人即刻早期反應(yīng)基因2(immediate early response 2,IER2)可能參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展,但它在此過程中的作用及表達(dá)調(diào)控的機(jī)制仍不清楚。本研究通過在線數(shù)據(jù)庫(kù)GEPIA2與Kaplan-Meier Plotter分析發(fā)現(xiàn):TNF和IER2基因在食管癌組織和宮頸癌組織中高表達(dá)。而且IER2基因高表達(dá)的食管癌病人的預(yù)后顯著較差。通過UCSC基因組數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn),在宮頸癌細(xì)胞和淋巴細(xì)胞內(nèi),TNFα(由TNF基因編碼)誘導(dǎo)激活NF-κB結(jié)合IER2基因區(qū)。qRT-PCR檢測(cè)證明,在食管癌和宮頸癌等細(xì)胞內(nèi),TNFα誘導(dǎo)NF-κB在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)IER2基因的表達(dá)。本文據(jù)此提出,TNFα誘導(dǎo)NF-κB上調(diào)IER2基因的表達(dá)可能是其在食管癌和宮頸癌等腫瘤中高表達(dá)的調(diào)控機(jī)制。本研究還通過在線數(shù)據(jù)庫(kù)GeneMANIA和String分析發(fā)現(xiàn)11個(gè)與IER2具有關(guān)聯(lián)性的基因。通過在線數(shù)據(jù)庫(kù)Oncomine分析發(fā)現(xiàn)了88個(gè)基因在食管癌細(xì)胞內(nèi)與IER2基因共表達(dá)。其中,包含7個(gè)與IER2具有關(guān)聯(lián)性的基因ATF3、DUSP1、EGR1、EGR2、FOSB、JUN、NR4A1。本研究通過Oncomi...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 細(xì)胞培養(yǎng)及處理
    1.3 NF-κB結(jié)合IER2的特征分析
    1.4 腫瘤組織細(xì)胞中IER2的表達(dá)分析
    1.5 腫瘤病人生存周期分析
    1.6 與IER2具有關(guān)聯(lián)性基因的分析
    1.7 熒光定量PCR
    1.8 與IER2共表達(dá)的基因及其Gene Ontology(GO)注釋
    1.9 CCK8法檢測(cè)腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)增殖
    1.10統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
2 結(jié)果
    2.1 IER2在腫瘤組織及相應(yīng)正常組織中的表達(dá)
    2.2 IER2基因區(qū)內(nèi)NF-κB的結(jié)合特征
    2.3 TNFα誘導(dǎo)NF-κB調(diào)控IER2基因表達(dá)
    2.4 腫瘤細(xì)胞高表達(dá)的IER2基因功能注釋
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