背景:肝細(xì)胞肝癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是全世界范圍內(nèi)常見(jiàn)的消化系統(tǒng)惡性腫瘤,發(fā)病率逐年攀升,其中位生存時(shí)間為6-20個(gè)月,是全世界癌癥相關(guān)死亡的第三大主要病因。HCC由于其發(fā)病率高、侵襲性高、治療方法有限、總的預(yù)后差,目前仍是一個(gè)具有挑戰(zhàn)性的臨床問(wèn)題。因此,迫切需要尋找潛在的生物標(biāo)志物,探索HCC發(fā)生的分子機(jī)制,為HCC的早期預(yù)防和診治提供依據(jù)。隨著基因組和新的轉(zhuǎn)錄測(cè)序技術(shù)的迅速發(fā)展,HCC的相關(guān)基因研究越來(lái)越受到關(guān)注,其中的長(zhǎng)鏈非編碼RNA（long non-codingRNA,lncRNA）已經(jīng)成為HCC研究的焦點(diǎn),lncRNA是一類(lèi)大小超過(guò)200個(gè)核苷酸長(zhǎng)度的RNA分子,作為分子研究領(lǐng)域的后起之秀,其在腫瘤中的作用越來(lái)越得到重視。近年來(lái)的研究表明,許多異常表達(dá)lncRNA在腫瘤相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程中,如腫瘤的發(fā)生、增殖、浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)移,起到了非常重要的作用,有望成為是新的潛在的HCC生物標(biāo)志物。目的:篩選數(shù)據(jù)庫(kù)中早期和晚期HCC相關(guān)差異表達(dá)的lncRNA和mRNA,并進(jìn)行相關(guān)的生物信息學(xué)分析,研究lncRNA作為早期HCC和晚期HCC生物標(biāo)志物的作用... 

【文章來(lái)源】：河北醫(yī)科大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】：64 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

早期HCC與正常對(duì)照組、晚期HCC與正常對(duì)照組的差異表達(dá)mRNAs和差異表達(dá)lncRNAs韋恩圖分析

早期和晚期HCC共有差異表達(dá)mRNA的前15個(gè)顯著富集的Go-Terms和KEGG路徑Fig4Top15significantlyenrichedGOtermsandKEGGpathwaysforsharedDEmRNAsinearlyandlateHCC

29圖7晚期肝癌的lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)Fig7DElncRNAs-DEmRNAsco-expressionnetworkoflateHCCEllipsesandrhombusrepresentDEmRNAsandDElncRNAs,respectively.Redandgreencolorsrepresentupregulationanddownregulation,respectively.Theblueborderindicatesthetop20upregulationanddownregulatedDElncRNAsandDEmRNAs.6.候選基因的篩選結(jié)果根據(jù)兩組共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果，共篩出584個(gè)（早期HCC組103個(gè)、晚期HCC組481個(gè)）差異表達(dá)的基因，對(duì)所有差異基因驗(yàn)證不太現(xiàn)實(shí)，因此我們對(duì)兩組共有的差異表達(dá)基因進(jìn)行交集，并對(duì)篩選出的比較重要的基因進(jìn)行文獻(xiàn)檢索，結(jié)果見(jiàn)表16。表16文獻(xiàn)檢索結(jié)果Table16theresultsofliteratureretrievalGene疾病PMID數(shù)據(jù)分析結(jié)果文獻(xiàn)報(bào)道結(jié)果備注CDKN3肝細(xì)胞癌31043166upup肝細(xì)胞癌29962817upup肝癌27314282updownCDC25C肝細(xì)胞癌28035361updown藥物治療后，該基因表

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]長(zhǎng)鏈非編碼RNA-H19調(diào)控人肝癌HepG2細(xì)胞增殖與凋亡[J]. 黎梨,鄧?guó)P蓮,黃贊松,廖俊,李建基,楊哲.  右江民族醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(01)
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[3]Downregulation of LncRNAH19 and MiR-675 Promotes Migration and Invasion of Human Hepatocellular Carcinoma Cells through AKT/GSK-3β/Cdc25A Signaling Pathway[J]. 呂軍,馬寧,陳錫林,黃曉卉,汪謙.  Journal of Huazhong University of Science and Technology（Medical Sciences）. 2014(03)
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