非小細胞肺癌潛在的LncRNAs預后生物標志物
發(fā)布時間:2022-04-23 15:26
第一部分探索LncRNA介導的ceRNA網(wǎng)絡(luò)揭示肺鱗癌LncRNA診斷標志物研究目的:長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)作為競爭性的內(nèi)源RNA(ceRNA)的一員,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用。本研究通過生物信息學的方法對lncRNA介導的ceRNA網(wǎng)絡(luò)進行全面分析,確定潛在的lncRNA生物標記物,以預測肺鱗狀細胞癌(LUSC)的預后。方法:1.差異表達的RNA數(shù)據(jù)集的篩選:通過生物信息學方法運用edge R包從TCGA數(shù)據(jù)庫中的LUSC組織和非LUSC組織中獲得差異表達的lncRNA,miRNA,mRNA數(shù)據(jù)集。2.LncRNA相關(guān)的差異表達的mRNA的功能富集分析:通過DAVID數(shù)據(jù)庫進行GO功能分析和KEGG通路分析,預測lncRNA相關(guān)的差異表達mRNA的相關(guān)功能。3.預測lncRNAs在LUSC中的機制:我們使用miRCode數(shù)據(jù)庫(http://www.mircode.org/)來預測lncRNA與miRNA之間的關(guān)系。通過miRTarBase(http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/),miRDB(ht...
【文章頁數(shù)】:139 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
符號說明
第一部分 探索LncRNA介導的ceRNA網(wǎng)絡(luò)揭示肺鱗癌LncRNA診斷標卷物研究
前言
材料、研究對象與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
附圖表
第二部分 DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析揭示肺腺癌特異性診斷標志物研究
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
附圖表
第三部分 下調(diào)的LncRNA BBOX1-AS1對肺腺癌增殖,侵襲和遷移能力的影響
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
附圖表
參考文獻
總結(jié)與展望
綜述 LncRNA在非小細胞肺癌中的研究進展
參考文獻
致謝
攻讀學位期間發(fā)表的學術(shù)論文目錄
學位論文評閱及答辯情況表
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Long Non-coding RNAs and Their Roles in Non-small-cell Lung Cancer[J]. Ming-Ming Wei,Guang-Biao Zhou. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(05)
本文編號:3647458
【文章頁數(shù)】:139 頁
【學位級別】:碩士
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符號說明
第一部分 探索LncRNA介導的ceRNA網(wǎng)絡(luò)揭示肺鱗癌LncRNA診斷標卷物研究
前言
材料、研究對象與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
附圖表
第二部分 DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析揭示肺腺癌特異性診斷標志物研究
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
附圖表
第三部分 下調(diào)的LncRNA BBOX1-AS1對肺腺癌增殖,侵襲和遷移能力的影響
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
附圖表
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總結(jié)與展望
綜述 LncRNA在非小細胞肺癌中的研究進展
參考文獻
致謝
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]Long Non-coding RNAs and Their Roles in Non-small-cell Lung Cancer[J]. Ming-Ming Wei,Guang-Biao Zhou. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(05)
本文編號:3647458
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