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胃癌長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達譜及其相關(guān)ceRNA分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析

發(fā)布時間:2021-09-08 12:37
  研究背景及目的:胃癌是全世界范圍內(nèi)常見的惡性腫瘤之一,在中國胃癌病死率僅次于肺癌在惡性腫瘤中位居第二位,嚴重危害了人類的健康。長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一類長度大于200個核苷酸的非編碼RNA,其表達受生長發(fā)育進程的調(diào)控,在不同的組織和細胞類型中具有時空特異性。因此和編碼蛋白質(zhì)的基因不同,lncRNA在不同組織中會出現(xiàn)非常大的變化。近年來,競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)基因表達調(diào)節(jié)機制逐漸被越來越多的實驗所證實,作為一種RNA間相互作用的新機制,該機制認為ceRNA可以通過與miRNA反應(yīng)原件競爭相同的miRNA,從而調(diào)控mi RNA靶基因的表達。有研究表明lncRNA可以作為一種ceRNA特異性結(jié)合miRNA從而調(diào)控基因的表達,并與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展都有著密切聯(lián)系。本研究將分子生物學(xué)和生物信息學(xué)的學(xué)科優(yōu)勢相整合,旨在構(gòu)建胃癌中以lncRNA為核心的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),這種方法為研究胃癌發(fā)生發(fā)展機制提供了重要線索,同時也為研究其它癌癥的相關(guān)機制提供了新思路。材料及方法:通過TCGA(The Ca... 

【文章來源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:61 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

胃癌長鏈非編碼RNA(lncRNA)表達譜及其相關(guān)ceRNA分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析


胃癌的a:11個差異表達lncRNA雙聚T:胃癌組織N:Figure2.1differentiallyexpr

上調(diào)和,熱圖,差異表達,生物過程


adhesionmoleculeactivity和Cytokineactivity等分子功能,并與immuneresponse、protein signaling pathway、cell recognition 和 cell adhesion 等生物過程相關(guān)。圖2.2 前100個上調(diào)和100個下調(diào)的差異表達mRNA熱圖(每一縱列代表一個樣本,每一行代表一個轉(zhuǎn)錄本)

差異表達,富集


cRNA)差異表達譜及其相關(guān) ceRNA 分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的分析16圖2.3 差異表達mRNA的GO和pathway富集分析Figure 2.3 GO and pathway enrichment analysis of differentially expressed mRNA


本文編號:3390799

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