基于大數(shù)據(jù)庫(kù)的蛋白4.1R表達(dá)分析和75例肺腺癌組織芯片確認(rèn)其與生存期的關(guān)系
發(fā)布時(shí)間:2021-07-22 07:18
背景蛋白4.1具有腫瘤抑制活性,通過(guò)FERM結(jié)構(gòu)域?qū)δ[瘤的生長(zhǎng)調(diào)控進(jìn)行牢牢把控,但是蛋白4.1R與腫瘤發(fā)生的關(guān)系尚不清楚,與肺腫瘤特別是肺腺癌的發(fā)生和發(fā)展是否有關(guān),仍有待解決。目的探討蛋白4.1R表達(dá)水平與肺腺癌預(yù)后和病理特征的關(guān)系及其分子機(jī)制。方法利用Oncomine和HPA二種大數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)蛋白4.1R在肺腺癌中的表達(dá)進(jìn)行全面的分析;并利用商業(yè)化的組織芯片檢測(cè)技術(shù)對(duì)75例肺腺癌石蠟組織切片進(jìn)行蛋白4.1R的表達(dá)再確認(rèn),分析的主要指標(biāo)是蛋白表達(dá)相關(guān)因素、生存期相關(guān)因素分析。最后運(yùn)用蛋白4.1R基因過(guò)表達(dá)和沉默技術(shù)探討蛋白4.1R基因表達(dá)的意義和分子機(jī)制。結(jié)果Oncomine網(wǎng)站目前有715個(gè)數(shù)據(jù)集,86733個(gè)樣品。在13種數(shù)據(jù)集中有31個(gè)肺癌的統(tǒng)計(jì)分析涉及蛋白4.1R,只有1次分析中的蛋白4.1R有所改變,與正常組織相比,在肺癌中蛋白4.1R總體表達(dá)量是下調(diào)。但是各個(gè)數(shù)據(jù)集的蛋白4.1R表達(dá)結(jié)果并不完全一致。關(guān)于在肺腺癌中蛋白4.1R表達(dá)尚無(wú)定論,而以下調(diào)為主。其中支持蛋白4.1R表達(dá)下調(diào)的數(shù)據(jù)有二個(gè)。Bhattacharjee的結(jié)果顯示:共有203例患者,小細(xì)胞肺癌下調(diào)最為明顯,比正...
【文章來(lái)源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:114 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
例肺腺癌患者的臨床分期和生存率的關(guān)系
第一部分 肺腺癌組織芯片數(shù)據(jù)分析comine 數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果 Oncomine 網(wǎng)頁(yè)(www.oncomine.com),該網(wǎng)站目前有 715 個(gè)樣品。輸入查詢的蛋白名稱蛋白 4.1R,獲得了 688 個(gè)數(shù)據(jù)集料(截至 2017 年 1 月 4 日)含有蛋白 4.1R 的資料。選擇肺癌 個(gè)肺癌數(shù)據(jù)集,6129 個(gè)樣品;搜索肺腺癌數(shù)據(jù),則有 56 個(gè)數(shù)據(jù)合條件。在 13 種數(shù)據(jù)集中有 31 個(gè)肺癌的統(tǒng)計(jì)分析涉及蛋白析中的蛋白 4.1R 有所改變,與正常組織相比,在肺癌中蛋白 下調(diào)。但是各個(gè)數(shù)據(jù)集的蛋白 4.1R 表達(dá)結(jié)果并不完全一致。
圖 3. 肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達(dá)水平上調(diào)(Oncomine)與正常肺組織相比, 肺腺癌蛋白 4.1R 的表達(dá)水平分別是: Okayama: 1.459 倍,p 值.27E-9 (A)。Hou: 1.120 倍,p 值為 2.547E-6, (B)。 Selamat: 1.091 倍,p 值為 1.28E-11, (u: 1.211 倍,p 值為 0.043,(D)。以上肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達(dá)水平均比正常肺組織有所上調(diào),差異均有顯著性。.3 不支持蛋白 4.1R 表達(dá)上調(diào)或下調(diào)的數(shù)據(jù)(圖 4)肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平改變的數(shù)據(jù)來(lái)自另一個(gè)較大的患者kayama 的研究結(jié)果。與 20 例正常肺相比,226 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表平達(dá)到 1.508 倍,p 值為 0.990, 無(wú)顯著性差異(A)。同樣不支持肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平下調(diào)的還有 Hou 的數(shù)據(jù):45腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平是正常肺-1.078 倍,p 值為 0.077, 無(wú)顯著性(B)。Garber:與 6 例正常肺相比,40 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平達(dá).138 倍,p 值為 0.170, 位列全部表達(dá)基因排名的 5199 名,無(wú)顯著性差異(C
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]細(xì)胞骨架4.1蛋白在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及意義[J]. 鄭祥艷,祁元明,高艷鋒,王憲遠(yuǎn),祁敏現(xiàn),時(shí)曉芳,安秀麗. 癌癥. 2009(07)
本文編號(hào):3296708
【文章來(lái)源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:114 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
例肺腺癌患者的臨床分期和生存率的關(guān)系
第一部分 肺腺癌組織芯片數(shù)據(jù)分析comine 數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果 Oncomine 網(wǎng)頁(yè)(www.oncomine.com),該網(wǎng)站目前有 715 個(gè)樣品。輸入查詢的蛋白名稱蛋白 4.1R,獲得了 688 個(gè)數(shù)據(jù)集料(截至 2017 年 1 月 4 日)含有蛋白 4.1R 的資料。選擇肺癌 個(gè)肺癌數(shù)據(jù)集,6129 個(gè)樣品;搜索肺腺癌數(shù)據(jù),則有 56 個(gè)數(shù)據(jù)合條件。在 13 種數(shù)據(jù)集中有 31 個(gè)肺癌的統(tǒng)計(jì)分析涉及蛋白析中的蛋白 4.1R 有所改變,與正常組織相比,在肺癌中蛋白 下調(diào)。但是各個(gè)數(shù)據(jù)集的蛋白 4.1R 表達(dá)結(jié)果并不完全一致。
圖 3. 肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達(dá)水平上調(diào)(Oncomine)與正常肺組織相比, 肺腺癌蛋白 4.1R 的表達(dá)水平分別是: Okayama: 1.459 倍,p 值.27E-9 (A)。Hou: 1.120 倍,p 值為 2.547E-6, (B)。 Selamat: 1.091 倍,p 值為 1.28E-11, (u: 1.211 倍,p 值為 0.043,(D)。以上肺腺癌中蛋白 4.1R 的表達(dá)水平均比正常肺組織有所上調(diào),差異均有顯著性。.3 不支持蛋白 4.1R 表達(dá)上調(diào)或下調(diào)的數(shù)據(jù)(圖 4)肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平改變的數(shù)據(jù)來(lái)自另一個(gè)較大的患者kayama 的研究結(jié)果。與 20 例正常肺相比,226 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表平達(dá)到 1.508 倍,p 值為 0.990, 無(wú)顯著性差異(A)。同樣不支持肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平下調(diào)的還有 Hou 的數(shù)據(jù):45腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平是正常肺-1.078 倍,p 值為 0.077, 無(wú)顯著性(B)。Garber:與 6 例正常肺相比,40 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表達(dá)水平達(dá).138 倍,p 值為 0.170, 位列全部表達(dá)基因排名的 5199 名,無(wú)顯著性差異(C
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]細(xì)胞骨架4.1蛋白在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及意義[J]. 鄭祥艷,祁元明,高艷鋒,王憲遠(yuǎn),祁敏現(xiàn),時(shí)曉芳,安秀麗. 癌癥. 2009(07)
本文編號(hào):3296708
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