小細胞肺癌血漿蛋白標(biāo)志物的篩選及其潛在臨床價值的研究
發(fā)布時間:2021-07-27 23:34
目的:小細胞肺癌占肺惡性腫瘤病理類型的20%,小細胞肺癌具有倍增時間短、細胞分化程度差、強侵襲性及易轉(zhuǎn)移的特點,因此大多數(shù)小細胞肺癌患者在診斷時均處于廣泛期,其預(yù)后極差,5年生存率極低。臨床上需要有價值的生物標(biāo)志物協(xié)助小細胞肺癌精確診斷及療效預(yù)測。本研究利用GSH-CAA-X00蛋白芯片篩選小細胞肺癌患者治療前血漿及正常人血漿、小細胞肺癌患者一線化療前后血漿中的差異蛋白,以發(fā)現(xiàn)小細胞肺癌發(fā)生、發(fā)展過程中具有潛在生物學(xué)功能的目標(biāo)蛋白。血漿作為臨床樣本有易采集、操作簡單且風(fēng)險小的優(yōu)點,另外本課題用到的GSH-CAA-X00蛋白芯片相比傳統(tǒng)篩選蛋白的方法有高通量、覆蓋蛋白種類廣泛、特異性靈敏度高、所得數(shù)據(jù)穩(wěn)定性好、可靠度高的優(yōu)勢,這些優(yōu)點保證了本課題的順利進行。方法:1.采集臨床樣本:篩選2017年8月-2017年12月由河北大學(xué)附屬醫(yī)院腫瘤內(nèi)科初治的4例經(jīng)病理確診為小細胞肺癌的患者,接受一線治療2周期,于化療前后各采集血漿一次;同期采集4例健康人血漿,采集后保存于-80℃冰箱。2.利用能同時識別1000個蛋白的GSH-CAA-X00蛋白芯片檢測采集的血漿,原理為雙抗體夾心法,最終掃描并收集...
【文章來源】:河北大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SCLC患者治療前和正常人PCA
河北大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文富集分析方法說明:采取的方法是 fisher 精確檢驗,數(shù)據(jù)包是 clusterProfiler,來自 R/bioconductor;挑選的標(biāo)準(zhǔn)是落在某個 term/GO 上差異的蛋白數(shù)目≥2, P-value <0.05,畫圖中取得 term/GO 是按照 Count 的值從大小降序排列,取前 10 個結(jié)果。enrich_factor 定義=(某個 term 中的差異基因數(shù)目(Count)/總的差異基因數(shù)目)/(在數(shù)據(jù)庫 term 中總的基因數(shù)目/數(shù)據(jù)庫中總的基因數(shù)目)2.1.6 差異基因 KEGG pathway 富集分析應(yīng)用GO富集原理同樣可以得出具有富集功能的KEGG pathway。2.2 實驗結(jié)果2.2.1 主成分分析
SCLC患者化療后和正常人PCA
本文編號:3306760
【文章來源】:河北大學(xué)河北省
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
SCLC患者治療前和正常人PCA
河北大學(xué)碩士專業(yè)學(xué)位論文富集分析方法說明:采取的方法是 fisher 精確檢驗,數(shù)據(jù)包是 clusterProfiler,來自 R/bioconductor;挑選的標(biāo)準(zhǔn)是落在某個 term/GO 上差異的蛋白數(shù)目≥2, P-value <0.05,畫圖中取得 term/GO 是按照 Count 的值從大小降序排列,取前 10 個結(jié)果。enrich_factor 定義=(某個 term 中的差異基因數(shù)目(Count)/總的差異基因數(shù)目)/(在數(shù)據(jù)庫 term 中總的基因數(shù)目/數(shù)據(jù)庫中總的基因數(shù)目)2.1.6 差異基因 KEGG pathway 富集分析應(yīng)用GO富集原理同樣可以得出具有富集功能的KEGG pathway。2.2 實驗結(jié)果2.2.1 主成分分析
SCLC患者化療后和正常人PCA
本文編號:3306760
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