研究目的根據(jù)生物信息學(xué)分析篩選甲狀腺乳頭癌（Thyroid papillary carcinoma,PTC）與甲狀腺濾泡狀癌（Thyroid follicular carcinoma FTC）之間的差異表達(dá)基因以探究甲狀腺濾泡狀癌高轉(zhuǎn)移率的潛在原因,并結(jié)合生存分析就差異基因?qū)谞钕贋V泡狀癌的預(yù)后影響進(jìn)一步篩選,通過(guò)組織驗(yàn)證以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其在FTC細(xì)胞中的生物學(xué)功能。結(jié)合KEGG富集分析探究導(dǎo)致FTC與PTC惡性生物學(xué)行為的主要差異信號(hào)通路,并對(duì)其在FTC中發(fā)揮功能進(jìn)行驗(yàn)證,進(jìn)一步明確影響生存的差異表達(dá)基因與該信號(hào)通路之間的調(diào)控關(guān)系。研究方法1.數(shù)據(jù)庫(kù)檢索全面篩查GEO數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)集進(jìn)行詳細(xì)閱讀,將符合納入標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行下一步處理。運(yùn)用GEO2R功能,分別對(duì)篩選出的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,提取其中甲狀腺濾泡狀癌與乳頭狀癌的差異表達(dá)基因,并通過(guò)Venn圖的形式展現(xiàn)納入的三個(gè)數(shù)據(jù)集共同的差異表達(dá)基因。cBioPortal（http://www.cbioportal.org/）是一個(gè)基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)探索多維癌癥基因組數(shù)據(jù)的開(kāi)放平臺(tái),其中包括516個(gè)樣本在內(nèi)的甲狀腺癌患者的生存信息�？傮w生存... 

【文章來(lái)源】：山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１本研究分析流程圖

山東大學(xué)碩士學(xué)位論文??－１．２?０．０?１．２??Ｋ?２?Ｕ??Ｓ？?＜〇??＜ｎ＞?＜ｍ?ｉｒ＞??說(shuō)拐氐??ｏ?ｏ?ｏ??■ＳＥＲＰＩＫＡ１??ＴＩＭＰ１??ＰＤＬＩＭＩ??ＩＧＦＢＰ６??ＴＡＣＳＴＤ２??ＭＥＴ??Ｇ０Ｓ２??ＤＵＳＰ５??ＣＹＰ１Ｂ１??ＬＡＭＢ３??ＣＨＩ３Ｌ１??ＡＲＫＴＩ??ＳＬＰＩ??ＰＲ０Ｓ１??Ｔ？０??ＣＸＣＬ２??ＳＦＴＰＢ??ＣＳＴＳ??ＦＭ１??ＤＩ０１??ＬＵＭ??ＫＬＫ１０??ＫＲＴ１９??ＭＵＣ１??ＣＩＴＥＤ１??ＩＧＬＣ１??圖１．３差異表達(dá)基因的熱圖（２個(gè)上調(diào)基因和２４個(gè)下調(diào)基因）。??紅色，相對(duì)上調(diào)；綠色，相對(duì)下調(diào)（校正后）。??３７??

山東大學(xué)碩士學(xué)位論文??ｍｍ??毫畫(huà)??Ｃ??ｔｅ－?「工］??１??〇－?４－??Ｓ??ｌｏｌ＾ｉ?，??圖２．１?ＤＵＳＰ５在ＦＴＣ和ＰＴＣ組織芯片樣品中的表達(dá)：ＦＴＣ和ＰＴＣ組織上ＤＵＳＰ５??免疫組化圖像及陽(yáng)染指數(shù)結(jié)果。??Ａ：?ＦＴＣ；?Ｂ：?ＰＴＣ?；?Ｃ：陽(yáng)染面積比??放大倍數(shù)：ｘ５０?（左）；ｘ４００?（右）；叩＜０．０５。??Ａ?：餘絲??＾?＆珍滅??ｃ?？６ｉ??ｆ?￣ｒ￣??｜４－??ｓ?ｒ??ｒｊＢ??〇???，?Ｌ＿??３９??


本文編號(hào)：3455567