lncRNA AC007392.4在結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用及機制研究
發(fā)布時間:2022-01-14 10:58
結(jié)直腸癌(Colorectal cancer,CRC)作為如今普外科最常見的消化道腫瘤之一,由于缺乏有效的分子診斷及治療靶標(biāo),疾病一旦確診,患者基本都已經(jīng)位于中晚期,而目前主要的治療手段還是以手術(shù)治療為主,多數(shù)患者預(yù)后不是很理想。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA)屬于一類長度約為220nt的非編碼RNA,已有研究表明其參與結(jié)直腸癌等多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展。然而,lnc RNA AC007392.4在結(jié)直腸癌中的功能尚不清楚,因此,本研究首次系統(tǒng)性探索其在結(jié)直腸癌中的生物學(xué)功能,并且初步探索在結(jié)直腸癌中AC007392.4發(fā)揮生物學(xué)功能的潛在分子機制。目的:結(jié)直腸癌為我國常見的惡性腫瘤之一,本研究以前期篩選的lnc RNA AC007392.4為研究對象,探討其參與結(jié)直腸癌惡性生物學(xué)功能及潛在分子機制,為結(jié)直腸癌的臨床診斷和治療提供重要參考依據(jù)。方法:通過癌癥基因組圖譜(the Cancer Genome Atlas,TCGA)分析長鏈非編碼RNA AC007392.4在結(jié)直腸組織的表達情況,接著通過臨床樣本驗證AC007392.4在結(jié)直腸癌中的表達;通過皮爾森相...
【文章來源】:蚌埠醫(yī)學(xué)院安徽省
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
AC007392.4在結(jié)直腸癌組織中高表達(A)且與臨床病理分期有關(guān)(B)
19表達差異性,結(jié)果顯示:相較于41例正常的癌旁組織,AC007392.4在480例結(jié)直腸癌組織中顯著高表達,且相對于低分期(StageI-II)的組織中,其在高分期(StageIII-IV)的組織中表達量也具有差異性,說明AC007392.4可能參與結(jié)直腸癌的病理進展,與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展具有一定的相關(guān)性。3.2臨床樣本驗證AC007392.4在結(jié)直腸癌中高表達圖2AC007392.4在結(jié)直腸癌組織中的表達顯著高于其對應(yīng)的癌旁組織(5對)此步驟由上?党晒緟f(xié)助完成,樣本均來源于蚌埠醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院的結(jié)直腸癌術(shù)后患者,結(jié)果顯示AC007392.4在臨床樣本中的含量具有差異性,相較于配對的癌旁組織來說,其在結(jié)直腸癌組織中顯著高表達,具有統(tǒng)計學(xué)意義,這進一步驗證了AC007392.4在結(jié)直腸癌中具有表達差異性,提示其可能參與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展。
22與細胞周期的調(diào)控與DNA修復(fù)等,而在生物學(xué)途徑中,AC007392.4主要富集與細胞周期及有絲分裂G2/M期等。這些結(jié)果共同提示了AC007392.4極有可能與細胞周期有關(guān),尤其在G2/M期中發(fā)揮生物學(xué)功能。3.5瞬時轉(zhuǎn)染效率的驗證圖5SW480細胞轉(zhuǎn)染過表達載體及轉(zhuǎn)染siRNA效率的驗證為了使后續(xù)的實驗結(jié)果更加的靠,同時也為了保證脂質(zhì)體Lipofectamine6000的轉(zhuǎn)染效率,我們通過實時熒光定量PCR對瞬時轉(zhuǎn)染效率進行了驗證,轉(zhuǎn)染后提取細胞中的總RNA,通過反轉(zhuǎn)錄及擴增反應(yīng),以β-actin作為內(nèi)參對照。結(jié)果可以看出,無論是過表達或敲低,AC007392.4的RNA表達水平均發(fā)生了明顯的變化,具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),證明了本研究的轉(zhuǎn)染方法及轉(zhuǎn)染效率可信,這對于下一步的功能驗證及機制探索具有重要的鋪墊作用。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
碩士論文
[1]結(jié)直腸癌相關(guān)長鏈非編碼RNA的篩選與功能研究[D]. 張俏.蚌埠醫(yī)學(xué)院 2015
本文編號:3588382
【文章來源】:蚌埠醫(yī)學(xué)院安徽省
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
AC007392.4在結(jié)直腸癌組織中高表達(A)且與臨床病理分期有關(guān)(B)
19表達差異性,結(jié)果顯示:相較于41例正常的癌旁組織,AC007392.4在480例結(jié)直腸癌組織中顯著高表達,且相對于低分期(StageI-II)的組織中,其在高分期(StageIII-IV)的組織中表達量也具有差異性,說明AC007392.4可能參與結(jié)直腸癌的病理進展,與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展具有一定的相關(guān)性。3.2臨床樣本驗證AC007392.4在結(jié)直腸癌中高表達圖2AC007392.4在結(jié)直腸癌組織中的表達顯著高于其對應(yīng)的癌旁組織(5對)此步驟由上?党晒緟f(xié)助完成,樣本均來源于蚌埠醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院的結(jié)直腸癌術(shù)后患者,結(jié)果顯示AC007392.4在臨床樣本中的含量具有差異性,相較于配對的癌旁組織來說,其在結(jié)直腸癌組織中顯著高表達,具有統(tǒng)計學(xué)意義,這進一步驗證了AC007392.4在結(jié)直腸癌中具有表達差異性,提示其可能參與結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展。
22與細胞周期的調(diào)控與DNA修復(fù)等,而在生物學(xué)途徑中,AC007392.4主要富集與細胞周期及有絲分裂G2/M期等。這些結(jié)果共同提示了AC007392.4極有可能與細胞周期有關(guān),尤其在G2/M期中發(fā)揮生物學(xué)功能。3.5瞬時轉(zhuǎn)染效率的驗證圖5SW480細胞轉(zhuǎn)染過表達載體及轉(zhuǎn)染siRNA效率的驗證為了使后續(xù)的實驗結(jié)果更加的靠,同時也為了保證脂質(zhì)體Lipofectamine6000的轉(zhuǎn)染效率,我們通過實時熒光定量PCR對瞬時轉(zhuǎn)染效率進行了驗證,轉(zhuǎn)染后提取細胞中的總RNA,通過反轉(zhuǎn)錄及擴增反應(yīng),以β-actin作為內(nèi)參對照。結(jié)果可以看出,無論是過表達或敲低,AC007392.4的RNA表達水平均發(fā)生了明顯的變化,具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),證明了本研究的轉(zhuǎn)染方法及轉(zhuǎn)染效率可信,這對于下一步的功能驗證及機制探索具有重要的鋪墊作用。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
碩士論文
[1]結(jié)直腸癌相關(guān)長鏈非編碼RNA的篩選與功能研究[D]. 張俏.蚌埠醫(yī)學(xué)院 2015
本文編號:3588382
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