發(fā)布時間：2017-09-09 12:21

  本文關(guān)鍵詞：卵巢上皮性癌多藥耐藥與DNA甲基化關(guān)系的研究

  更多相關(guān)文章： DNA甲基化 卵巢癌 耐藥 細(xì)胞凋亡 DNA甲基化 卵巢癌 耐藥 生物信息學(xué)分析 卵巢癌 多藥耐藥 DNA甲基化 薈萃分析 DNA甲基化 卵巢癌 耐藥 芯片 臨床驗證

【摘要】：卵巢癌是嚴(yán)重威脅女性健康的疾病,死亡率居婦科惡性腫瘤之首。多藥耐藥是卵巢癌患者術(shù)后化療失敗主要原因,而DNA甲基化則是卵巢癌多藥耐藥調(diào)控的重要機(jī)制。因此,全面了解DNA甲基化對卵巢癌及卵巢癌多藥耐藥的調(diào)控機(jī)制對于卵巢癌治療和預(yù)后具有重要意義。通過PUMMED數(shù)據(jù)庫檢索,本文共提取了27個與卵巢癌多藥耐藥調(diào)控顯著相關(guān)的DNA甲基化基因,系統(tǒng)整合分析了這些基因甲基化水平改變對卵巢癌耐藥的影響及其分子調(diào)控機(jī)制。在所有27個基因中,至少一半以上的DNA甲基化基因直接或間接的通過調(diào)控細(xì)胞凋亡信號通路響應(yīng)耐藥調(diào)控,說明該信號通路可能是DNA甲基化基因行使其耐藥生物學(xué)功能的主要方式。另外,本文還綜合分析了這27個卵巢癌耐藥相關(guān)甲基化基因與臨床惡性行為及預(yù)后的關(guān)系,結(jié)果表明上述基因主要與不良預(yù)后相關(guān)。綜上,本文整合性分析了已報道的27個DNA甲基化基因與卵巢癌耐藥之間的潛在關(guān)系,這對于我們深入了解DNA甲基化對卵巢癌耐藥的調(diào)控,及卵巢癌治療和提高卵巢癌的預(yù)后具有一定的指導(dǎo)意義。目的：通過綜合已有研究和生物信息學(xué)分析整體性研究DNA甲基化對卵巢癌多藥耐藥的調(diào)控。方法：通過PUMMED數(shù)據(jù)庫檢索提取已報道的與卵巢癌耐藥調(diào)控相關(guān)的DNA甲基化基因。通過DAVID,Coremine Medical及String等工具進(jìn)行生物學(xué)過程富集與注釋及基因/蛋白互作等生物信息學(xué)分析。結(jié)果：共篩選出27個與卵巢癌多藥耐藥調(diào)控顯著相關(guān)的DNA甲基化基因,并系統(tǒng)整合了這些基因甲基化水平的改變對卵巢癌耐藥的調(diào)控機(jī)制。蛋白互作結(jié)果顯示這27個甲基化基因中至少有20個存在于蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中,說明它們存在彼此互作,在功能上具有相關(guān)性,可能作為一個整體參與卵巢癌耐藥調(diào)控。其中PTEN與至少一半的其它基因存在直接互作,說明其在上述基因中可能具有核心調(diào)控功能。生物學(xué)過程富集與注釋表明上述DNA甲基化基因大多與細(xì)胞凋亡顯著相關(guān),可能是這些基因參與卵巢癌多藥耐藥調(diào)控的重要途徑。結(jié)論：本文從整體性角度初步解釋了DNA甲基化基因與卵巢癌耐藥之間的潛在關(guān)系,這對于我們深入了解甲基化基因?qū)β殉舶┠退幍恼{(diào)控作用,及治療卵巢癌和提高卵巢癌的預(yù)后具有一定的指導(dǎo)意義。目的：結(jié)腸腺瘤樣息肉病基因APC屬于腫瘤抑制基因。其基因的失活在卵巢癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著關(guān)鍵的作用。許多研究討論了關(guān)于APC基因甲基化與卵巢癌的關(guān)系,我們進(jìn)行了meta分析更進(jìn)一步確認(rèn)APC基因與卵巢癌之間的關(guān)系。方法：我們使用一些搜索軟件如PUBMED、EMBASE、Web of science及CNKI數(shù)據(jù)庫搜索相關(guān)文獻(xiàn),納入研究。并使用STATE11.01軟件進(jìn)行RR風(fēng)險值、異質(zhì)性及發(fā)表性偏倚的相關(guān)的統(tǒng)計學(xué)分析。結(jié)果：9篇文獻(xiàn)被納入該meta分析中,其中包括641個卵巢癌的病人及377個對照組病例。統(tǒng)計學(xué)結(jié)果表明：總病例組與總對照組OR=6.19,95%CI：4.08—9.41,P0.05。腫瘤組織與正常組織合并的OR=5.88,95%CI.3.662—9.450,P0.05。腫瘤組織與良性組織OR=6.99,95%CI：3.124—15.645,P0.05。結(jié)論：此結(jié)果表明APC基因的甲基化與卵巢癌之間有密切的關(guān)系。目的：本研究使用甲基化芯片檢測多組卵巢組織基因組DNA的差異甲基化位點(diǎn),并且采用基因通過富集分析的方法篩選出與卵巢癌多藥耐藥相關(guān)的差異生物學(xué)通路及其所包含的差異甲基化基因。方法：采用450K Infinium Methylation BeadChip芯片,檢測54例卵巢上皮癌耐藥組織、54例敏感組織、54例卵巢良性腫瘤和54例正常卵巢組織的差異甲基化位點(diǎn)獲得卵巢上皮癌耐藥組和敏感組Beta score值差異大于1倍的上調(diào)或下調(diào)的DNA。運(yùn)用GO分析和Pathway通路富集等生物信息學(xué)方法分析差異表達(dá)DNA潛在的生物學(xué)功能和參與的信號通路。用QRT-PCR驗證芯片結(jié)果,檢測差異甲基化的表達(dá)情況,并分析差異甲基化基因表達(dá)水平與臨床病理因素關(guān)系。結(jié)果：DNA芯片篩選出于卵巢上皮癌多藥耐藥相關(guān)差異化甲基化位點(diǎn)7263個差異化甲基化位點(diǎn),其中涵蓋2654個基因。耐藥組織中甲基化程度較敏感組升高位點(diǎn)有6051個,基因2162個,甲基化程度較敏感組降低位點(diǎn)有1212個,基因452個,其中差異甲基化發(fā)生在啟動子區(qū)的有1058個基因,發(fā)生在轉(zhuǎn)錄起始5'UTR區(qū)的基因有305個。生物信息學(xué)分析這些差異甲基化基因主要參與了腫瘤途徑、黏附、雌激素信號通路、ECM-受體相互作用、P13K-AKT信號通路、ErbB信號通路、子宮內(nèi)膜癌、白細(xì)胞跨內(nèi)皮遷移、擴(kuò)張性心肌病等信號通路。我們選取了差異顯著的高甲基化基因PIK3R3和LAMA3做了QRT-PCR對芯片結(jié)果做了臨床驗證,PIK3R3和LAMA3基因表達(dá)耐藥組較敏感組下調(diào),擴(kuò)大臨床樣本驗證亦得到了一致的結(jié)果,其中PIK3R3和LAMA3基因在卵巢癌耐藥組織中分別下調(diào)1.56倍、1.87倍,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論：利用基因芯片篩選出了跟卵巢上皮癌多藥耐藥相關(guān)的差異的甲基化位點(diǎn)及基因,豐富了目前已知的跟耐藥相關(guān)的靶基因數(shù)據(jù)。后期需要進(jìn)一步研究差異甲基化基因參與卵巢上皮癌耐藥發(fā)生的相關(guān)分子機(jī)制及其與臨床各因素的關(guān)系。
【關(guān)鍵詞】：DNA甲基化 卵巢癌 耐藥 細(xì)胞凋亡 DNA甲基化 卵巢癌 耐藥 生物信息學(xué)分析 卵巢癌 多藥耐藥 DNA甲基化 薈萃分析 DNA甲基化 卵巢癌 耐藥 芯片 臨床驗證
【學(xué)位授予單位】：廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R737.31
【目錄】：

• 個人簡歷3-7
• 致謝7-8
• 中英文主要縮寫略語列表8-9
• 第一章 DNA甲基化與卵巢上皮癌多藥耐藥及臨床惡性行為的關(guān)系9-11
• 摘要9-10
• Abstract10-11
• 第二章 卵巢卵巢上皮癌多藥耐藥相關(guān)DNA甲基化基因及其生物信息學(xué)分析11-14
• 摘要11-12
• Abstract12-14
• 第三章 DNA甲基化基因APC與卵巢上皮癌關(guān)系薈萃分析14-16
• 摘要14-15
• Abstract15-16
• 第四章 卵巢上皮癌多藥耐藥運(yùn)用全基因組DNA甲基化芯片篩選、鑒定及臨床驗證16-20
• 摘要16-18
• Abstract18-20
• 第一章 DNA甲基化與卵巢上皮癌多藥耐藥及臨床惡性行為的關(guān)系20-38
• 前言20-21
• 1 卵巢癌耐藥相關(guān)DNA甲基化基因的數(shù)據(jù)挖掘和耐藥機(jī)制分析21-25
• 2 DNA甲基化基因與卵巢癌預(yù)后及卵巢癌耐藥逆轉(zhuǎn)25-30
• 3 結(jié)語30-31
• 參考文獻(xiàn)31-38
• 第二章 卵巢卵巢上皮癌多藥耐藥相關(guān)DNA甲基化基因及其生物信息學(xué)分析38-48
• 前言38
• 1 研究方法38-39
• 1.1 基因檢索38
• 1.2 對基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析38-39
• 2 結(jié)果39-43
• 2.1 DNA甲基化基因?qū)β殉舶┒嗨幠退幷{(diào)控的綜合分析39-40
• 2.2 生物學(xué)過程富集40
• 2.3 27個甲基化基因蛋白的互作分析40-43
• 3 討論43-44
• 4 總結(jié)44-46
• 參考文獻(xiàn)46-48
• 第三章 DNA甲基化基因APC與卵巢上皮癌關(guān)系薈萃分析48-60
• 前言48
• 1 材料與方法48-50
• 1.1 搜索方法和研究選擇48-49
• 1.2 數(shù)據(jù)提取和質(zhì)量評估49-50
• 1.3 統(tǒng)計方法50
• 2 結(jié)果50-52
• 2.1 研究特點(diǎn)及方法評估50-51
• 2.2 NOS的評價結(jié)果51-52
• 3 APC基因的甲基化和卵巢癌的Meta分析結(jié)果52-57
• 3.1 APC基因在各組之間的甲基化52-55
• 3.2 敏感性分析55
• 3.3 發(fā)表偏倚55-57
• 4 討論57-59
• 參考文獻(xiàn)59-60
• 第四章 卵巢上皮癌多藥耐藥運(yùn)用全基因組DNA甲基化芯片篩選、鑒定及臨床驗證60-118
• 前言60
• 1 材料60-63
• 1.1 臨床標(biāo)本60-61
• 1.2 主要試劑61-62
• 1.3 實驗儀器設(shè)備62
• 1.4 實驗器材的處理62-63
• 2 實驗方法和步驟63-68
• 2.1 組織樣本DNA提取63-64
• 2.2 DNA定量,純度及完整性檢測64
• 2.3 DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化64-66
• 2.4 芯片雜交、甲基化位點(diǎn)掃描及數(shù)據(jù)分析66
• 2.5 基因甲基化芯片的臨床驗證66-68
• 3 結(jié)果68-106
• 3.1 組織樣本各臨床病理資料對比分析結(jié)果68
• 3.2 基因組DNA純度及完整度檢測68-69
• 3.3 標(biāo)本RNA純度及完整度檢測69
• 3.4 基因芯片69-89
• 3.5 結(jié)合SNP芯片結(jié)果篩選出SNP和DNA甲基化相關(guān)聯(lián)的基因89-92
• 3.6 敏感組和耐藥組間甲基化差異顯著的基因PIK3R3、LAMA3、ITGB6、NCALD與卵巢癌臨床各因素的關(guān)系92-104
• 3.7 PIK3R3及LAMA3在敏感組及耐藥組中的臨床驗證104-106
• 4 討論106-113
• 參考文獻(xiàn)113-118
• 全文小結(jié)118-119
• 本課題創(chuàng)新之處119-120
• 本課題不足之處120-121
• 碩士學(xué)位攻讀期間發(fā)表的論文121-122
• 附件122-130

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 車艷辭,姚勤,戴淑真,羅兵,王言奎;子宮內(nèi)膜癌和卵巢上皮性癌PTEN基因突變及其蛋白表達(dá)的意義[J];中華婦產(chǎn)科雜志;2002年10期

，

本文編號：820411