發(fā)布時(shí)間：2021-12-24 02:26

　　第一部分乳腺癌組織特異性circRNAs的篩選及驗(yàn)證研究背景乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤之一,全球每年約有170萬乳腺癌新發(fā)病例,嚴(yán)重威脅著女性的健康。隨著人們生育和生活方式的改變,乳腺癌發(fā)病率呈不斷上升的趨勢。乳腺癌的發(fā)生與肥胖、缺乏運(yùn)動(dòng)、酒精使用、初潮年齡、絕經(jīng)年齡、第一胎生育年齡、雌激素和孕激素使用等因素相關(guān)。然而家庭聚集現(xiàn)象以及在相同暴露下只有少數(shù)人患病的事實(shí)表明,個(gè)體遺傳因素同樣重要。circRNA（環(huán)狀RNA）最早于上世紀(jì)70年代在RNA病毒中被發(fā)現(xiàn),但一直被誤認(rèn)為是外顯子轉(zhuǎn)錄本錯(cuò)誤剪接而形成的低豐度RNA分子。近年來,研究發(fā)現(xiàn)circRNA與人類健康和疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),但與乳腺癌的關(guān)聯(lián)研究還處于起步階段。本研究采用芯片技術(shù)篩選乳腺癌相關(guān)的差異性表達(dá)circRNAs,評估其作為乳腺癌生物標(biāo)志物的價(jià)值。方法本研究采用兩階段病例-對照研究設(shè)計(jì)。第一階段是初篩階段,收集新發(fā)乳腺癌患者癌組織和癌旁組織共4對樣本,利用circRNA芯片檢測組織中circRNA表達(dá)譜,篩選差異表達(dá)的circRNAs,篩選標(biāo)準(zhǔn)為表達(dá)量差異倍數(shù)（fold change,FC）>2倍,P<... 

【文章來源】：南京醫(yī)科大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：86 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

circRNA芯片掃描圖

圖 2. circRNA 芯片質(zhì)控箱式圖Figure 2. Box plot for quality control of circRNA microarray組織中差異 circRNAsP <0.05 且 FC >2 倍的標(biāo)準(zhǔn)，篩選差異表達(dá) circRNAs 在乳腺癌，共檢測到 1155 個(gè)差異表達(dá) circRNAs，其中 715 個(gè)在癌組織 個(gè)在癌組織中表達(dá)下調(diào) 根據(jù) P 值和 FC 繪制火山圖（圖 3）為差異表達(dá)的 circRNAs，左邊的紅點(diǎn)代表癌組織中表達(dá)下右邊的紅點(diǎn)代表癌組織中表達(dá)上調(diào)的 circRNAs 表 3A 和 3B 達(dá)倍數(shù)最顯著的 100 個(gè)表達(dá)上調(diào)的 circRNAs 和 100 個(gè)表達(dá)其中上調(diào)的 circRNAs 中 FC 最大的是 hsa_circRNA_005230（005230），下調(diào)的 circRNAs 中 FC 最大的是 hsa_circRNA_40622

24圖 3.差異表達(dá) circRNAs 的火山圖Figure 3. Volcano plot of differentially expressed circRNAs

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Pro?ling and Validation of the Circular RNA Repertoire in Adult Murine Hearts[J]. Tobias Jakobi,Lisa F.Czaja-Hasse,Richard Reinhardt,Christoph Dieterich.  Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(04)
[2]環(huán)狀RNA與人類疾病[J]. 付麗云,胡耀仁,郭俊明.  中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2015(08)
[3]環(huán)狀RNA的生物學(xué)功能及其在疾病發(fā)生中的作用[J]. 李培飛,陳聲燦,邵永富,蔣孝明,肖丙秀,郭俊明.  生物物理學(xué)報(bào). 2014(01)

博士論文
[1]ciRS-7/miR-7/FAK調(diào)節(jié)軸對宮頸癌侵襲遷移的影響及紫草素干預(yù)機(jī)制的研究[D]. 郝臻鳳.揚(yáng)州大學(xué) 2015



本文編號：3549644