轉(zhuǎn)錄組測序揭示DKK4與胰腺癌密切相關(guān)
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更多相關(guān)文章: DKK4 胰腺癌 轉(zhuǎn)錄組測序 轉(zhuǎn)錄組學(xué) 轉(zhuǎn)移
【摘要】:背景:近年來研究發(fā)現(xiàn)DKK4與腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)。在結(jié)腸癌、腎癌組織中DKK4高表達促使腫瘤的發(fā)生發(fā)展,但DKK4與胰腺癌的關(guān)系不清楚。方法:采用q RT-PCR和免疫組化檢測了DKK4在胰腺癌組織中的表達情況。構(gòu)建過表達DKK4的胰腺癌細(xì)胞株通過轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)基于DKK4引起的差異基因。通過差異基因注釋、差異基因信號通路分析及信號通路互作、差異基因互作網(wǎng)絡(luò)分析、共表達分析揭示DKK4與胰腺癌密切相關(guān)。采用胰腺癌標(biāo)本冰凍切片和石蠟連續(xù)切片通過免疫組化和免疫熒光去驗證分析的正確性。最后,通過體內(nèi)外分子實驗探索DKK4在胰腺癌中的生物學(xué)行為。結(jié)果:q RT-PCR和免疫組化結(jié)果顯示DKK4在胰腺癌組織中高表達。轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)過表達DKK4的胰腺癌細(xì)胞株P(guān)ANC-1-DKK4有520個基因上調(diào),有115個基因下調(diào);蚬δ茏⑨尲靶盘柾贩治霭l(fā)現(xiàn)差異基因主要富集在與腫瘤,器官發(fā)育,免疫炎癥有關(guān)的條目上。信號通路互作揭示過表達DKK4的胰腺癌細(xì)胞株中MAPK signaling pathway是富集顯著的核心信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。Western blot顯示在過表達DKK4胰腺癌細(xì)胞株中磷酸化的ERK表達明顯升高,表明MAPK signaling pathway活性升高。通過差異基因的互作分析及共表達分析發(fā)現(xiàn)與腫瘤密切相關(guān)的基因,如MAPK3、PIK3R3、VAV3、JAG1、PIK3R5、PITX3。在胰腺癌組織中免疫組化提示DKK4與MAPK3、VAV3表達正相關(guān),免疫熒光顯DKK4可以分別與MAPK3、VAV3共表達。細(xì)胞小室實驗證明DKK4可以增加胰腺癌細(xì)胞侵襲遷移能力。胰腺癌原位種植動物模型顯示DKK4可明顯促進胰腺癌的肝轉(zhuǎn)移效應(yīng)。結(jié)論:我們首次發(fā)現(xiàn)胰腺癌組織中DKK4高表達。通過轉(zhuǎn)錄組織測序及生物學(xué)信息分析在過表DKK4的胰腺癌細(xì)胞株中發(fā)現(xiàn)與腫瘤密切相關(guān)的癌基因,MAPK signaling pathway是過表達DKK4胰腺癌細(xì)胞株P(guān)ANC-1-DKK4顯著活化的核心信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,體內(nèi)外實驗證明DKK4促進胰腺癌細(xì)胞的侵襲遷移。提示DKK4與胰腺癌的發(fā)生密切相關(guān),可作為胰腺癌治療的新靶點。
【關(guān)鍵詞】:DKK4 胰腺癌 轉(zhuǎn)錄組測序 轉(zhuǎn)錄組學(xué) 轉(zhuǎn)移
【學(xué)位授予單位】:第三軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R735.9
【目錄】:
- 縮略語表5-6
- 英文摘要6-8
- 中文摘要8-10
- 第一章 前言10-14
- 第二章 DKK4在胰腺癌中高表達14-20
- 2.1 材料和方法14-17
- 2.2 結(jié)果17-18
- 2.3 討論18-19
- 2.4 小結(jié)19-20
- 第三章 過表達DKK4胰腺癌細(xì)胞株轉(zhuǎn)錄組測序分析DKK4與胰腺癌的關(guān)系20-34
- 3.1 材料與方法21-23
- 3.2 結(jié)果23-29
- 3.3 討論29-32
- 3.4 小結(jié)32-34
- 第四章 DKK4與MAPK3、VAV3在胰腺癌共表達34-38
- 4.1 材料和方法34-35
- 4.2 結(jié)果35-36
- 4.3 討論36-37
- 4.4 小結(jié)37-38
- 第五章 DKK4促進胰腺癌細(xì)胞的侵襲轉(zhuǎn)移38-44
- 5.1 材料和方法38-39
- 5.2 結(jié)果39-41
- 5.3 討論41-43
- 5.4 小結(jié)43-44
- 全文總結(jié)44-46
- 參考文獻46-50
- 文獻綜述 DKK4與Wnt通路50-59
- 參考文獻55-59
- 在讀期間發(fā)表文章59-60
- 致謝60
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6 上海市腫瘤醫(yī)院胰腺肝膽外科主任醫(yī)師 虞先o,
本文編號:737589
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