發(fā)布時(shí)間：2022-01-03 17:51

　　【目的】檢測(cè)DDX31在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)情況,探究DDX31對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞功能和結(jié)直腸癌細(xì)胞系SW480在裸鼠體內(nèi)成瘤的影響,為結(jié)直腸癌在基因治療方面提供理論基礎(chǔ)�！痉椒ā康谝徊糠�:（1）.從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù),Oncomine數(shù)據(jù)庫(kù)下載數(shù)據(jù),并對(duì)結(jié)直腸癌中DDX31的表達(dá)量進(jìn)行分析,再結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)中的臨床信息,分析DDX31表達(dá)水平與患者預(yù)后之間的相關(guān)性;（2）.收集結(jié)直腸癌患者信息及腫瘤樣本,并進(jìn)行了免疫組化檢測(cè),分析DDX31的表達(dá)水平與患者臨床特征之間的相關(guān)性。第二部分:（1）.設(shè)計(jì)DDX31的siRNA,并在SW480細(xì)胞系中檢測(cè)沉默效率;（2）.選擇沉默效率最高的siRNA轉(zhuǎn)染SW480細(xì)胞系,利用CCK-8法檢測(cè)沉默DDX31的SW480細(xì)胞與對(duì)照組細(xì)胞的增殖,利用流式細(xì)胞儀分析兩組細(xì)胞的凋亡和周期,采用transwell chamber進(jìn)行細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)檢測(cè)兩組細(xì)胞的侵襲能力,采用細(xì)胞劃痕的方法定性檢測(cè)DDX31對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞遷移能力的影響。第三部分:（1）.獲取DDX31干擾序列基因片段,進(jìn)行慢病毒載體的重組質(zhì)粒構(gòu)建,然后進(jìn)行慢病毒包裝及滴度的檢測(cè),利用慢病毒轉(zhuǎn)染SW48... 

【文章來(lái)源】：蘇州大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：87 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

TCGA數(shù)據(jù)聚類熱圖，TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)關(guān)于結(jié)直腸癌(286例結(jié)直腸癌患者以及41例正常對(duì)照)的差異表達(dá)基因（|logFC|>1，P<0.05）（前50高表達(dá)以及前50低表

DDX31的mRNA水平在結(jié)直腸癌患者中較正常組明顯增加，數(shù)據(jù)來(lái)源于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)

圖 3. DDX31 在多種腫瘤中表達(dá)均有上調(diào), 橫坐標(biāo)為不同的腫瘤，縱坐標(biāo)為 mRNA 水平，紅色為腫瘤組，藍(lán)色為正常組二、Oncomine 數(shù)據(jù)庫(kù)中驗(yàn)證 DDX31 在結(jié)直腸癌組織中表達(dá)上調(diào)在 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)中，發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌患者中 DDX31 表達(dá)明顯上調(diào)，另外，DDX31在其他腫瘤組織中也出現(xiàn)上調(diào)。接著，利用 Oncomine 數(shù)據(jù)庫(kù)（也稱為癌癥微陣列數(shù)據(jù)庫(kù)和整合數(shù)據(jù)挖掘平臺(tái)，通過(guò)整合己經(jīng)發(fā)表的利用 DNA 微陣列技術(shù)分析腫瘤基因組的數(shù)據(jù)，形成一個(gè)統(tǒng)一的生物信息學(xué)資源庫(kù)，使得各主要的癌癥類型和相應(yīng)的正常組織的基因進(jìn)行差異表達(dá)分析）對(duì)單個(gè)基因即 DDX31 的表達(dá)量進(jìn)行查詢并可視化，發(fā)現(xiàn) DDX31 在結(jié)直腸癌患者中也出現(xiàn)上調(diào)（圖 4），差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。


本文編號(hào)：3566706