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非標記定量蛋白質組學研究胰高血糖素在結直腸癌中的作用機制

發(fā)布時間:2021-06-23 17:41
  目的:在全世界范圍內,結直腸癌(Colorectal cancer,CRC)占據癌癥發(fā)病率和死亡率第三位。目前在臨床上,面臨著個性化診治、預測治療結果和評估疾病預后等問題,因此,急需新穎和具體的生物標志物來提高疾病早期診斷的效果和改善患者預后。需要進一步研究生物標志物在結直腸癌進展中的機制和生物學功能。方法:在本研究中,通過非標記質譜(massspectrometry,MS)方法,進行結直腸癌和匹配的正常粘膜組織蛋白質組學分析,以尋找參與結直腸癌的發(fā)生發(fā)展的新靶點。通過蛋白質印跡和免疫組織化學驗證差異表達的蛋白質。使用實時細胞分析儀和全內反射熒光顯微鏡研究細胞增殖遷移和細胞膜下l00nm內熒光變化,研究胰高血糖素在結直腸癌發(fā)生發(fā)展中的作用。結果:在六對結直腸癌組織中,共鑒定出169個顯著差異表達的蛋白質。膜聯(lián)蛋白 4(AnnexinA4,ANXA4),磷酸甘油酸激酶 l(phosphoglycerate kinase 1,PGK)和鳥苷三磷酸結合核蛋白(RAs-relatedNuclear,RAN)在結直腸癌組織中上調,比正常結直腸癌癥組織表達高1.95,2.27和2.22倍。鳥苷三磷... 

【文章來源】:濱州醫(yī)學院山東省

【文章頁數】:75 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

非標記定量蛋白質組學研究胰高血糖素在結直腸癌中的作用機制


圖2-2火山圖說明定量蛋白質組分析鑒定顯著差異表達蛋白質

蛋白質組學,方法,差異表達,蛋白質


濱州醫(yī)學院碩士學位論文??為了了解結直腸癌中差異蛋白的生物學意義,將169個差異表達蛋白上傳到??PANTHER?(pantherdb.org)。圖3-1?A-C顯示蛋白質參與生命過程。這些蛋白質被分為4??個細胞成分,9個生物過程和6個分子功能,主要參與生物過程中代謝29%(A),細胞??組成成分45%(B),分子生物學過程分子功能催化活性31%(C)。這是通過PANTHER??分類系統(tǒng)完成的(www.pantherdb.org/)。這些蛋白質參與了結合活性(39%)、催化活性??(31%)和結構分子活性(15%)。一些差異表達的蛋白參與受體活性、抗氧化活性和轉運??活性。大部分的差異表達蛋白的細胞蛋白(45%)和大分子蛋白質復合物(25%)。這些結??果表明,結直腸癌的發(fā)生發(fā)展是一個涉及到多因素的過程,其中的許多蛋白質參與通??路

實驗預測,知識網絡,鈣離子,數據庫


表此蛋白在癌癥組織比正常組織表達高,綠色代表此蛋白在癌癥組織比正常組織表達??低,顏色深淺代表癌癥組織表達多少,棕色虛線代表具有激活作用,藍色虛線代表具??有抑制作用,黃色虛線代表下游分子不一致性,灰色代表不可推測性,圖3-2示。??廣?Prediction?Legend??v?More?extreme?Less?extreme??//??|?'?Upregulated??/?/?/?|?\?\、、?Oownregutated??f?i?|?、?\?\、?Predicted?Relationship??/?/?I?.?\?、、???Leadsloactivation??/?/?/?丨?\?\?\??▲/?/?★?^?^?\?\???Leads?to?Inhibition??CAIRA?FNl'?NDRG1?TAGLN?CSRP1?FW5?%??\?\?I?/??\?,?V?'?1???Effect?not?predicted??\?\?I?,?/?/?v?y??、、?I?/?Vy??\?\?\?/?,??、、、、\?/??\\v??proliferation?of?cells??圖3-2鈣離子調控網絡通路是基于IPA知識網絡數據庫實驗預測的。??Fig3-2?Calcium?regulator?nehvork?was?predicted?based?on?experimental??evidences?in?IPA?knowledgebase.??2.3討論??這些蛋a質要參勹細胞組成成分,代謝等牛物過ft獅催化分子功能


本文編號:3245377

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