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基于lncRNA表達(dá)譜的乳腺癌綜合預(yù)后預(yù)測(cè)模型的建立

發(fā)布時(shí)間:2021-10-19 10:56
  研究背景乳腺癌是威脅女性健康的最常見惡性腫瘤,其高度異質(zhì)性使患者在病情進(jìn)展、治療反應(yīng)及預(yù)后等方面顯現(xiàn)出明顯的差異,其中人表皮生長因子受體2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)陽性乳腺癌術(shù)后復(fù)發(fā)率和死亡率態(tài)勢(shì)尤為嚴(yán)峻。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一類在腫瘤惡性演化中發(fā)揮關(guān)鍵作用的新興非編碼RNA。本研究旨在利用癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫中乳腺癌患者的RNA表達(dá)譜及臨床病理數(shù)據(jù),從基因組水平挖掘?qū)︻A(yù)后具有更高預(yù)測(cè)價(jià)值的新型分子標(biāo)志物,并構(gòu)建可個(gè)體化預(yù)測(cè)患者生存概率的列線圖;此外,針對(duì)HER2陽性乳腺癌患者,建立可精準(zhǔn)預(yù)測(cè)患者預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)的lncRNA風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型,以期為乳腺癌的臨床精準(zhǔn)診療提供較為全面的預(yù)后評(píng)估系統(tǒng)。第一部分:乳腺癌預(yù)后列線圖的建立及LHX1-DT在乳腺癌進(jìn)展中的功能研究目的:探究乳腺癌的獨(dú)立預(yù)后因素,構(gòu)建可精準(zhǔn)預(yù)測(cè)患者3年和5年生存概率的預(yù)后列線圖,初步明確模型中關(guān)鍵lncRNA分子在乳腺癌進(jìn)展中的作用。方法:1.下載T... 

【文章來源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:122 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于lncRNA表達(dá)譜的乳腺癌綜合預(yù)后預(yù)測(cè)模型的建立


圖2.乳腺癌組織中DELs和DEMs的火山圖及熱圖

模型圖,依賴性,風(fēng)險(xiǎn),分子


?山東大學(xué)碩士學(xué)位論文???1.0—?—.??1?〇.6-?-?+?,??1〇.4?--;??0.2-?一」?-??_:二廠??0.?-一?—????00?02?04?06?08?V0??1-Specificity??-10-lncRNAs?model?0.781?(0.688-0.875)??-AL138789.1?0.736?(0.630-0.843)??AC006262.3?0.660?(0.556-0.763)??-BCAR4?0.621?(0.494-0.747)??-LHX1-DT?0.613?(0.492-0.734)??-LINC00536?0.608?(0.475-0.740)??MIR3150BHG?0.607?(0.472-0.742)??AL513123.1?0.534?(0.452-0.616)??AL133467.1?0.495?(0.380-0.610)??AC079414.1?0.492?(0.390-0.595)??-AC105398.1?0.414?(0.320-0.507)??圖6.時(shí)間依賴性ROC曲線評(píng)估10-lncRNAs風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型與單個(gè)IncRNA分子預(yù)??測(cè)5年生存率的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確性。??Figure?6.?Comparison?of?the?prognostic?accuracy?at?5-year?by?time-dependent?ROC??curves?in?the?10-lncRNAs?risk-score?model?with?single?IncRNA.??82??

模型圖,亞組,生存分析,預(yù)測(cè)能力


?90?120??Survival?time?(months)?Survival?time?(months)?Survival?time?(months)?Survival?time?(months)??M?NTNBC??-high?risk?low?risk??f100,^r.'——??l075??I。5。??,!?0.25??5?〇〇〇?Log-rank?P<0.0001??0?25?50?75?100?125??Survival?time?(months)??圖7.Kaplan-Meier分層生存分析評(píng)估10-lncRNAs風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分模型的獨(dú)立預(yù)測(cè)能力。??(A)TNMI期亞組。(B)TNMII期亞組。(C)TNMIII期亞組。(D)年齡2?65??亞組。(E)年齡<65亞組。(F)?ER陰性亞組。(G)?ER陽性亞組。(H)?PR陰性??亞組。(I)?PR陽性亞組。(J)?HER2陰性亞組。(K)?HER2陽性亞組。(L)三陰??性亞組。(M)非三陰性亞組。??Figure?7.?Kaplan-Meier?stratified?analysis?of?the?10-lncRNAs?risk-score?model.?(A)??TNM?I?subgroup.?(B)?TNM?II?subgroup.?(C)?TNM?III?subgroup.?(D)?Age?>?65??subgroup.?(E)?Age?<?65?subgroup.?(F)?ER-negative?subgroup.?(G)?ER-positive??subgroup.?(H)?PR-negative?subgroup.?(I)?PR-p


本文編號(hào):3444738

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