目的:應(yīng)用生物信息學(xué)的分析方法和工具,篩選乳腺癌與癌旁組織差異表達(dá)的微小RNA（Micro RNA mi RNA）,對差異表達(dá)的mi RNA進(jìn)行功能學(xué)、分子通路及蛋白互相作用網(wǎng)絡(luò)等方面進(jìn)一步分析,尋找與乳腺癌相關(guān)的mi RNA,為乳腺癌的臨床診治提供一定的理論指導(dǎo)。方法:1.從TCGA數(shù)據(jù)庫（The Cancer Genome Atlas Program癌癥基因組圖譜計劃）下載乳腺癌及癌旁組織表達(dá)mi RNA;2.運用R語言相關(guān)程序包處理下載數(shù)據(jù),獲得mi RNA數(shù)據(jù);3.對差異表達(dá)mi RNA進(jìn)行功能學(xué)分析;4.明顯差異表達(dá)的mi RNA進(jìn)行靶基因預(yù)測;5.應(yīng)用在線分析工具Aimgo2、DAVID、STRING對得到的靶基因基因進(jìn)行GO（Gene ontology基因本體數(shù)據(jù)庫）、KEGG（kyoto encyclope dia of gene and ge-nomes京都基因與基因組百科全書數(shù)據(jù)庫）以及蛋白-蛋白互相作用網(wǎng)絡(luò)分析。結(jié)果:1.從TCGA數(shù)據(jù)下載的共計1096例乳腺癌組織、104例癌旁組織表達(dá)的1881項mi RNA進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)表達(dá)上調(diào)mi RNA共計157項,下調(diào)m... 

【文章來源】：河北醫(yī)科大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
英文摘要
英文縮寫
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄一、乳腺癌組織對比癌旁組織上調(diào)miRNA
附錄二、乳腺癌組織對比癌旁組織下調(diào)miRNA
附錄三、miR-21-5p預(yù)測靶基因的權(quán)重分
附錄四、miR-21靶基因的GO富集生物學(xué)功能
附錄五、miR-328靶基因的GO富集生物學(xué)功能
綜述 乳腺癌與生物信息學(xué)
    參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷



本文編號：3431729