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結直腸癌中差異表達環(huán)狀RNA的鑒定與表達調控網(wǎng)絡預測及初步驗證

發(fā)布時間:2021-12-10 12:02
  目的:長久以來,癌癥一直被譽為人類健康的“第一大殺手”。結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是第三大常見的腫瘤,也是消化道腫瘤內發(fā)病率排名第二位的惡性腫瘤。根據(jù)美國國家癌癥研究所的監(jiān)測數(shù)據(jù),在2019年中,結直腸癌約有145,600例發(fā)病病例,且有51,012例新增死亡病例。在我國,結直腸癌發(fā)病率數(shù)十年來逐漸遞增,位于男性罹患癌癥發(fā)病的第三位,女性中第二位。隨著國民經(jīng)濟水平提高,飲食結構的改變,結直腸癌的發(fā)病年齡逐漸走低,青少年與中青年的患病人數(shù)已然增長。然而,許多結直腸癌患者在診斷之時已經(jīng)發(fā)展為惡性晚期并伴有多發(fā)轉移,如果能夠實現(xiàn)腫瘤的早期診斷可大大降低腫瘤的發(fā)病率。目前結直腸癌的治療方式多以外科手術切除為主輔助化療藥物的應用;癌癥患者往往預后差,復發(fā)率高,不足40%的患者生存期超過5年。近些年來,根據(jù)腫瘤特異性篩查靶點研發(fā)的靶向藥物與精準治療得到巨大突破,在多種腫瘤中得到了較好的療效。但腫瘤的發(fā)生發(fā)展是個多變復雜的過程,受多種因素的影響;目前,結直腸癌的病理機制尚未研究透徹,又缺乏有效的治療靶標和生物標志物。因此,深入研究其發(fā)生機制、篩選出特異性的治療靶點與生物標... 

【文章來源】:中國醫(yī)科大學遼寧省

【文章頁數(shù)】:72 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

結直腸癌中差異表達環(huán)狀RNA的鑒定與表達調控網(wǎng)絡預測及初步驗證


1CRC成對組織中DECs篩選結果

特征分析,信號通路


中國醫(yī)科大學碩士學位論文21圖3.1.2DECs特征分析圖(a)circRNA種類分布(b)circRNA序列長度分布(c)circRNA的染色體分布。3.1.3DECs親本基因的功能富集分析由于circRNA在功能上可能與其親本基因的功能具有相關性,我們對其親本基因進行了GeneOntology與KEGG富集分析。根據(jù)GO-bp結果分析得到,親本基因對應的生物學功能主要依次富集在細胞分化的調控、組織結構分化、纖毛運動形成、MAPK聯(lián)級反應的正向調控、G-蛋白偶聯(lián)受體信號通路、神經(jīng)元反射發(fā)育的正調控、細胞形態(tài)調節(jié)、促進細胞增殖、炎性反應等方面。KEGG通路富集分析得到結果為:癌癥相關通路、肌動蛋白細胞骨架調節(jié)、PIK3-AKT信號通路、內質網(wǎng)中蛋白質加工、神經(jīng)配體-受體相互作用、Rap1信號通路、Ras信號通路。富集結果(如圖3.1.3)顯示DECs的親本基因在以上生物學過程中發(fā)揮作用,為認識DECs的潛在功能提供參考。

親本,功能分析,基因,醫(yī)科大


中國醫(yī)科大學碩士學位論文22圖3.1.3DECs親本基因功能分析圖(a)DECs親本基因的GeneOntology分析。(b)DECs親本基因的KEGG途徑富集分析。3.2RNA-seq數(shù)據(jù)和GSE116589聯(lián)合分析為了進一步確認CRC中潛在的功能性DEC,我們將RNA-seq數(shù)據(jù)和GSE116589(n=2)進行聯(lián)合分析。由此,我們發(fā)現(xiàn)兩組測序數(shù)據(jù)中存在6個共同上調的DECs(hsa_circ_0030632、hsa_circ_0004887、hsa_circ_0001550、hsa_circ_0001681、hsa_circ_0002970和hsa_circ_0006528)和17個共同下調的

【參考文獻】:
期刊論文
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[3]Effect of exercise on colorectal cancer prevention and treatment[J]. Zeynep Oru?,Muhammed Ali Kaplan.  World Journal of Gastrointestinal Oncology. 2019(05)
[4]磷酸戊糖途徑——腫瘤治療的新視角[J]. 何子豪,姚競月,郭青龍.  世界最新醫(yī)學信息文摘. 2018(09)
[5]Genomic diversity of colorectal cancer: Changing landscape and emerging targets[J]. Daniel H Ahn,Kristen K Ciombor,Sameh Mikhail,Tanios Bekaii-Saab.  World Journal of Gastroenterology. 2016(25)
[6]大腸癌篩查研究進展[J]. 胡水清,張玫.  中國腫瘤. 2012(05)



本文編號:3532589

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