[目的]為了闡明宣威肺癌發(fā)病機(jī)理,開展宣威肺癌蛋白質(zhì)組學(xué)研究,篩選出與宣威肺癌發(fā)病機(jī)制或可作為宣威肺癌預(yù)后因子的潛在生物標(biāo)志物,改善宣威肺癌患者診斷治療及預(yù)后評估。[方法]利用胰酶酶解的方法提取肺癌組織及配對的正常組織中的蛋白質(zhì),通過TMT標(biāo)記的方法進(jìn)行蛋白質(zhì)組測序,并利用生物信息學(xué)軟件進(jìn)行蛋白質(zhì)注釋、亞細(xì)胞定位、差異蛋白篩選、GO富集、蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)等分析篩選目標(biāo)蛋白。[結(jié)果]指定的差異表達(dá)量下（閾值設(shè)為FC值1.5）,所有樣本中,癌組織和癌旁正常組織的差異表達(dá)蛋白均超過100個,肺癌組織和肺正常組織中檢測到下調(diào)蛋白數(shù)為193個,上調(diào)蛋白數(shù)為189個,共計總數(shù)為382個�；虮菊摲治鼋Y(jié)果顯示上述中檢測到的差異蛋白大多具有transport功能,是細(xì)胞膜等主要組分并發(fā)揮結(jié)合作用。KEGG信號通路富集分析發(fā)現(xiàn)Nitrogen metabolism（氮代謝）和Hematopoietic cell lineage（造血細(xì)胞系）等通路被顯著富集到。[結(jié)論]通過生物信息學(xué)分析,每個樣木我們至少鑒定到5991個蛋白質(zhì),其中癌組織與肺正常組織差異表達(dá)蛋白達(dá)到382個。GO富集分析結(jié)果提示:差異表達(dá)蛋... 

【文章來源】：昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２．不同時期宣威肺癌死亡率比較［１４］?（Ａ）?１９９０－１９９２年（Ｂ）?２００４－２００５年??

？級母離子質(zhì)量誤差容忍度，０．０２?Ｄａ二級碎片離子質(zhì)量誤差容忍度設(shè)置酶切參??數(shù)；固定修飾為ｔ？胱氨酸烷錢化，甲硫氨酸的氧化設(shè)置為可變修飾，蛋ＡＮ端的??乙酰化，脫酰胺化（ＮＱ）。１％的蛋丨＇１鑒定、ＰＳＭ鑒定ＦＤＲ用ＴＭＴ－ＩＯＰｌｅｘ進(jìn)行??定量。??２．８質(zhì)譜質(zhì)控檢測??Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?ｐｅｐｔｉｄｅ?ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??■Ｉｋ！??￣ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ??７?８?９?１０?１１?１２?１３?１４?ＩＳ?１６?１７?１?８?１９?２０?２１?２２?２３?２４?２５?２６?２７?２８?２９?３０?＞３０??Ｐｅｐｔｉｄｅ?ｌｅｎｇｔｈ??圖２．肽段長度分布??如丨冬丨２所示，結(jié)果４所選取的＿解和碎裂／／式的常態(tài)吻介，肽段氨裉酸主??要分布區(qū)域為７至２０個。其中，不符合ＨＣＤ的碎裂方式ＩＬ大子２０個氨基酸的??肽段質(zhì)最和電荷數(shù)偏高，而產(chǎn)生的碎片離子過少的小十５個氣袪酸的肽段則無??法進(jìn)行有效的序列鑒定。總體肴來，質(zhì)譜分析得到肽段長度的分布已滿足相應(yīng)??的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。??１３??

６４３９．０個蛋白。詳細(xì)的實驗結(jié)果匯總?cè)缦拢ū恚担�。依�?jù)樣本中蛋白質(zhì)的表達(dá)量，??利用主成分分析（圖６），我們可以很清晰把肺癌組織和癌旁肺組織區(qū)分來。??１３７９２２０??■｜｜｜｜｜?１３１１７３?１２５９９７??１ｅ＋０５－??６４＾?５９９１??Ｉ?Ｉ??／／／／／／??，／?／?／?／??圖５．質(zhì)譜數(shù)據(jù)結(jié)果基本統(tǒng)計圖??表５．質(zhì)譜數(shù)據(jù)結(jié)果基本統(tǒng)計表??Ｔｏｔａｌ?Ｍａｔｃｈｅｄ?Ｐｅｐｔｉｄｅｓ?Ｕｎｉｑｕｅ?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?Ｑｕａｎｔｉｆｉａｂｌｅ??ｓｐｅｃｔｒｕｍ?ｓｐｅｃｔｒｕｍ?ｐｅｐｔｉｄｅｓ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ??１３７９２２０．０?２２３２２８（１６．２％）?１３１１７３．０?１２５９９７．０?６４３９．０?５９９１．０??２０??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]云南省腫瘤醫(yī)院2005年-2014年肺癌流行病學(xué)特征變化趨勢分析[J]. 林艷蘋,張強(qiáng),陸彥霓,黃云超,馬潔,周永春.  中國肺癌雜志. 2020(03)
[2]R-EBUS、LungPro導(dǎo)航支氣管鏡聯(lián)合快速現(xiàn)場細(xì)胞學(xué)評估在周圍型肺結(jié)節(jié)診斷中的應(yīng)用價值比較[J]. 陳琬玲,馬煜輝,張祥武,黃秋博,趙光強(qiáng),雷玉潔,彭薇,尹新,楊艷芬,譚慧,張磊,黃云超.  中國癌癥雜志. 2020(02)
[3]結(jié)核分枝桿菌感染對非小細(xì)胞肺癌患者調(diào)節(jié)性免疫細(xì)胞的負(fù)向調(diào)節(jié)作用[J]. 寧洪葉,蔣賢高,施伎蟬,何貴清,吳正興.  中華危重癥醫(yī)學(xué)雜志(電子版). 2019(04)
[4]肺癌組織中結(jié)核分枝桿菌L型MPB64基因的檢測[J]. 米熱古麗·阿不都熱合曼,哈里木拉提·艾木肉拉,熱西旦·司馬義,買爾旦·阿不來,胡蓉,馬瑤.  標(biāo)記免疫分析與臨床. 2018(12)
[5]云南省127960名城市居民癌癥風(fēng)險評估及篩查結(jié)果分析[J]. 張強(qiáng),黃云超,沈麗達(dá),趙云紅,姜高香,周海,林艷蘋.  中國腫瘤. 2018(09)
[6]結(jié)核分枝桿菌L型血流感染與肺癌患者紅細(xì)胞免疫功能的相關(guān)性分析[J]. 趙會海,秦立霞,李彥青,劉莉,徐娜,秦靜.  臨床和實驗醫(yī)學(xué)雜志. 2018(05)
[7]非小細(xì)胞肺癌患者外周血ctDNA樣本中EGFR-T790M基因突變分析[J]. 杜亞茜,馬煜輝,楊長紹,葉聯(lián)華,丁曉潔,李權(quán),郭銀金,劉俊熙,黃云超,周永春.  實用醫(yī)學(xué)雜志. 2017(19)
[8]miR-501-5p在宣威地區(qū)肺腺癌組織中的表達(dá)及臨床意義[J]. 陳帥,周永春,陳穎,陳小波,李光劍,雷玉潔,田林瑋,趙光強(qiáng),黃秋博,黃云超.  南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報. 2017(03)
[9]Sox4在女性肺癌細(xì)胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化中的作用及其機(jī)制[J]. 周永春,陳云蘭,黃云超.  中國老年學(xué)雜志. 2017(04)
[10]EBUS-TBNA聯(lián)合EBUS-TENA在縱隔淋巴結(jié)診斷與分期中的應(yīng)用[J]. 馬煜輝,譚慧,黃云超,周永春,楊凱云,黃秋博.  實用醫(yī)學(xué)雜志. 2016(09)



本文編號：3501833