應(yīng)用液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)（LC-MS）對進(jìn)展期胃癌、早期胃癌和健康人的血液樣本進(jìn)行分析,得出進(jìn)展期胃癌、早期胃癌、健康人血清樣本代謝物代謝譜,找出差異代謝產(chǎn)物。并嘗試檢驗這些標(biāo)記物對區(qū)分胃癌和健康人、早期胃癌和健康人的準(zhǔn)確性,為尋找早期胃癌新的生物標(biāo)志物提供科學(xué)依據(jù)。方法:1、樣本處理:樣本采集后14000r/min離心5min,取上清液供LC-MS分析。2、LC-MS分析:通過液相色譜-質(zhì)譜儀對血清樣本進(jìn)行檢測,得到進(jìn)展期胃癌、早期胃癌和健康人的血液樣本代謝圖譜和相關(guān)原始數(shù)據(jù)。3、數(shù)據(jù)處理:采用方差分析、主成分分析、偏最小二乘判別分析、聚類分析等統(tǒng)計方法進(jìn)行分析,分析胃癌患者和健康人、早期胃癌和健康人的差異代謝產(chǎn)物,繪制ROC曲線驗證這些產(chǎn)物對于區(qū)分各組的準(zhǔn)確性。4、驗證組驗證:設(shè)立獨(dú)立樣本作為驗證組,用幾種差異代謝物對驗證組進(jìn)行驗證、分組和準(zhǔn)確性的判斷。結(jié)果:1、在正負(fù)兩種離子模式下,得到進(jìn)展期胃癌、早期胃癌和健康人樣本的總離子流程圖,可看到各組之間存在峰度值差異;2、通過方差分析,共篩選出316個具有統(tǒng)計學(xué)意義的代謝物;主成分分析得分圖可以看到各組可以很好的區(qū)分開;3、用偏最小二... 

【文章來源】：吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

進(jìn)展期胃癌、早期胃癌和健康人血樣的LC-MS總離子流圖

第3章實驗結(jié)果253.2方差分析方差分析的意義是通過分析研究不同來源的變異對總變異的貢獻(xiàn)大小，從而確定可控因素對研究結(jié)果影響力的大校為了從大量的數(shù)據(jù)中區(qū)分開三組的差異代謝物，本實驗通過對三組數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析，篩選符合條件的F值和P值。F就是計算出來的F值,用來評估組間差異。F值表示整個擬合方程的顯著性，F(xiàn)越大，表示方程越顯著，擬合程度也就越好通過用組間均方去除組內(nèi)均方的商（即F值）與1相比較，若F值接近1，則說明各組均值間的差異沒有統(tǒng)計學(xué)意義，若F值遠(yuǎn)大于1，則說明各組均值間的差異有統(tǒng)計學(xué)意義，同樣P值小于0.05表示具有統(tǒng)計學(xué)意義。通過設(shè)置條件為F值遠(yuǎn)大于1且P值小于0.01，共篩選出316個具有統(tǒng)計學(xué)意義的代謝物，如圖3.2所示，數(shù)值見附表1.通過對這些數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析來研究進(jìn)展期胃癌、早期胃癌和健康人血樣之間的差異。圖3.2方差分析結(jié)果

第3章實驗結(jié)果263.3主成分分析本實驗通過對離子流圖的數(shù)據(jù)進(jìn)行特征識別，得到含有所有信息的文件（.xls格式），將數(shù)據(jù)經(jīng)過metalab軟件進(jìn)行歸一化、標(biāo)度化等預(yù)處理并轉(zhuǎn)換成.csv格式，將該數(shù)據(jù)導(dǎo)入metaboanalyst.ca網(wǎng)站進(jìn)行主成分分析（PCA）。其得分圖如圖3.3所示。圖中的每一個點(diǎn)分別代表一個樣本，各個樣本的代謝特點(diǎn)確定了這些代謝物位置，因此，樣本間的距離越近，表示樣本間具有相似的代謝物組成，生理病理狀態(tài)下樣本相差��；反之樣本距離越遠(yuǎn)，表示代謝物差距越大，生理病理狀態(tài)下樣本相差大。在得分圖上可以明確的看出，組間的聚集良好，說明組內(nèi)的差異較校進(jìn)展期胃癌、早期胃癌分別可以和健康人的樣本可以分開，證明組間存在差異，進(jìn)展期和早期胃癌之間部分存在交集，說明一些產(chǎn)物既可以存在與早期胃癌，也可以存在進(jìn)展期胃癌中。圖3.3主成分分析得分圖.（）進(jìn)展期胃癌，（）早期胃癌，（）健康人，（）質(zhì)控組

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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