背景與目的甲狀腺是位于頸部的蝴蝶形腺體,可分泌多種激素,發(fā)揮調(diào)節(jié)血壓、體溫、心率、代謝和體重等生理功能。甲狀腺癌（TC,Thyroid carcinoma）是最常見的內(nèi)分泌惡性腫瘤之一。近年來,甲狀腺癌在我國及世界范圍內(nèi)的發(fā)病率上升趨勢明顯。目前,細針穿刺細胞學檢測（FNAC,Fine needle aspiration cytology）是美國甲狀腺協(xié)會推薦的標準化臨床操作,為甲狀腺結(jié)節(jié)臨床評估中最準確及經(jīng)濟的方法。然而,約30%的病例得出的細胞學結(jié)果不確定,需要進行部分或完全甲狀腺切除并完成進一步的組織病理學檢查。在臨床上建立更好的早期診斷方法,精準地確定結(jié)節(jié)的良惡性,仍然具有一定的挑戰(zhàn)。發(fā)現(xiàn)并篩選新的具有潛在應用價值的甲狀腺癌生物標志物,提高甲狀腺癌患者早期診斷的精準性,特別是對細胞學結(jié)果不確定患者的術前評估具有重要意義。方法本研究使用WGCNA方法對來源于NCBI表達譜數(shù)據(jù)庫的265例細胞學結(jié)果不確定的甲狀腺結(jié)節(jié)的基因表達譜數(shù)據(jù)進行顯著相關基因分析,從而獲得與惡性組織學特征顯著相關的基因模塊。該結(jié)果進一步在來源于cBioPortal癌癥病例基因組學數(shù)據(jù)庫的3個獨立數(shù)據(jù)集中進行驗... 

【文章來源】：江蘇大學江蘇省

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
中英文注釋表
第一章 緒論
    1.1 甲狀腺癌
        1.1.1 甲狀腺癌介紹
        1.1.2 甲狀腺癌臨床檢查方法
    1.2 甲狀腺癌診斷生物標志物
        1.2.1 生物標志物介紹
        1.2.2 甲狀腺癌常見生物標志物、應用及局限性
    1.3 加權基因共表達網(wǎng)絡分析(WGCNA)
        1.3.1 基本原理
        1.3.2 基本分析流程
        1.3.3 加權基因共表達網(wǎng)絡構(gòu)建
    1.4 本研究的意義
    1.5 主要研究內(nèi)容和技術路線
        1.5.1 主要研究內(nèi)容
        1.5.2 技術路線
第二章 WGCNA方法挖掘甲狀腺癌生物標志物
    2.1 研究材料
    2.2 研究方法
        2.2.1 數(shù)據(jù)預處理
        2.2.2 臨床病例樣本分組
        2.2.3 加權基因共表達網(wǎng)絡的構(gòu)建
    2.3 實驗結(jié)果
        2.3.1 去除離群樣本
        2.3.2 確定軟閾值
        2.3.3 鑒定出與組織學特征相關的基因模塊
    2.4 討論與小結(jié)
第三章 甲狀腺癌潛在生物標志物的數(shù)據(jù)庫驗證
    3.1 研究材料
    3.2 研究方法
        3.2.1 特征基因(藍色模塊中的基因)的表達水平驗證
        3.2.2 藍色模塊基因的GO和 KEGG通路分析
        3.2.3 統(tǒng)計分析
    3.3 實驗結(jié)果
        3.3.1 藍色模塊基因的原數(shù)據(jù)集驗證
        3.3.2 藍色模塊基因的3 個獨立數(shù)據(jù)集驗證
        3.3.3 藍色模塊基因的GO和 KEGG通路分析
    3.4 討論與小結(jié)
第四章 甲狀腺癌生物標志物的細胞學驗證
    4.1 實驗材料
        4.1.1 實驗所需細胞
        4.1.2 實驗儀器及實驗耗材
        4.1.3 實驗所需試劑及配制方法
    4.2 實驗方法
        4.2.1 細胞培養(yǎng)
        4.2.2 細胞傳代
        4.2.3 細胞凍存
        4.2.4 細胞接種
        4.2.5 總RNA提取
        4.2.6 逆轉(zhuǎn)錄
        4.2.7 qRT-PCR
        4.2.8 制備細胞總蛋白
        4.2.9 測定細胞總蛋白濃度
        4.2.10 Western blot檢測目的蛋白含量
        4.2.11 統(tǒng)計分析
    4.3 實驗結(jié)果
        4.3.1 總RNA質(zhì)量檢測
        4.3.2 總RNA定量
        4.3.3 蛋白定量標準曲線
        4.3.4 蛋白濃度
        4.3.5 qRT-PCR驗證甲狀腺癌生物標志物細胞表達
        4.3.6 Western Blot驗證甲狀腺癌生物標志物細胞表達
    4.4 討論與小結(jié)
第五章 臨床數(shù)據(jù)分析惡性甲狀腺癌相關風險因子
    5.1 研究材料
    5.2 研究方法
        5.2.1 臨床樣本預處理
        5.2.2 疾病類型及患者分類
        5.2.3 統(tǒng)計分析
    5.3 研究結(jié)果
        5.3.1 基本臨床信息統(tǒng)計結(jié)果
        5.3.2 危險分型統(tǒng)計結(jié)果
    5.4 討論與小結(jié)
第六章 總結(jié)
參考文獻
致謝
在學期間發(fā)表的學術論文及其他科研成果


【參考文獻】：
期刊論文
[1]Identify the signature genes for diagnose of uveal melanoma by weight gene co-expression network analysis[J]. Kai Shi,Zhi-Tong Bing,Gui-Qun Cao,Ling Guo,Ya-Na Cao,Hai-Ou Jiang,Mei-Xia Zhang.  International Journal of Ophthalmology. 2015(02)



本文編號：3183495