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通過綜合生物信息學(xué)分析識(shí)別與前列腺癌放療敏感性相關(guān)的長鏈非編碼RNA

發(fā)布時(shí)間:2023-03-26 19:34
  研究背景長鏈非編碼RNA(lncRNA)是RNA的一種,包含至少200個(gè)核苷酸,具有許多m RNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。目前的研究表明,lncRNA與增殖,凋亡,遷移和轉(zhuǎn)移有關(guān),與前列腺癌的放療抵抗,遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移以及預(yù)后有關(guān)。然而,之前大多數(shù)的研究集中在基于小樣本量的單個(gè)lncRNA,缺乏通過大樣本高通量轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)探討lncRNA與前列腺癌放療敏感性之間的相關(guān)性。本課題將使用生物信息學(xué)方法,利用大樣本高通量的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),尋找有效的lncRNA預(yù)測前列腺癌患者的放療敏感性。旨在尋找合適的生物標(biāo)志物用于評(píng)估前列腺癌放療療效,并為患者的個(gè)體化治療提供新的策略。研究目的利用生物信息學(xué)分析技術(shù),識(shí)別與前列腺癌放療敏感性相關(guān)的長鏈非編碼RNA研究方法在癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中,利用edge R包檢測在有完整放療反應(yīng)信息的前列腺癌患者的完全緩解組與非完全緩解組中差異表達(dá)的lncRNA和蛋白編碼基因,再利用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法識(shí)別這些差異表達(dá)的lncRNA與放療敏感性以及與蛋白編碼基因的相關(guān)性。然后我們對(duì)以上與差異表達(dá)的lncRNA有相關(guān)性的蛋白編碼基因用加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析法(WGCNA)篩選出與前列腺...

【文章頁數(shù)】:64 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
英文縮略詞表
中文摘要
Abstract
1.前言
2.材料與方法
3.結(jié)果
4.討論
5.結(jié)論
6.參考文獻(xiàn)
附錄 個(gè)人簡歷
致謝
課題綜述 通過WGCNA方法識(shí)別與前列腺癌放療敏感性相關(guān)的lncRNA
    參考文獻(xiàn)



本文編號(hào):3771581

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