胃癌長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達(dá)譜及其相關(guān)ceRNA分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-08 12:37
研究背景及目的:胃癌是全世界范圍內(nèi)常見的惡性腫瘤之一,在中國胃癌病死率僅次于肺癌在惡性腫瘤中位居第二位,嚴(yán)重危害了人類的健康。長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一類長度大于200個(gè)核苷酸的非編碼RNA,其表達(dá)受生長發(fā)育進(jìn)程的調(diào)控,在不同的組織和細(xì)胞類型中具有時(shí)空特異性。因此和編碼蛋白質(zhì)的基因不同,lncRNA在不同組織中會出現(xiàn)非常大的變化。近年來,競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)基因表達(dá)調(diào)節(jié)機(jī)制逐漸被越來越多的實(shí)驗(yàn)所證實(shí),作為一種RNA間相互作用的新機(jī)制,該機(jī)制認(rèn)為ceRNA可以通過與miRNA反應(yīng)原件競爭相同的miRNA,從而調(diào)控mi RNA靶基因的表達(dá)。有研究表明lncRNA可以作為一種ceRNA特異性結(jié)合miRNA從而調(diào)控基因的表達(dá),并與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展都有著密切聯(lián)系。本研究將分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的學(xué)科優(yōu)勢相整合,旨在構(gòu)建胃癌中以lncRNA為核心的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),這種方法為研究胃癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制提供了重要線索,同時(shí)也為研究其它癌癥的相關(guān)機(jī)制提供了新思路。材料及方法:通過TCGA(The Ca...
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
胃癌的a:11個(gè)差異表達(dá)lncRNA雙聚T:胃癌組織N:Figure2.1differentiallyexpr
adhesionmoleculeactivity和Cytokineactivity等分子功能,并與immuneresponse、protein signaling pathway、cell recognition 和 cell adhesion 等生物過程相關(guān)。圖2.2 前100個(gè)上調(diào)和100個(gè)下調(diào)的差異表達(dá)mRNA熱圖(每一縱列代表一個(gè)樣本,每一行代表一個(gè)轉(zhuǎn)錄本)
cRNA)差異表達(dá)譜及其相關(guān) ceRNA 分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析16圖2.3 差異表達(dá)mRNA的GO和pathway富集分析Figure 2.3 GO and pathway enrichment analysis of differentially expressed mRNA
本文編號:3390799
【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
胃癌的a:11個(gè)差異表達(dá)lncRNA雙聚T:胃癌組織N:Figure2.1differentiallyexpr
adhesionmoleculeactivity和Cytokineactivity等分子功能,并與immuneresponse、protein signaling pathway、cell recognition 和 cell adhesion 等生物過程相關(guān)。圖2.2 前100個(gè)上調(diào)和100個(gè)下調(diào)的差異表達(dá)mRNA熱圖(每一縱列代表一個(gè)樣本,每一行代表一個(gè)轉(zhuǎn)錄本)
cRNA)差異表達(dá)譜及其相關(guān) ceRNA 分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析16圖2.3 差異表達(dá)mRNA的GO和pathway富集分析Figure 2.3 GO and pathway enrichment analysis of differentially expressed mRNA
本文編號:3390799
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