用。結(jié)論MTA1是一個(gè)RNA結(jié)合蛋白,在多種類型的腫瘤中具有mRNA剪接調(diào)控功能,MTA1對轉(zhuǎn)錄組的可變剪接狀態(tài)也有比較廣泛的影響。在MTA1調(diào)控下產(chǎn)生可變剪接的基因,其功能涉及到細(xì)胞周期、代謝調(diào)控、大分子轉(zhuǎn)運(yùn)、RNA剪接等領(lǐng)域。MTAl很可能以間接結(jié)合pre-mRNAs的方式廣泛調(diào)控基因的可變剪接模式,該過程的實(shí)現(xiàn)部分依賴于PTBP1分子。
【關(guān)鍵詞】：轉(zhuǎn)移相關(guān)基因1 可變剪接 高通量測序
【學(xué)位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R730.2
【目錄】：

• 中英文縮略詞對照5-7
• 中文摘要7-8
• Abstract8-9
• 前言9-12
• 材料與方法12-29
• 結(jié)果29-57
• 討論57-62
• 結(jié)論62-63
• 參考文獻(xiàn)63-66
• 基金資助66-67
• 已發(fā)表文章67-68
• 文獻(xiàn)綜述68-75
• 參考文獻(xiàn)71-75
• 致謝75-76

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本文編號：842900