LncRNA PCAT1遺傳變異SNPs與乳腺癌遺傳易感性關(guān)聯(lián)分析及初步功能驗證
發(fā)布時間:2021-06-27 16:00
目的乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤,同時它也是女性癌癥中死亡的主要的原因,且其發(fā)病的機制相對復(fù)雜,研究揭示乳腺癌的發(fā)病可能與個人生活的習(xí)慣、生活的環(huán)境、生殖方面的因素和遺傳方面的因素等多種因素及其相互作用有關(guān)。隨著對長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,IncRNA)的研究的不斷深入,lncRNA相關(guān)的生物學(xué)方面的功能也逐漸浮現(xiàn),且重心已出現(xiàn)向單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)方面轉(zhuǎn)移的傾向。有研究表明,前列腺癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(PCAT1)是多種癌癥的致癌因子且與癌癥的進展密切相關(guān),如前列腺癌、肝癌、胃癌、結(jié)直腸癌等,但PCAT1與乳腺癌易感性之間的研究尚未被發(fā)現(xiàn)。本研究的目的是探究PCAT1的8個SNPs與乳腺癌易感性之間的關(guān)聯(lián),并對乳腺癌相關(guān)的SNP進行初步的功能探究。方法1.生物信息學(xué)方法篩選PCAT1的SNPs并預(yù)測其潛在功能:綜合使用NCBI、Ensembl、1000 Genomes和Haploview 4.2根據(jù)最小等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)大于0.05篩選位于PC...
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:106 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3.1所示,基因型T所對應(yīng)??的峰圖位置為173.34,基因型C所對應(yīng)的峰圖位置為175.16;圖3.1?(A)為基??因型TT,?3.1?(B)為基因型TC,?3.1?(C)為基因型CC
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA PCAT-1在口腔鱗狀細胞癌中的表達及臨床意義[J]. 楊宗澄,黃海燕,徐欣. 上?谇会t(yī)學(xué). 2019(01)
[2]單倍型分析技術(shù)研究進展[J]. 李雙雙,張迎新,范成明,陳宇紅,鄧傳良,胡贊民. 生物工程學(xué)報. 2018(06)
[3]人類長鏈非編碼RNA相關(guān)SNP鑒定與功能預(yù)測的研究進展[J]. 龔靜,柳純潔,繆小平,郭安源. 生物技術(shù)通報. 2015(11)
[4]Long non-coding RNAs in stem cells and cancer[J]. Gabriel Eades,Yong-Shu Zhang,Qing-Lin Li,Ji-Xiang Xia,Yuan Yao,Qun Zhou. World Journal of Clinical Oncology. 2014(02)
碩士論文
[1]長鏈非編碼RNA LINC00520 SNPs與乳腺癌遺傳易感性關(guān)聯(lián)分析及功能驗證[D]. 郭巧云.鄭州大學(xué) 2019
[2]LncRNA MALAT1和BCAR4 SNPs與乳腺癌遺傳易感性關(guān)聯(lián)研究及功能分析[D]. 彭瑞.鄭州大學(xué) 2018
[3]miR-149-5p、CCL18在彌漫大B細胞淋巴瘤的表達及臨床意義[D]. 周倩萍.廣西醫(yī)科大學(xué) 2018
本文編號:3253157
【文章來源】:鄭州大學(xué)河南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:106 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖3.1所示,基因型T所對應(yīng)??的峰圖位置為173.34,基因型C所對應(yīng)的峰圖位置為175.16;圖3.1?(A)為基??因型TT,?3.1?(B)為基因型TC,?3.1?(C)為基因型CC
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]長鏈非編碼RNA PCAT-1在口腔鱗狀細胞癌中的表達及臨床意義[J]. 楊宗澄,黃海燕,徐欣. 上?谇会t(yī)學(xué). 2019(01)
[2]單倍型分析技術(shù)研究進展[J]. 李雙雙,張迎新,范成明,陳宇紅,鄧傳良,胡贊民. 生物工程學(xué)報. 2018(06)
[3]人類長鏈非編碼RNA相關(guān)SNP鑒定與功能預(yù)測的研究進展[J]. 龔靜,柳純潔,繆小平,郭安源. 生物技術(shù)通報. 2015(11)
[4]Long non-coding RNAs in stem cells and cancer[J]. Gabriel Eades,Yong-Shu Zhang,Qing-Lin Li,Ji-Xiang Xia,Yuan Yao,Qun Zhou. World Journal of Clinical Oncology. 2014(02)
碩士論文
[1]長鏈非編碼RNA LINC00520 SNPs與乳腺癌遺傳易感性關(guān)聯(lián)分析及功能驗證[D]. 郭巧云.鄭州大學(xué) 2019
[2]LncRNA MALAT1和BCAR4 SNPs與乳腺癌遺傳易感性關(guān)聯(lián)研究及功能分析[D]. 彭瑞.鄭州大學(xué) 2018
[3]miR-149-5p、CCL18在彌漫大B細胞淋巴瘤的表達及臨床意義[D]. 周倩萍.廣西醫(yī)科大學(xué) 2018
本文編號:3253157
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