擬糖蛋白與胃癌患者口腔微生物的關(guān)聯(lián)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-24 05:01
研究背景及意義:胃癌(Gastric cancer,GC)是一類嚴(yán)重威脅人類健康的全球性惡性腫瘤,具有極高的死亡率。GC早期癥狀不明顯以及缺少早期診斷標(biāo)志物導(dǎo)致了大多數(shù)GC患者發(fā)展至進(jìn)展期才被確診,從而導(dǎo)致了GC的高死亡率。因此尋找可靠的GC早期診斷標(biāo)志物,建立高效的早期GC診斷方法仍是目前的研究熱點(diǎn)?谇晃⑸镌诰S持人體口腔及全身健康中發(fā)揮著重要的作用。遠(yuǎn)端器官病變也會(huì)分泌細(xì)胞因子等物質(zhì),通過血液循環(huán)、內(nèi)分泌和淋巴系統(tǒng)影響口腔微環(huán)境,進(jìn)而影響口腔微生物群落的組成與分布。我們前期的研究表明了GC患者唾液糖蛋白糖型發(fā)生了顯著的改變,糖型的改變是否會(huì)引起口腔微生物群落的變化仍不清楚。因此,本課題首先研究了GC患者與健康志愿者(Healthy volunteers,HV)口腔微生物圖譜,為GC的篩查、輔助診斷、風(fēng)險(xiǎn)療效評(píng)估提供新的思路;其次合成GC患者變化的唾液糖蛋白糖型對(duì)應(yīng)的擬糖蛋白,研究擬糖蛋白對(duì)GC患者口腔中豐度上調(diào)菌群的影響及其潛在影響機(jī)制,揭示唾液糖蛋白糖型與GC患者口腔微生物菌群豐度變化的關(guān)聯(lián)性,闡明唾液糖蛋白糖鏈與口腔微生物在人體遠(yuǎn)端疾病發(fā)生發(fā)展過程中的關(guān)聯(lián)作用。方法:本研究共...
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:144 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
革蘭氏陰性菌細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)
第一章引言23體NLRs(如NLRP3)通過接頭蛋白ASC與Caspase-1前體結(jié)合,激活Caspase-1,激活后的Caspase-1一方面對(duì)IL-1β和IL-18的前體進(jìn)行切割,形成有活性的IL-1β,IL-18并釋放到胞外,募集炎癥細(xì)胞,擴(kuò)大炎癥反應(yīng),另一方面對(duì)GasderminD進(jìn)行切割,生成含有N端活性的肽段,與細(xì)胞膜中的脂蛋白結(jié)合,導(dǎo)致了膜穿孔,發(fā)生細(xì)胞焦亡[162-164]。此外,LPS誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)的非經(jīng)典通路中,Caspase-4和Caspase-5能夠直接與LPS結(jié)合,將未成熟的IL-1β和IL-18加工形成成熟的IL-1β和IL-18釋放出胞外,并引起細(xì)胞焦亡[165]。圖1-2細(xì)菌LPS誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)經(jīng)典通路Figure1-2TheinflammatorycanonicalpathwayinducedbyLPS1.6本論文的研究目的與意義1.6.1研究目標(biāo)a.研究GC患者與HV口腔微生物群落分布,篩選GC患者口腔微生物中豐度發(fā)生顯著變化的菌種。b.根據(jù)GC患者唾液糖蛋白糖型的改變,合成擬糖蛋白模擬糖在自然狀態(tài)下的功能c.篩選對(duì)GC患者口腔優(yōu)勢(shì)菌(豐度上調(diào)的菌種)具有影響作用的擬糖蛋白d.?dāng)M糖蛋白對(duì)口腔微生物的影響以及其機(jī)制的研究e.Fuc-BSA,A.segnis對(duì)口腔細(xì)胞影響的初步研究
第二章胃癌患者口腔微生物的篩選與分離25第二章胃癌患者口腔微生物的篩選與分離2.1引言16SrDNA存在所有細(xì)菌基因組中,包含10個(gè)保守區(qū)(ConservedRegions)與9個(gè)可變區(qū)(VariableRegions),被廣泛的應(yīng)用于細(xì)菌的分類與鑒定(圖2-1)。通常針對(duì)保守區(qū)設(shè)計(jì)出細(xì)菌通用引物,擴(kuò)增出包含高變區(qū)(如V3、V4、V3-V4或者V4-V5)的DNA片段,對(duì)DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序,與微生物16SrDNA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),進(jìn)行菌種的鑒定以及群落多樣性的分析。本章通過對(duì)HV與GC患者口腔微生物16SrDNAV3-V4片段擴(kuò)增子測(cè)序,探究GC患者口腔微生物圖譜以及與HV口腔微生物的差異,篩選GC患者口腔微生物中豐度發(fā)生顯著變化的菌種。圖2-116SrDNA保守區(qū)與可變區(qū)示意圖Figre2-1Theconservedandvariableregionsof16SrDNA2.2實(shí)驗(yàn)材料2.2.1實(shí)驗(yàn)主要儀器表2-1主要實(shí)驗(yàn)儀器目錄主要實(shí)驗(yàn)儀器名稱生產(chǎn)商生物安全柜HealForceCrop(香港)高壓滅菌鍋TOMYCrop(日本)生化培養(yǎng)箱天津泰斯特NanoPhotometerImplen(德國(guó))恒溫?fù)u床上海捷呈
本文編號(hào):3515285
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:144 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
革蘭氏陰性菌細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)
第一章引言23體NLRs(如NLRP3)通過接頭蛋白ASC與Caspase-1前體結(jié)合,激活Caspase-1,激活后的Caspase-1一方面對(duì)IL-1β和IL-18的前體進(jìn)行切割,形成有活性的IL-1β,IL-18并釋放到胞外,募集炎癥細(xì)胞,擴(kuò)大炎癥反應(yīng),另一方面對(duì)GasderminD進(jìn)行切割,生成含有N端活性的肽段,與細(xì)胞膜中的脂蛋白結(jié)合,導(dǎo)致了膜穿孔,發(fā)生細(xì)胞焦亡[162-164]。此外,LPS誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)的非經(jīng)典通路中,Caspase-4和Caspase-5能夠直接與LPS結(jié)合,將未成熟的IL-1β和IL-18加工形成成熟的IL-1β和IL-18釋放出胞外,并引起細(xì)胞焦亡[165]。圖1-2細(xì)菌LPS誘導(dǎo)炎癥反應(yīng)經(jīng)典通路Figure1-2TheinflammatorycanonicalpathwayinducedbyLPS1.6本論文的研究目的與意義1.6.1研究目標(biāo)a.研究GC患者與HV口腔微生物群落分布,篩選GC患者口腔微生物中豐度發(fā)生顯著變化的菌種。b.根據(jù)GC患者唾液糖蛋白糖型的改變,合成擬糖蛋白模擬糖在自然狀態(tài)下的功能c.篩選對(duì)GC患者口腔優(yōu)勢(shì)菌(豐度上調(diào)的菌種)具有影響作用的擬糖蛋白d.?dāng)M糖蛋白對(duì)口腔微生物的影響以及其機(jī)制的研究e.Fuc-BSA,A.segnis對(duì)口腔細(xì)胞影響的初步研究
第二章胃癌患者口腔微生物的篩選與分離25第二章胃癌患者口腔微生物的篩選與分離2.1引言16SrDNA存在所有細(xì)菌基因組中,包含10個(gè)保守區(qū)(ConservedRegions)與9個(gè)可變區(qū)(VariableRegions),被廣泛的應(yīng)用于細(xì)菌的分類與鑒定(圖2-1)。通常針對(duì)保守區(qū)設(shè)計(jì)出細(xì)菌通用引物,擴(kuò)增出包含高變區(qū)(如V3、V4、V3-V4或者V4-V5)的DNA片段,對(duì)DNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序,與微生物16SrDNA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),進(jìn)行菌種的鑒定以及群落多樣性的分析。本章通過對(duì)HV與GC患者口腔微生物16SrDNAV3-V4片段擴(kuò)增子測(cè)序,探究GC患者口腔微生物圖譜以及與HV口腔微生物的差異,篩選GC患者口腔微生物中豐度發(fā)生顯著變化的菌種。圖2-116SrDNA保守區(qū)與可變區(qū)示意圖Figre2-1Theconservedandvariableregionsof16SrDNA2.2實(shí)驗(yàn)材料2.2.1實(shí)驗(yàn)主要儀器表2-1主要實(shí)驗(yàn)儀器目錄主要實(shí)驗(yàn)儀器名稱生產(chǎn)商生物安全柜HealForceCrop(香港)高壓滅菌鍋TOMYCrop(日本)生化培養(yǎng)箱天津泰斯特NanoPhotometerImplen(德國(guó))恒溫?fù)u床上海捷呈
本文編號(hào):3515285
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