ALDH18A1調(diào)控結(jié)直腸癌細(xì)胞自我更新的分子機(jī)制及治療學(xué)意義
發(fā)布時間:2021-12-24 16:28
結(jié)直腸癌(Colorectal cancer,CRC)是消化系統(tǒng)常見的惡性腫瘤之一,死亡率居惡性腫瘤第三位。盡管接受手術(shù)、放療和化療等綜合治療,仍有約20%-45%的CRC患者發(fā)生局部復(fù)發(fā)或遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,發(fā)生轉(zhuǎn)移的患者5年生存率僅為14%。因此,尋找新的治療靶點(diǎn)和策略,具有重要的臨床意義。代謝異常是包括CRC在內(nèi)的多種惡性腫瘤的重要特征,多種代謝產(chǎn)物可通過調(diào)控腫瘤相關(guān)基因的表觀遺傳學(xué)狀態(tài)和表達(dá)來改變腫瘤細(xì)胞表型。有研究表明,侵襲及轉(zhuǎn)移是由腫瘤組織中具有強(qiáng)大自我更新能力的一群細(xì)胞所介導(dǎo)的。因此,研究特殊代謝狀態(tài)對CRC細(xì)胞自我更新的調(diào)控,是尋找CRC轉(zhuǎn)移治療靶點(diǎn)的重要方向。乙醛脫氫酶家族18成員A1(Aldehyde dehydrogenase family 18 member A1,ALDH18A1),又稱為吡咯啉-5-羧酸合成酶(pyrroline-5-carboxylate synthetase,P5CS)是谷氨酸、鳥氨酸和脯氨酸代謝途徑中的關(guān)鍵酶,在氨基酸代謝中扮演重要角色。既往發(fā)現(xiàn),ALDH18A1通過調(diào)控脯氨酸的合成代謝來促進(jìn)黑色素瘤細(xì)胞的增殖。此外,ALDH18A1在lumin...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
GEO數(shù)據(jù)庫預(yù)測結(jié)直腸癌組織及對照正常結(jié)腸組織中的ALDH18A1mRNA的差異表達(dá)水平
第3章ALDH18A1在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及臨床意義23圖3.2Kaplan-Meier生存曲線分析ALDH18A1與結(jié)直腸癌患者總體生存期的關(guān)系。(A)基于TCGA數(shù)據(jù)庫繪制的ROC曲線。(B)基于GSE17538數(shù)據(jù)集繪制的ROC曲線。(C)基于GSE17537數(shù)據(jù)集繪制的ROC曲線。(D)基于TCGA數(shù)據(jù)庫繪制的ALDH18A1差異表達(dá)的結(jié)直腸癌患者總體生存曲線(n=372)。(E)基于GSE17538數(shù)據(jù)集繪制的ALDH18A1差異表達(dá)的結(jié)直腸癌患者總體生存曲線(n=232)。(F)基于GSE17537數(shù)據(jù)集繪制的ALDH18A1差異表達(dá)的結(jié)直腸癌患者總體生存曲線(n=55)。Figure3.2Kaplan-MeiersurvivalcurveanalysisoftherelationshipbetweenALDH18A1andoverallsurvivalofcolorectalcancerpatients.(A)ROCcurvebasedonTCGAdatabase.(B)ROCcurvebasedonGSE17538dataset.(C)ROCcurvebasedonGSE17537dataset.(D)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithdifferentialexpressionofALDH18A1basedonTCGAdatabase(n=372).(E)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17538databset(n=232).(F)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17537dataset(n=55).
采用WesternBlot檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384和正常結(jié)腸細(xì)胞NCM460中ALDH18A1的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ALDH18A1在HT29和SW620這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的表達(dá)水平較高,在LoVo和7648384這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的表達(dá)水平較低(圖4.2A)。我們又采用RT-qPCR檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384中ALDH18A1的相對表達(dá)量,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ALDH18A1在HT29和SW620這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的mRNA表達(dá)水平較高,在LoVo和7648384這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的mRNA表達(dá)水平較低(圖4.2B)。圖4.2WesternBlot和RT-qPCR檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系中ALDH18A1的表達(dá)水平。(A)WesternBlot檢測ALDH18A1蛋白在結(jié)直腸癌細(xì)胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)和正常結(jié)腸細(xì)胞NCM460中的表達(dá)差異。(B)RT-qPCR檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)中ALDH18A1mRNA的相對表達(dá)量,n=3。Figure4.2WesternblotandRT-qPCRwereusedtodetecttheexpressionofALDH18A1incolorectalcancercellline.(A)WesternBlotdetectedthedifferenceofALDH18A1proteinexpressionincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384)andnormalcoloncells(NCM460).(B)RT-qPCRwasusedtodetecttherelativeexpressionofALDH18A1mRNAincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384),n=3.4.3.3敲低ALDH18A1對結(jié)直腸癌細(xì)胞自我更新基因表達(dá)的影響為了明確干預(yù)ALDH18A1后結(jié)直腸癌細(xì)胞的自我更新能力是否發(fā)生變化,我們在采用慢病毒shRNA敲低結(jié)直腸癌細(xì)胞系SW620細(xì)胞中ALDH18A1的表達(dá)后,通過WesternBlot、RT-qPCR實(shí)驗驗證敲低效率,進(jìn)一步比較了SoucieEL等(Soucieetal.,2016)和Papa
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Identification and prediction of novel non-coding and coding RNA-associated competing endogenous RNA networks in colorectal cancer[J]. Yu Liang,Cheng Zhang,Ming-hui Ma,Dong-qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2018(46)
[2]Regulation of MYC gene expression by aberrant Wnt/β-catenin signaling in colorectal cancer[J]. Sherri Rennoll,Gregory Yochum. World Journal of Biological Chemistry. 2015(04)
本文編號:3550819
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:98 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
GEO數(shù)據(jù)庫預(yù)測結(jié)直腸癌組織及對照正常結(jié)腸組織中的ALDH18A1mRNA的差異表達(dá)水平
第3章ALDH18A1在結(jié)直腸癌中的表達(dá)及臨床意義23圖3.2Kaplan-Meier生存曲線分析ALDH18A1與結(jié)直腸癌患者總體生存期的關(guān)系。(A)基于TCGA數(shù)據(jù)庫繪制的ROC曲線。(B)基于GSE17538數(shù)據(jù)集繪制的ROC曲線。(C)基于GSE17537數(shù)據(jù)集繪制的ROC曲線。(D)基于TCGA數(shù)據(jù)庫繪制的ALDH18A1差異表達(dá)的結(jié)直腸癌患者總體生存曲線(n=372)。(E)基于GSE17538數(shù)據(jù)集繪制的ALDH18A1差異表達(dá)的結(jié)直腸癌患者總體生存曲線(n=232)。(F)基于GSE17537數(shù)據(jù)集繪制的ALDH18A1差異表達(dá)的結(jié)直腸癌患者總體生存曲線(n=55)。Figure3.2Kaplan-MeiersurvivalcurveanalysisoftherelationshipbetweenALDH18A1andoverallsurvivalofcolorectalcancerpatients.(A)ROCcurvebasedonTCGAdatabase.(B)ROCcurvebasedonGSE17538dataset.(C)ROCcurvebasedonGSE17537dataset.(D)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithdifferentialexpressionofALDH18A1basedonTCGAdatabase(n=372).(E)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17538databset(n=232).(F)OverallsurvivalcurveofcolorectalcancerpatientswithALDH18A1differentialexpressionbasedonGSE17537dataset(n=55).
采用WesternBlot檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384和正常結(jié)腸細(xì)胞NCM460中ALDH18A1的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ALDH18A1在HT29和SW620這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的表達(dá)水平較高,在LoVo和7648384這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的表達(dá)水平較低(圖4.2A)。我們又采用RT-qPCR檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384中ALDH18A1的相對表達(dá)量,結(jié)果發(fā)現(xiàn)ALDH18A1在HT29和SW620這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的mRNA表達(dá)水平較高,在LoVo和7648384這兩個結(jié)直腸癌細(xì)胞系中的mRNA表達(dá)水平較低(圖4.2B)。圖4.2WesternBlot和RT-qPCR檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系中ALDH18A1的表達(dá)水平。(A)WesternBlot檢測ALDH18A1蛋白在結(jié)直腸癌細(xì)胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)和正常結(jié)腸細(xì)胞NCM460中的表達(dá)差異。(B)RT-qPCR檢測結(jié)直腸癌細(xì)胞系(HT29、SW620、SW480、HCT116、LoVo、7648384)中ALDH18A1mRNA的相對表達(dá)量,n=3。Figure4.2WesternblotandRT-qPCRwereusedtodetecttheexpressionofALDH18A1incolorectalcancercellline.(A)WesternBlotdetectedthedifferenceofALDH18A1proteinexpressionincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384)andnormalcoloncells(NCM460).(B)RT-qPCRwasusedtodetecttherelativeexpressionofALDH18A1mRNAincolorectalcancercelllines(HT29,SW620,SW480,HCT116,LoVo,7648384),n=3.4.3.3敲低ALDH18A1對結(jié)直腸癌細(xì)胞自我更新基因表達(dá)的影響為了明確干預(yù)ALDH18A1后結(jié)直腸癌細(xì)胞的自我更新能力是否發(fā)生變化,我們在采用慢病毒shRNA敲低結(jié)直腸癌細(xì)胞系SW620細(xì)胞中ALDH18A1的表達(dá)后,通過WesternBlot、RT-qPCR實(shí)驗驗證敲低效率,進(jìn)一步比較了SoucieEL等(Soucieetal.,2016)和Papa
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Identification and prediction of novel non-coding and coding RNA-associated competing endogenous RNA networks in colorectal cancer[J]. Yu Liang,Cheng Zhang,Ming-hui Ma,Dong-qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2018(46)
[2]Regulation of MYC gene expression by aberrant Wnt/β-catenin signaling in colorectal cancer[J]. Sherri Rennoll,Gregory Yochum. World Journal of Biological Chemistry. 2015(04)
本文編號:3550819
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