基于大數據庫的蛋白4.1R表達分析和75例肺腺癌組織芯片確認其與生存期的關系
發(fā)布時間:2021-07-22 07:18
背景蛋白4.1具有腫瘤抑制活性,通過FERM結構域對腫瘤的生長調控進行牢牢把控,但是蛋白4.1R與腫瘤發(fā)生的關系尚不清楚,與肺腫瘤特別是肺腺癌的發(fā)生和發(fā)展是否有關,仍有待解決。目的探討蛋白4.1R表達水平與肺腺癌預后和病理特征的關系及其分子機制。方法利用Oncomine和HPA二種大數據庫對蛋白4.1R在肺腺癌中的表達進行全面的分析;并利用商業(yè)化的組織芯片檢測技術對75例肺腺癌石蠟組織切片進行蛋白4.1R的表達再確認,分析的主要指標是蛋白表達相關因素、生存期相關因素分析。最后運用蛋白4.1R基因過表達和沉默技術探討蛋白4.1R基因表達的意義和分子機制。結果Oncomine網站目前有715個數據集,86733個樣品。在13種數據集中有31個肺癌的統(tǒng)計分析涉及蛋白4.1R,只有1次分析中的蛋白4.1R有所改變,與正常組織相比,在肺癌中蛋白4.1R總體表達量是下調。但是各個數據集的蛋白4.1R表達結果并不完全一致。關于在肺腺癌中蛋白4.1R表達尚無定論,而以下調為主。其中支持蛋白4.1R表達下調的數據有二個。Bhattacharjee的結果顯示:共有203例患者,小細胞肺癌下調最為明顯,比正...
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數】:114 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
例肺腺癌患者的臨床分期和生存率的關系
第一部分 肺腺癌組織芯片數據分析comine 數據庫分析結果 Oncomine 網頁(www.oncomine.com),該網站目前有 715 個樣品。輸入查詢的蛋白名稱蛋白 4.1R,獲得了 688 個數據集料(截至 2017 年 1 月 4 日)含有蛋白 4.1R 的資料。選擇肺癌 個肺癌數據集,6129 個樣品;搜索肺腺癌數據,則有 56 個數據合條件。在 13 種數據集中有 31 個肺癌的統(tǒng)計分析涉及蛋白析中的蛋白 4.1R 有所改變,與正常組織相比,在肺癌中蛋白 下調。但是各個數據集的蛋白 4.1R 表達結果并不完全一致。
圖 3. 肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達水平上調(Oncomine)與正常肺組織相比, 肺腺癌蛋白 4.1R 的表達水平分別是: Okayama: 1.459 倍,p 值.27E-9 (A)。Hou: 1.120 倍,p 值為 2.547E-6, (B)。 Selamat: 1.091 倍,p 值為 1.28E-11, (u: 1.211 倍,p 值為 0.043,(D)。以上肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達水平均比正常肺組織有所上調,差異均有顯著性。.3 不支持蛋白 4.1R 表達上調或下調的數據(圖 4)肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平改變的數據來自另一個較大的患者kayama 的研究結果。與 20 例正常肺相比,226 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表平達到 1.508 倍,p 值為 0.990, 無顯著性差異(A)。同樣不支持肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平下調的還有 Hou 的數據:45腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平是正常肺-1.078 倍,p 值為 0.077, 無顯著性(B)。Garber:與 6 例正常肺相比,40 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平達.138 倍,p 值為 0.170, 位列全部表達基因排名的 5199 名,無顯著性差異(C
【參考文獻】:
期刊論文
[1]細胞骨架4.1蛋白在非小細胞肺癌中的表達及意義[J]. 鄭祥艷,祁元明,高艷鋒,王憲遠,祁敏現,時曉芳,安秀麗. 癌癥. 2009(07)
本文編號:3296708
【文章來源】:鄭州大學河南省 211工程院校
【文章頁數】:114 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
例肺腺癌患者的臨床分期和生存率的關系
第一部分 肺腺癌組織芯片數據分析comine 數據庫分析結果 Oncomine 網頁(www.oncomine.com),該網站目前有 715 個樣品。輸入查詢的蛋白名稱蛋白 4.1R,獲得了 688 個數據集料(截至 2017 年 1 月 4 日)含有蛋白 4.1R 的資料。選擇肺癌 個肺癌數據集,6129 個樣品;搜索肺腺癌數據,則有 56 個數據合條件。在 13 種數據集中有 31 個肺癌的統(tǒng)計分析涉及蛋白析中的蛋白 4.1R 有所改變,與正常組織相比,在肺癌中蛋白 下調。但是各個數據集的蛋白 4.1R 表達結果并不完全一致。
圖 3. 肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達水平上調(Oncomine)與正常肺組織相比, 肺腺癌蛋白 4.1R 的表達水平分別是: Okayama: 1.459 倍,p 值.27E-9 (A)。Hou: 1.120 倍,p 值為 2.547E-6, (B)。 Selamat: 1.091 倍,p 值為 1.28E-11, (u: 1.211 倍,p 值為 0.043,(D)。以上肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達水平均比正常肺組織有所上調,差異均有顯著性。.3 不支持蛋白 4.1R 表達上調或下調的數據(圖 4)肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平改變的數據來自另一個較大的患者kayama 的研究結果。與 20 例正常肺相比,226 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表平達到 1.508 倍,p 值為 0.990, 無顯著性差異(A)。同樣不支持肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平下調的還有 Hou 的數據:45腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平是正常肺-1.078 倍,p 值為 0.077, 無顯著性(B)。Garber:與 6 例正常肺相比,40 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達水平達.138 倍,p 值為 0.170, 位列全部表達基因排名的 5199 名,無顯著性差異(C
【參考文獻】:
期刊論文
[1]細胞骨架4.1蛋白在非小細胞肺癌中的表達及意義[J]. 鄭祥艷,祁元明,高艷鋒,王憲遠,祁敏現,時曉芳,安秀麗. 癌癥. 2009(07)
本文編號:3296708
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