目的:肺腺癌是最常見的肺癌類型之一,近幾十年來(lái)其發(fā)生率顯著增長(zhǎng)。放射療法是肺腺癌的有效治療方法,但是,肺腺癌對(duì)放射治療表現(xiàn)出不同程度的放射抵抗性,是影響放射治療效果從而導(dǎo)致治療失敗的主要因素。因此,探討提高肺腺癌放射敏感性方法和手段對(duì)肺腺癌的臨床放射治療有重要的意義。本研究采用生物信息學(xué)方法分析GEO肺腺癌芯片,從肺腺癌芯片中尋找與肺腺癌不良預(yù)后相關(guān)基因,然后從中選出可能作為調(diào)控肺腺癌放射敏感性靶點(diǎn)的基因進(jìn)行深入實(shí)驗(yàn)。研究方法:1、GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中選取了三個(gè)肺腺癌的基因表達(dá)譜（GSE32863,GSE33532和GSE43458）。使用GEO2R在線工具來(lái)篩選各基因表達(dá)譜中與癌旁正常肺組織相比在肺腺癌組織中表達(dá)上調(diào)的基因,然后使用Venn在線軟件篩選三個(gè)數(shù)據(jù)集中共同表達(dá)上調(diào)的基因。在DAVID在線網(wǎng)站中對(duì)這些基因進(jìn)行基因本體論（Gene Ontology,GO）和京都基因與基因組百科全書（Kyoto Encyclopedia of Gene and Genome,KEGG）分析。使用STRING在線網(wǎng)站來(lái)獲取基因之間的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（protein-protein interacti... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：97 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

從GSE33532、GSE43458和GSE32863芯片中獲得324個(gè)共同上調(diào)基因

中國(guó)醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文5細(xì)胞質(zhì)。KEGG分析結(jié)果顯示上調(diào)的基因主要富集在細(xì)胞周期，氨基酸的生物合成，果糖和甘露糖代謝，ECM-受體相互作用，碳代謝，抗生素的生物合成，卵母細(xì)胞減數(shù)分裂，孕酮介導(dǎo)的卵母細(xì)胞成熟，p53信號(hào)通路和代謝途徑（圖2，表1和表2）。圖2324個(gè)上調(diào)基因進(jìn)行GO和KEGG分析

中國(guó)醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文9圖3A:蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建。B:重要模塊的識(shí)別3.4核心基因的生存分析使用KaplanMeier-plotter在線網(wǎng)站來(lái)分析72個(gè)核心基因與肺腺癌患者總生存期（OS）的關(guān)系。結(jié)果顯示著72個(gè)基因中，有58個(gè)基因與肺腺癌患者的OS有顯著相關(guān)性，基因高表達(dá)肺腺癌患者的OS明顯低于低表達(dá)患者，差異有顯著性（P<0.05，表3和圖4）。表3使用KaplanMeier-plotter分析72個(gè)基因與肺腺癌預(yù)后的相關(guān)關(guān)系CategoryGenesGeneswithsignificantlyworsesurvival(P<0.05)MAD2L1PKMYT1KIF2CTTKCCNA2BUB1KIF20ACKAP2LBIRC5CCNB2EXO1CDCA3CDKN3CDC20OIP5HJURPKIF14MCM2MCM10PRC1MELKKIF15NCAPGPTTG1TK1KIF4AUBE2CFOXM1AURKAKIFC1CEP55CDC25CTYMSASF1BKIAA0101EZH2CENPFDLGAP5CHEK1CDCA5ZWINTANLNPOLQCDC45GINS2TIMELESSSHCBP1RFC4NEK2AURKBUBE2TCCNB1TPX2MCM4TOP2APBKASPMCDCA8Geneswithoutsignificantlyworsesurvival(P>0.05)KNTC1HMMRRAD51POLE2ECT2RAD51AP1STILATAD2PLK4CDK1KIF11MCM6CDCA7CKS1B

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Genetic Variants in CHEK1 Gene Are Associated with the Prognosis of Thoracic Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients Treated with Radical Resection[J]. 李婧,唐洋,黃柳,于倩倩,胡廣原,陳超,張鵬,袁響林.  Journal of Huazhong University of Science and Technology（Medical Sciences）. 2016(06)



本文編號(hào)：3294620