牙齦癌與牙周炎患者口腔菌群結(jié)構(gòu)的比較和分析:共性與差異
發(fā)布時間:2021-10-10 01:25
目的:流行病學(xué)調(diào)查研究顯示,牙周炎可能是口腔鱗狀細胞癌的獨立危險因素。隨著微生物在癌癥過程中重要作用的發(fā)現(xiàn),以及牙周炎與牙齦癌發(fā)病位置的相關(guān)性,本研究試圖探索牙周炎與牙齦鱗狀細胞癌(gingival squamous cell carcinoma,GSCC)患者口腔菌群的結(jié)構(gòu)與功能,比較二者菌群結(jié)構(gòu)的共性與差異,從而探索二者之間的聯(lián)系。材料和方法:根據(jù)納入、排除標(biāo)準(zhǔn),本研究選取2017-2019年于中國醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院就診的GSCC受試者10例、匹配的牙周炎受試者15例和健康受試者15例。經(jīng)過倫理委員會批準(zhǔn)及受試者簽署知情同意之后,記錄受試者人口自然統(tǒng)計學(xué)信息及牙周臨床參數(shù),按照人類微生物組計劃(human microbiome project,HMP)的取樣流程收集3組受試者的唾液、齦下菌斑,另外收集GSCC受試者舌背棉拭子、頰黏膜棉拭子、癌組織和癌旁組織樣本。提取DNA后利用16S rDNA擴增子測序和功能預(yù)測對菌群結(jié)構(gòu)與功能進行分類分析,數(shù)據(jù)質(zhì)控以后進行操作分類單元(operational taxonomy unites,OTU)聚類、菌群結(jié)構(gòu)分析、多樣性分析、組間比較分析、...
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
GSCC受試者口腔內(nèi)不同位點群落結(jié)構(gòu)情況
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文18(Porphyromonas)(見圖3.4A、B)。牙周炎受試者唾液、齦下菌斑的細菌構(gòu)成不同。根據(jù)LEfSe結(jié)果,密螺旋體屬、噬二氧化碳纖維菌屬、棒狀桿菌屬在齦下菌斑中的相對豐度明顯高于唾液,而嗜血桿菌屬、奈瑟菌屬、韋榮菌屬在唾液中相對豐度明顯高于齦下菌斑(見圖3.4C)。圖3.4.牙周炎受試者口腔內(nèi)唾液與齦下菌斑菌群結(jié)構(gòu)與比較分析A.門水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;B.屬水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;C.對照組唾液與齦下菌斑比較LDA分析PSub:牙周炎組齦下菌斑;PS:牙周炎組唾液3.5對照組受試者口腔內(nèi)不同位點的菌群結(jié)構(gòu)Alpha多樣性結(jié)果顯示,牙周健康對照組受試者的唾液與齦下菌斑相比,細菌相對豐度與多樣性均較高(見表2)。PCoA顯示唾液與齦下菌斑菌群結(jié)構(gòu)
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文19圖3.5.對照組受試者口腔內(nèi)唾液與齦下菌斑菌群結(jié)構(gòu)與比較分析A.門水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;B.屬水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;C.對照組唾液與齦下菌斑比較LDA分析HSub:牙周炎組齦下菌斑;HS:牙周炎組唾液不相似。從門水平分析,對照組受試者口腔內(nèi)相對豐度最高的3種細菌為變形菌門(35.88%)、放線菌門(23.72%)、厚壁菌門(16.91%);從屬水平分析,牙周炎受試者口腔內(nèi)相對豐度最高的3種細菌為奈瑟菌屬、棒狀桿菌屬、放線菌屬。唾液中相對豐度最高的3種細菌為奈瑟菌屬、嗜血桿菌屬、韋榮菌屬;齦下菌斑中相對豐度最高的3種細菌為棒狀桿菌屬、放線菌屬、奈瑟菌屬(見圖3.5A、B)。牙周健康受試者唾液、齦下菌斑的細菌構(gòu)成不同。根據(jù)LEfSe結(jié)果,螺旋體屬、密螺旋體屬、棒狀桿菌屬在齦下菌斑中的相對豐度明顯高于唾液,而奈瑟菌屬、嗜血桿菌屬、韋榮菌屬在唾液中相對豐度明顯高于齦下菌斑(見圖3.5C)。
本文編號:3427375
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
GSCC受試者口腔內(nèi)不同位點群落結(jié)構(gòu)情況
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文18(Porphyromonas)(見圖3.4A、B)。牙周炎受試者唾液、齦下菌斑的細菌構(gòu)成不同。根據(jù)LEfSe結(jié)果,密螺旋體屬、噬二氧化碳纖維菌屬、棒狀桿菌屬在齦下菌斑中的相對豐度明顯高于唾液,而嗜血桿菌屬、奈瑟菌屬、韋榮菌屬在唾液中相對豐度明顯高于齦下菌斑(見圖3.4C)。圖3.4.牙周炎受試者口腔內(nèi)唾液與齦下菌斑菌群結(jié)構(gòu)與比較分析A.門水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;B.屬水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;C.對照組唾液與齦下菌斑比較LDA分析PSub:牙周炎組齦下菌斑;PS:牙周炎組唾液3.5對照組受試者口腔內(nèi)不同位點的菌群結(jié)構(gòu)Alpha多樣性結(jié)果顯示,牙周健康對照組受試者的唾液與齦下菌斑相比,細菌相對豐度與多樣性均較高(見表2)。PCoA顯示唾液與齦下菌斑菌群結(jié)構(gòu)
中國醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文19圖3.5.對照組受試者口腔內(nèi)唾液與齦下菌斑菌群結(jié)構(gòu)與比較分析A.門水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;B.屬水平細菌分布,橫坐標(biāo)為樣本,縱坐標(biāo)為相對豐度;C.對照組唾液與齦下菌斑比較LDA分析HSub:牙周炎組齦下菌斑;HS:牙周炎組唾液不相似。從門水平分析,對照組受試者口腔內(nèi)相對豐度最高的3種細菌為變形菌門(35.88%)、放線菌門(23.72%)、厚壁菌門(16.91%);從屬水平分析,牙周炎受試者口腔內(nèi)相對豐度最高的3種細菌為奈瑟菌屬、棒狀桿菌屬、放線菌屬。唾液中相對豐度最高的3種細菌為奈瑟菌屬、嗜血桿菌屬、韋榮菌屬;齦下菌斑中相對豐度最高的3種細菌為棒狀桿菌屬、放線菌屬、奈瑟菌屬(見圖3.5A、B)。牙周健康受試者唾液、齦下菌斑的細菌構(gòu)成不同。根據(jù)LEfSe結(jié)果,螺旋體屬、密螺旋體屬、棒狀桿菌屬在齦下菌斑中的相對豐度明顯高于唾液,而奈瑟菌屬、嗜血桿菌屬、韋榮菌屬在唾液中相對豐度明顯高于齦下菌斑(見圖3.5C)。
本文編號:3427375
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