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基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)探究甲狀腺癌中Fibronectin 1表達(dá)及臨床意義分析

發(fā)布時(shí)間:2021-10-10 02:25
  目的:甲狀腺癌是美國(guó)女性最常見(jiàn)的癌癥,2015年男性和女性的新增病例估計(jì)超過(guò)62萬(wàn)例。全球范圍內(nèi)的發(fā)病率繼續(xù)上升。分化型甲狀腺癌是甲狀腺癌最常見(jiàn)的病理類(lèi)型,絕大多數(shù)患者經(jīng)手術(shù)、放射性碘治療及TSH抑制治療能獲得良好預(yù)后。但仍有部分患者腫瘤復(fù)發(fā)甚至死亡。本研究著重研究Fibronectin 1(FN 1)在甲狀腺癌的表達(dá)情況,探討FN 1與甲狀腺癌臨床病理特征的關(guān)系,以及其在甲狀腺癌發(fā)生、進(jìn)展中的可能機(jī)制,希望為靶向治療研發(fā)提供靶點(diǎn)。方法:從癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)下載甲狀腺癌中FN 1的RNA SEqV2資料和臨床信息,分別采用SPSS進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)比較甲狀腺癌組織和非腫瘤甲狀腺組織FN 1的表達(dá),利用linkedomics在線分析系統(tǒng)總結(jié)Fibronectin 1與臨床病理參數(shù)的關(guān)系,使用Kaplan-Meier Plotter進(jìn)行無(wú)復(fù)發(fā)生存期比較,通過(guò)linkedomics在線系統(tǒng)中的基因富集分析(GSEA)分析預(yù)測(cè)可能相關(guān)的信號(hào)通路。結(jié)果:(1)FN 1在甲狀腺癌組織中的mRNA表達(dá)顯著增高(16.6630±0.3786 vs... 

【文章來(lái)源】:蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:172 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
第一章 緒論
    1.1 甲狀腺癌概述
    1.2 影響甲狀腺癌預(yù)后的因素
        1.2.1 腫瘤組織學(xué)因素
        1.2.2 腫瘤大小
        1.2.3 淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移
        1.2.4 甲狀腺癌的周?chē)䴘?rùn)
        1.2.5 遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移
        1.2.6 癌基因
        1.2.7 年齡
        1.2.8 性別
        1.2.9 治療相關(guān)因素
        1.2.10 腫瘤分期系統(tǒng)
    1.3 甲狀腺癌臨床表現(xiàn)
        1.3.1 甲狀腺結(jié)節(jié)
        1.3.2 濾泡上皮細(xì)胞源性的甲狀腺癌變
        1.3.3 甲狀腺髓樣癌
        1.3.4 甲狀腺結(jié)節(jié)的超聲特征與細(xì)針穿刺活檢指征
        1.3.5 手術(shù)方法
    1.4 甲狀腺癌的遺傳學(xué)異常
        1.4.1 BRAF
        1.4.2 RET/PTC重排
        1.4.3 MAPK信號(hào)通路
        1.4.4 PI3K/AKT信號(hào)通路
        1.4.5 RAS信號(hào)通路
        1.4.6 PAX8/PPARγ重排
        1.4.7 P53基因變異
        1.4.8 Wnt信號(hào)通路
        1.4.9 NF-κB信號(hào)通路
        1.4.10 HIF-1信號(hào)通路
    1.5 甲狀腺癌靶向治療的分子途徑
        1.5.1 BRAF靶向治療
        1.5.2 RET突變和RET/PTC靶向治療
        1.5.3 RAS的點(diǎn)突變靶向治療
        1.5.4 PI3K靶向治療
        1.5.5 PPAR靶向治療
        1.5.6 NF-κB靶向治療
    1.6 Fibronectin的概述
        1.6.1 自我組裝和原纖維生成
        1.6.2 FN和膠原蛋白
        1.6.3 FN是臨時(shí)細(xì)胞外基質(zhì)
        1.6.4 FN作為細(xì)胞粘附的底物
        1.6.5 FN是生長(zhǎng)因子的作用靶點(diǎn)之一
        1.6.6 利用FN結(jié)合相關(guān)伴侶分子
    1.7 Fibronectin1調(diào)節(jié)腫瘤發(fā)生
        1.7.1 腫瘤發(fā)生中FN的構(gòu)象和作用機(jī)制
        1.7.2 基于FN腫瘤治療方法的進(jìn)展
第二章 基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)探究Fibronectin1與甲狀腺癌臨床病理特點(diǎn)的相關(guān)性分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料工具
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 工具與軟件
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 甲狀腺癌FN1表達(dá)情況分析
        2.2.2 甲狀腺癌中FN1與臨床病理特點(diǎn)的相關(guān)性分析
        2.2.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.3.1 甲狀腺癌與非腫瘤甲狀腺組織的FN1差異表達(dá)
        2.3.2 甲狀腺癌組織FN1表達(dá)及臨床病理相關(guān)性
    2.4 討論
第三章 基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)探究Fibronectin1與甲狀腺癌患者無(wú)病生存的相關(guān)性分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
    3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
    3.4 討論
第四章 基于GSEA的KEGGpathway結(jié)合既往甲狀腺癌的經(jīng)典研究靶點(diǎn)進(jìn)行FN1的基因富集分析
    4.1 實(shí)驗(yàn)材料
    4.2 實(shí)驗(yàn)方法
    4.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        4.3.1 FN1的相關(guān)通路分析和熱圖資料
        4.3.2 正相關(guān)通路
        4.3.3 負(fù)相關(guān)通路
        4.3.4 富集基因集的優(yōu)化篩選結(jié)果
    4.4 討論
第五章 結(jié)論
    5.1 主要結(jié)論
    5.2 研究展望
參考文獻(xiàn)
在學(xué)期間的研究成果
致謝



本文編號(hào):3427463

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