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非小細(xì)胞肺癌潛在的LncRNAs預(yù)后生物標(biāo)志物

發(fā)布時間:2022-04-23 15:26
  第一部分探索LncRNA介導(dǎo)的ceRNA網(wǎng)絡(luò)揭示肺鱗癌LncRNA診斷標(biāo)志物研究目的:長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)作為競爭性的內(nèi)源RNA(ceRNA)的一員,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中具有重要作用。本研究通過生物信息學(xué)的方法對lncRNA介導(dǎo)的ceRNA網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行全面分析,確定潛在的lncRNA生物標(biāo)記物,以預(yù)測肺鱗狀細(xì)胞癌(LUSC)的預(yù)后。方法:1.差異表達(dá)的RNA數(shù)據(jù)集的篩選:通過生物信息學(xué)方法運用edge R包從TCGA數(shù)據(jù)庫中的LUSC組織和非LUSC組織中獲得差異表達(dá)的lncRNA,miRNA,mRNA數(shù)據(jù)集。2.LncRNA相關(guān)的差異表達(dá)的mRNA的功能富集分析:通過DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO功能分析和KEGG通路分析,預(yù)測lncRNA相關(guān)的差異表達(dá)mRNA的相關(guān)功能。3.預(yù)測lncRNAs在LUSC中的機(jī)制:我們使用miRCode數(shù)據(jù)庫(http://www.mircode.org/)來預(yù)測lncRNA與miRNA之間的關(guān)系。通過miRTarBase(http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/),miRDB(ht... 

【文章頁數(shù)】:139 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
符號說明
第一部分 探索LncRNA介導(dǎo)的ceRNA網(wǎng)絡(luò)揭示肺鱗癌LncRNA診斷標(biāo)卷物研究
    前言
    材料、研究對象與方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    附圖表
第二部分 DNA甲基化和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析揭示肺腺癌特異性診斷標(biāo)志物研究
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    附圖表
第三部分 下調(diào)的LncRNA BBOX1-AS1對肺腺癌增殖,侵襲和遷移能力的影響
    前言
    材料與方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    附圖表
參考文獻(xiàn)
總結(jié)與展望
綜述 LncRNA在非小細(xì)胞肺癌中的研究進(jìn)展
    參考文獻(xiàn)
致謝
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Long Non-coding RNAs and Their Roles in Non-small-cell Lung Cancer[J]. Ming-Ming Wei,Guang-Biao Zhou.  Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(05)



本文編號:3647458

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