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ERAP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌發(fā)生發(fā)展的相關(guān)性研究

發(fā)布時(shí)間:2017-09-08 19:06

  本文關(guān)鍵詞:ERAP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌發(fā)生發(fā)展的相關(guān)性研究


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【摘要】:背景肺癌是一種嚴(yán)重威脅人類健康的惡性腫瘤,全球肺癌的發(fā)病率及死亡率一直呈持續(xù)上升趨勢(shì)。非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占所有肺癌的80%以上。內(nèi)源性抗原肽的加工提呈過程在機(jī)體的抗腫瘤免疫應(yīng)答中發(fā)揮著重要作用。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨肽酶(endoplasmic reticulum aminopeptidase, ERAP)是抗原提呈過程中的一個(gè)重要蛋白分子:在細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,ERAP蛋白將多肽抗原修剪到合適長(zhǎng)度,使其能夠結(jié)合到人類白細(xì)胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)Ⅰ類分子上,形成HLAI類分子-抗原肽復(fù)合物,隨后呈遞到細(xì)胞表面被T細(xì)胞識(shí)別,產(chǎn)生特定的免疫應(yīng)答反應(yīng)。ERAP基因的單核苷酸多態(tài)(single nucleotide polymorphism,SNP)可影響抗原提呈過程,最終導(dǎo)致疾病的發(fā)生及轉(zhuǎn)歸有所差異。目前對(duì)于ERAP1基因的研究主要集中于強(qiáng)直性脊柱炎等自身免疫性疾病,對(duì)于ERAP2基因的研究較少。ERAP基因多態(tài)性是否會(huì)通過影響抗原提呈途徑,從而與非小細(xì)胞性肺癌的患病風(fēng)險(xiǎn)具有相關(guān)性,有待于進(jìn)一步探討。本實(shí)驗(yàn)對(duì)ERAP1、ERAP2基因與非小細(xì)胞性肺癌發(fā)生發(fā)展的相關(guān)性進(jìn)行研究,為進(jìn)一步研究抗原提呈通路相關(guān)基因在機(jī)體抗腫瘤免疫中的作用奠定基礎(chǔ)。方法以云南地區(qū)漢族人群中非小細(xì)胞肺癌患者342例、健康對(duì)照組324例為研究對(duì)象,采用Taq Man探針基因分型方法對(duì)ERAP1基因4個(gè)SNP位點(diǎn)rs27044、 rs30187、rs26653、rs26618和ERAP2基因2個(gè)SNP位點(diǎn)rs2549782. rs2248374進(jìn)行基因分型,并構(gòu)建單倍型,研究評(píng)估ERAP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生發(fā)展的相關(guān)性。結(jié)果(1)病例組和對(duì)照組ERAP1基因的四個(gè)SNP位點(diǎn).ERAP2基因的兩個(gè)SNP位點(diǎn)基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡,實(shí)驗(yàn)所選擇的人群具有代表性;(2)ERAP1基因rs27044、rs30187、rs26618和rs26653的基因型和等位基因頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);rs27044/rs30187/rs26618/rs26653-CCCG、GCTC、 GTTC單倍型頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);(3)ERAP2基因rs2248374的等位基因頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),rs2549782的基因型和等位基因頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),rs2248374/rs2549782-AG、GT單倍型頻率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);(4) ERAP1基因的四個(gè)SNP位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率分布在腺癌和鱗癌患者中無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,在Ⅰ、Ⅱ期和Ⅲ、Ⅳ期非小細(xì)胞肺癌患者中也無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);(5)ERAP2基因的兩個(gè)SNP位點(diǎn)的等位基因頻率在腺癌和鱗癌患者中有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),在Ⅰ、Ⅱ期和Ⅲ、Ⅳ期非小細(xì)胞肺癌患者中無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。結(jié)論ERAP基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生具有相關(guān)性,ERAP1基因rs27044/rs30187/rs26618/rs26653-CCCG、GCTC單倍型可能增加非小細(xì)胞肺癌的患病風(fēng)險(xiǎn),而GTTC單倍型可能具有保護(hù)性作用;ERAP2基因rs2248374/rs2549782-AG單倍型可能增加非小細(xì)胞肺癌的患病風(fēng)險(xiǎn),而GT單倍型可能具有保護(hù)性作用;ERAP2基因rs2248374、rs2549782兩個(gè)位點(diǎn)可能與非小細(xì)胞肺癌的病理類型有關(guān)。
【關(guān)鍵詞】:非小細(xì)胞肺癌 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨肽酶基因 單核苷酸多態(tài)性 關(guān)聯(lián)研究
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R734.2
【目錄】:
  • 摘要5-7
  • Abstract7-9
  • 前言9-13
  • 1、肺癌概述9
  • 2、抗原提呈通路相關(guān)基因及內(nèi)源性抗原加工提呈的機(jī)制9-11
  • 3、ERAP基因與非小細(xì)胞肺癌11-13
  • 實(shí)驗(yàn)材料和方法13-19
  • (一) 實(shí)驗(yàn)材料13-14
  • 1、實(shí)驗(yàn)對(duì)象13
  • 2、主要試劑13
  • 3、主要儀器13-14
  • (二) 實(shí)驗(yàn)方法14-19
  • 1、臨床資料收集14
  • 2、血液標(biāo)本采集14
  • 3、DNA的提取及定量14-16
  • 4、基因分型16-18
  • 5、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理18-19
  • 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析19-35
  • (一) 研究對(duì)象的一般資料19
  • (二) TaqMan-MGB探針探針基因分型結(jié)果19-35
  • 1、各SNP位點(diǎn)分型結(jié)果19-23
  • 2、病例組和對(duì)照組ERAP1、ERAP2基因的Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)23-24
  • 3、ERAP1基因多態(tài)性位點(diǎn)在病例組與對(duì)照組中的等位基因頻率和基因型頻率24
  • 4、ERAP1基因在病例組和對(duì)照組中4個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的連鎖不平衡分析24-27
  • 5、病例組與對(duì)照組中ERAP1基因多態(tài)性位點(diǎn)單倍型頻率統(tǒng)計(jì)分析27
  • 6、ERAP1基因多態(tài)性位點(diǎn)與非小細(xì)胞肺癌相關(guān)臨床參數(shù)的關(guān)系27-30
  • 7、ERAP2基因多態(tài)性位點(diǎn)在病例組與對(duì)照組中的等位基因頻率和基因型頻率30
  • 8、ERAP2基因在病例組和對(duì)照組中2個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的連鎖不平衡分析30-32
  • 9、病例組與對(duì)照組中ERAP2基因多態(tài)性位點(diǎn)單倍型頻率統(tǒng)計(jì)分析32
  • 10、ERAP2基因多態(tài)性位點(diǎn)與非小細(xì)胞肺癌相關(guān)臨床參數(shù)的關(guān)系32-35
  • 討論35-40
  • 小結(jié)與展望40-41
  • 參考文獻(xiàn)41-44
  • 論文綜述44-53
  • 參考文獻(xiàn)49-53
  • 附錄53-55
  • 致謝55-56
  • 研究生簡(jiǎn)歷56-57

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 鮑文華;劉忠鑫;劉磊;;MMP-7和PTEN在非小細(xì)胞肺癌的表達(dá)及其意義[J];黑龍江醫(yī)藥科學(xué);2011年02期

2 郝建華;黃云超;任宏軒;陳楊;郝曦;石青萍;肖義澤;;1973—2005年肺癌高發(fā)地區(qū)肺癌死亡趨勢(shì)的分析[J];中國(guó)全科醫(yī)學(xué);2009年24期

3 虢毅;鄧昊;羅志強(qiáng);;非吸煙型肺癌分子遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J];實(shí)用腫瘤雜志;2010年04期

4 ;SHEsis,a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium,haplotype construction,and genetic association at polymorphism loci[J];Cell Research;2005年02期

5 胡志斌,王永崗,馬紅霞,譚文,鈕菊英,林東昕,沈洪兵;DNA修復(fù)基因XPCAla499Val、Lys939Gln多態(tài)與肺癌易感性[J];中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志;2005年04期

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本文編號(hào):815778

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