本文關鍵詞：ERAP基因多態(tài)性與非小細胞肺癌發(fā)生發(fā)展的相關性研究

  更多相關文章： 非小細胞肺癌 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨肽酶基因 單核苷酸多態(tài)性 關聯(lián)研究

【摘要】：背景肺癌是一種嚴重威脅人類健康的惡性腫瘤,全球肺癌的發(fā)病率及死亡率一直呈持續(xù)上升趨勢。非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)占所有肺癌的80%以上。內(nèi)源性抗原肽的加工提呈過程在機體的抗腫瘤免疫應答中發(fā)揮著重要作用。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨肽酶(endoplasmic reticulum aminopeptidase, ERAP)是抗原提呈過程中的一個重要蛋白分子：在細胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,ERAP蛋白將多肽抗原修剪到合適長度,使其能夠結(jié)合到人類白細胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)Ⅰ類分子上,形成HLAI類分子-抗原肽復合物,隨后呈遞到細胞表面被T細胞識別,產(chǎn)生特定的免疫應答反應。ERAP基因的單核苷酸多態(tài)(single nucleotide polymorphism,SNP)可影響抗原提呈過程,最終導致疾病的發(fā)生及轉(zhuǎn)歸有所差異。目前對于ERAP1基因的研究主要集中于強直性脊柱炎等自身免疫性疾病,對于ERAP2基因的研究較少。ERAP基因多態(tài)性是否會通過影響抗原提呈途徑,從而與非小細胞性肺癌的患病風險具有相關性,有待于進一步探討。本實驗對ERAP1、ERAP2基因與非小細胞性肺癌發(fā)生發(fā)展的相關性進行研究,為進一步研究抗原提呈通路相關基因在機體抗腫瘤免疫中的作用奠定基礎。方法以云南地區(qū)漢族人群中非小細胞肺癌患者342例、健康對照組324例為研究對象,采用Taq Man探針基因分型方法對ERAP1基因4個SNP位點rs27044、 rs30187、rs26653、rs26618和ERAP2基因2個SNP位點rs2549782. rs2248374進行基因分型,并構建單倍型,研究評估ERAP基因多態(tài)性與非小細胞肺癌的發(fā)生發(fā)展的相關性。結(jié)果(1)病例組和對照組ERAP1基因的四個SNP位點.ERAP2基因的兩個SNP位點基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡,實驗所選擇的人群具有代表性；(2)ERAP1基因rs27044、rs30187、rs26618和rs26653的基因型和等位基因頻率差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)；rs27044/rs30187/rs26618/rs26653-CCCG、GCTC、 GTTC單倍型頻率差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)；(3)ERAP2基因rs2248374的等位基因頻率差異有統(tǒng)計學意義(P0.05),rs2549782的基因型和等位基因頻率差異有統(tǒng)計學意義(P0.05),rs2248374/rs2549782-AG、GT單倍型頻率差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)；(4) ERAP1基因的四個SNP位點的基因型和等位基因頻率分布在腺癌和鱗癌患者中無統(tǒng)計學意義,在Ⅰ、Ⅱ期和Ⅲ、Ⅳ期非小細胞肺癌患者中也無統(tǒng)計學意義(P0.05)；(5)ERAP2基因的兩個SNP位點的等位基因頻率在腺癌和鱗癌患者中有統(tǒng)計學意義(P0.05),在Ⅰ、Ⅱ期和Ⅲ、Ⅳ期非小細胞肺癌患者中無統(tǒng)計學意義(P0.05)。結(jié)論ERAP基因多態(tài)性與非小細胞肺癌的發(fā)生具有相關性,ERAP1基因rs27044/rs30187/rs26618/rs26653-CCCG、GCTC單倍型可能增加非小細胞肺癌的患病風險,而GTTC單倍型可能具有保護性作用；ERAP2基因rs2248374/rs2549782-AG單倍型可能增加非小細胞肺癌的患病風險,而GT單倍型可能具有保護性作用；ERAP2基因rs2248374、rs2549782兩個位點可能與非小細胞肺癌的病理類型有關。
【關鍵詞】：非小細胞肺癌 內(nèi)質(zhì)網(wǎng)氨肽酶基因 單核苷酸多態(tài)性 關聯(lián)研究
【學位授予單位】：北京協(xié)和醫(yī)學院
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：R734.2
【目錄】：

• 摘要5-7
• Abstract7-9
• 前言9-13
• 1、肺癌概述9
• 2、抗原提呈通路相關基因及內(nèi)源性抗原加工提呈的機制9-11
• 3、ERAP基因與非小細胞肺癌11-13
• 實驗材料和方法13-19
• (一) 實驗材料13-14
• 1、實驗對象13
• 2、主要試劑13
• 3、主要儀器13-14
• (二) 實驗方法14-19
• 1、臨床資料收集14
• 2、血液標本采集14
• 3、DNA的提取及定量14-16
• 4、基因分型16-18
• 5、統(tǒng)計學處理18-19
• 實驗結(jié)果及分析19-35
• (一) 研究對象的一般資料19
• (二) TaqMan-MGB探針探針基因分型結(jié)果19-35
• 1、各SNP位點分型結(jié)果19-23
• 2、病例組和對照組ERAP1、ERAP2基因的Hardy-Weinberg平衡檢驗23-24
• 3、ERAP1基因多態(tài)性位點在病例組與對照組中的等位基因頻率和基因型頻率24
• 4、ERAP1基因在病例組和對照組中4個多態(tài)性位點的連鎖不平衡分析24-27
• 5、病例組與對照組中ERAP1基因多態(tài)性位點單倍型頻率統(tǒng)計分析27
• 6、ERAP1基因多態(tài)性位點與非小細胞肺癌相關臨床參數(shù)的關系27-30
• 7、ERAP2基因多態(tài)性位點在病例組與對照組中的等位基因頻率和基因型頻率30
• 8、ERAP2基因在病例組和對照組中2個多態(tài)性位點的連鎖不平衡分析30-32
• 9、病例組與對照組中ERAP2基因多態(tài)性位點單倍型頻率統(tǒng)計分析32
• 10、ERAP2基因多態(tài)性位點與非小細胞肺癌相關臨床參數(shù)的關系32-35
• 討論35-40
• 小結(jié)與展望40-41
• 參考文獻41-44
• 論文綜述44-53
• 參考文獻49-53
• 附錄53-55
• 致謝55-56
• 研究生簡歷56-57

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 鮑文華;劉忠鑫;劉磊;;MMP-7和PTEN在非小細胞肺癌的表達及其意義[J];黑龍江醫(yī)藥科學;2011年02期

2 郝建華;黃云超;任宏軒;陳楊;郝曦;石青萍;肖義澤;;1973—2005年肺癌高發(fā)地區(qū)肺癌死亡趨勢的分析[J];中國全科醫(yī)學;2009年24期

3 虢毅;鄧昊;羅志強;;非吸煙型肺癌分子遺傳學研究進展[J];實用腫瘤雜志;2010年04期

4 ;SHEsis,a powerful software platform for analyses of linkage disequilibrium,haplotype construction,and genetic association at polymorphism loci[J];Cell Research;2005年02期

5 胡志斌,王永崗,馬紅霞,譚文,鈕菊英,林東昕,沈洪兵;DNA修復基因XPCAla499Val、Lys939Gln多態(tài)與肺癌易感性[J];中華醫(yī)學遺傳學雜志;2005年04期

，

本文編號：815778