胃癌環(huán)狀RNA0084893的鑒定及生物功能學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-27 10:39
研究背景:胃癌是世界第三大致死相關(guān)性腫瘤,在中國影響著每年超過400,000的人口,約80%的病人在癌癥晚期才被確診,而晚期胃癌患者的5年生存率不超過20%;相比之下,早期胃癌患者術(shù)后5年生存率高達(dá)90%-95%。將抗癌重點(diǎn)從治療晚期胃癌轉(zhuǎn)變?yōu)榧訌?qiáng)胃癌的早期診斷治療,找到穩(wěn)定有效的早期胃癌篩查辦法至關(guān)重要。作為非編碼家族中的一員,環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)廣泛存在于組織及真核細(xì)胞中,因其缺乏游離的5’和3’端且反向剪切形成共價(jià)閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu),具有穩(wěn)定性高、半衰期長等特點(diǎn)。隨著高通量測(cè)序技術(shù)及生物信息學(xué)的發(fā)展,人們發(fā)現(xiàn)circRNA不但大量存在于腫瘤組織中,也在腫瘤的發(fā)生發(fā)展階段以特定的方式表達(dá)。研究表明,環(huán)狀RNA可以調(diào)控腫瘤細(xì)胞的基因表達(dá),改變其生物學(xué)特性,有望成為新的腫瘤標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)。雖然目前已知功能的circRNA有數(shù)千種,但仍有許多circRNA在胃癌中的作用尚待發(fā)掘。研究目的:本實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步研究了胃癌中具有早期診斷價(jià)值的circRNA,并進(jìn)行體外生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)探究其對(duì)胃癌細(xì)胞增殖、遷移、侵襲、凋亡及細(xì)胞周期的影響,通過高通量測(cè)序技術(shù)預(yù)測(cè)了該circ...
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
中文摘要
英文摘要
中英文縮略詞表
序言
1 研究內(nèi)容和技術(shù)路線
1.1 研究內(nèi)容
1.1.1 目的基因的篩選
1.1.2 circ RNA0084893 在胃癌組織和癌旁組織中的表達(dá)水平
1.1.3 結(jié)合胃癌患者臨床病理數(shù)據(jù)分析circ RNA0084893 的臨床診斷價(jià)值
1.1.4 circ RNA0084893 在胃癌細(xì)胞和正常胃粘膜上皮細(xì)胞中的表達(dá)
1.1.5 沉默circ RNA0084893 后胃癌細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲、細(xì)胞周期及凋亡變化
1.1.6 RNA測(cè)序預(yù)測(cè)circ RNA0084893 可能的作用機(jī)制
1.2 技術(shù)路線
2 實(shí)驗(yàn)材料與實(shí)驗(yàn)方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 主要儀器設(shè)備(表2.1)
2.1.2 主要試劑耗材(表2.2)
2.1.3 實(shí)驗(yàn)生物材料(表2.3)
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 目的circ RNA的篩選
2.2.2 標(biāo)本資料與采集
2.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2.4 總RNA提取
2.2.5 PCR引物設(shè)計(jì)及合成
2.2.6 逆轉(zhuǎn)錄
2.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.2.8 siRNA的構(gòu)建
2.2.9 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
2.2.10 克隆形成實(shí)驗(yàn)
2.2.11 CCK-8細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)
2.2.12 流式細(xì)胞術(shù)
2.2.13 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)
2.2.14 Transwell實(shí)驗(yàn)
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 組織病理結(jié)果
3.1.1 目標(biāo)circ RNA的成功篩選
3.1.2 circ RNA0084893 在胃癌組織中低表達(dá)
3.1.3 circ RNA0084893 與患者臨床組織病理的關(guān)系
3.2 細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.1 circ RNA0084893 在胃癌細(xì)胞中低表達(dá)
3.2.2 轉(zhuǎn)染si RNA后 circ RNA0084893 在胃癌細(xì)胞株中下調(diào)表達(dá)
3.2.3 沉默circ RNA0084893 后促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖
3.2.4 沉默circ RNA0084893 后影響細(xì)胞周期與細(xì)胞凋亡
3.2.5 沉默circ RNA0084893 后促進(jìn)胃癌細(xì)胞遷移及侵襲
3.3 RNA測(cè)序結(jié)果
3.3.1 RNA結(jié)構(gòu)變異分析
3.3.2 RNA表達(dá)差異分析
4 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 競爭性內(nèi)源RNA與消化系統(tǒng)惡性腫瘤的研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
作者簡歷及學(xué)期間所取得的科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Long non-coding RNAs involved in metastasis of gastric cancer[J]. Meng-Ting Lin,Hao-Jun Song,Xiao-Yun Ding. World Journal of Gastroenterology. 2018(33)
[2]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu. World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[3]中國早期胃癌篩查及內(nèi)鏡診治共識(shí)意見(2014年4月·長沙)[J]. 廖專,孫濤,吳浩,楊帆,鄒文斌. 胃腸病學(xué). 2014(07)
[4]microRNAs and ceRNAs: RNA networks in pathogenesis of cancer[J]. Xiangqian Su,Jiadi Xing,Zaozao Wang,Lei Chen,Ming Cui,Beihai Jiang. Chinese Journal of Cancer Research. 2013(02)
本文編號(hào):3207417
【文章來源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
中文摘要
英文摘要
中英文縮略詞表
序言
1 研究內(nèi)容和技術(shù)路線
1.1 研究內(nèi)容
1.1.1 目的基因的篩選
1.1.2 circ RNA0084893 在胃癌組織和癌旁組織中的表達(dá)水平
1.1.3 結(jié)合胃癌患者臨床病理數(shù)據(jù)分析circ RNA0084893 的臨床診斷價(jià)值
1.1.4 circ RNA0084893 在胃癌細(xì)胞和正常胃粘膜上皮細(xì)胞中的表達(dá)
1.1.5 沉默circ RNA0084893 后胃癌細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲、細(xì)胞周期及凋亡變化
1.1.6 RNA測(cè)序預(yù)測(cè)circ RNA0084893 可能的作用機(jī)制
1.2 技術(shù)路線
2 實(shí)驗(yàn)材料與實(shí)驗(yàn)方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 主要儀器設(shè)備(表2.1)
2.1.2 主要試劑耗材(表2.2)
2.1.3 實(shí)驗(yàn)生物材料(表2.3)
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 目的circ RNA的篩選
2.2.2 標(biāo)本資料與采集
2.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)
2.2.4 總RNA提取
2.2.5 PCR引物設(shè)計(jì)及合成
2.2.6 逆轉(zhuǎn)錄
2.2.7 實(shí)時(shí)熒光定量PCR
2.2.8 siRNA的構(gòu)建
2.2.9 細(xì)胞轉(zhuǎn)染
2.2.10 克隆形成實(shí)驗(yàn)
2.2.11 CCK-8細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)
2.2.12 流式細(xì)胞術(shù)
2.2.13 細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)
2.2.14 Transwell實(shí)驗(yàn)
3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.1 組織病理結(jié)果
3.1.1 目標(biāo)circ RNA的成功篩選
3.1.2 circ RNA0084893 在胃癌組織中低表達(dá)
3.1.3 circ RNA0084893 與患者臨床組織病理的關(guān)系
3.2 細(xì)胞學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.2.1 circ RNA0084893 在胃癌細(xì)胞中低表達(dá)
3.2.2 轉(zhuǎn)染si RNA后 circ RNA0084893 在胃癌細(xì)胞株中下調(diào)表達(dá)
3.2.3 沉默circ RNA0084893 后促進(jìn)胃癌細(xì)胞增殖
3.2.4 沉默circ RNA0084893 后影響細(xì)胞周期與細(xì)胞凋亡
3.2.5 沉默circ RNA0084893 后促進(jìn)胃癌細(xì)胞遷移及侵襲
3.3 RNA測(cè)序結(jié)果
3.3.1 RNA結(jié)構(gòu)變異分析
3.3.2 RNA表達(dá)差異分析
4 討論
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 競爭性內(nèi)源RNA與消化系統(tǒng)惡性腫瘤的研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
作者簡歷及學(xué)期間所取得的科研成果
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Long non-coding RNAs involved in metastasis of gastric cancer[J]. Meng-Ting Lin,Hao-Jun Song,Xiao-Yun Ding. World Journal of Gastroenterology. 2018(33)
[2]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu. World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[3]中國早期胃癌篩查及內(nèi)鏡診治共識(shí)意見(2014年4月·長沙)[J]. 廖專,孫濤,吳浩,楊帆,鄒文斌. 胃腸病學(xué). 2014(07)
[4]microRNAs and ceRNAs: RNA networks in pathogenesis of cancer[J]. Xiangqian Su,Jiadi Xing,Zaozao Wang,Lei Chen,Ming Cui,Beihai Jiang. Chinese Journal of Cancer Research. 2013(02)
本文編號(hào):3207417
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