長(zhǎng)鏈非編碼RNA-LCAT1在肺癌發(fā)生發(fā)展中作用機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-04-20 15:39
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lnc RNA)是一類長(zhǎng)度大于200nt的非編碼RNA,基因組中大約只有2%的基因能夠編碼蛋白質(zhì),剩下的約98%的基因并不具有蛋白編碼的功能。近年來(lái)越來(lái)越多的研究表明lnc RNA在多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展中扮演者重要的角色。lnc RNA可以調(diào)控腫瘤細(xì)胞的增殖、細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、血管新生以及細(xì)胞骨架的形成。肺癌是所有癌癥中發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤,肺癌病人的五年生存率仍然保持在15%左右。肺癌的發(fā)病率和死亡率高居不下不僅僅與空氣污染和環(huán)境惡化相關(guān),同樣的也因?yàn)榉伟┑脑谠缙陔y以診斷,缺乏相應(yīng)的早期診斷標(biāo)志物。因此開(kāi)發(fā)肺癌早期診斷標(biāo)志物迫在眉睫。目前,長(zhǎng)鏈非編碼RNA在肺癌發(fā)生中的生物學(xué)功能以及臨床研究意義還不夠清楚。因此研究lnc RNA在肺癌發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)理以及將lnc RNA作為其早期診斷標(biāo)志物有著重要的基礎(chǔ)與臨床研究意義。為探究lnc RNAs在肺癌發(fā)生中扮演的角色,我們首先對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中的485例肺腺癌樣本和56例癌旁樣本的RNA-seq數(shù)據(jù)進(jìn)行l(wèi)nc RNA鑒定和差異表達(dá)分析。我們鑒定篩選出一條新的lnc RNA,命名為...
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:146 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
致謝
中文摘要
英文摘要
縮略詞表
第一部分 :長(zhǎng)鏈非編碼RNA-LCAT1內(nèi)源性競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-4715-5p調(diào)控Rac1/Pak1功能促進(jìn)肺癌的發(fā)生發(fā)展
1 引言
2 材料與方法
2.1 常用儀器和試劑
2.2 主要試劑耗材
2.3 細(xì)胞系和組織樣本
2.4 緩沖液和培養(yǎng)液的配置方法
2.5 實(shí)驗(yàn)方法
3 結(jié)果
3.1 從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼 RNA-LCAT1
3.2 沉默LCAT1抑制在體內(nèi)和體外肺癌細(xì)胞的增殖
3.3 敲低LCAT1可以在體內(nèi)抑制肺癌細(xì)胞的增殖
3.4 LCAT1沉默能在體內(nèi)和體外抑制肺癌細(xì)胞遷移和侵襲
3.5 敲低LCAT1會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞周期阻滯并造成基因表達(dá)譜改變
3.6 LCAT1 作為內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合的RNA起作用(Competing endogenous RNA)
3.7 LCAT1 的生物學(xué)功能至少一部分是通過(guò)調(diào)控miR-4715-5p來(lái)實(shí)現(xiàn)的
3.8 RAC1 作為miR-4715-5p的靶基因受到LCAT1 間接調(diào)控
3.9 RAC1促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲
3.10 LCAT1 通過(guò)吸附miR-4715-5p來(lái)調(diào)控下游RAC1/PAK1 的功能從而促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖以及進(jìn)程
3.11 RAC1抑制劑作為佐劑能夠在體外提高紫杉醇對(duì)肺癌細(xì)胞的殺傷
4 討論
5 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
第二部分 :長(zhǎng)鏈非編碼RNA-LCAT1 通過(guò)調(diào)節(jié)c-Myc功能從而促進(jìn)肺癌細(xì)胞的進(jìn)程
1 引言
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 常用儀器和試劑
2.2 主要試劑耗材
2.3 細(xì)胞系
2.4 實(shí)驗(yàn)方法
3 結(jié)果
3.1 LCAT1與FUBP3 蛋白相互結(jié)合
3.2 FUBP3在肺癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能探究
3.3 si RNA敲低FUBP3 導(dǎo)致c-Myc蛋白水平下降而不影響其m RNA的表達(dá)
3.4 LCAT1 敲低不影響c-Myc的 m RNA表達(dá)卻顯著降低蛋白表達(dá)
3.5 FUBP3 敲低不影響c-Myc蛋白的半衰期
3.6 LCAT1 敲減不改變c-Myc蛋白的穩(wěn)定性
3.7 FUBP3和LCAT1 敲低不影響c-Myc m RNA穩(wěn)定性
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 非編 RNA在腫瘤中作用研究
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷及在學(xué)期間取的科研成果
本文編號(hào):3149954
【文章來(lái)源】:浙江大學(xué)浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:146 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
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第一部分 :長(zhǎng)鏈非編碼RNA-LCAT1內(nèi)源性競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-4715-5p調(diào)控Rac1/Pak1功能促進(jìn)肺癌的發(fā)生發(fā)展
1 引言
2 材料與方法
2.1 常用儀器和試劑
2.2 主要試劑耗材
2.3 細(xì)胞系和組織樣本
2.4 緩沖液和培養(yǎng)液的配置方法
2.5 實(shí)驗(yàn)方法
3 結(jié)果
3.1 從TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼 RNA-LCAT1
3.2 沉默LCAT1抑制在體內(nèi)和體外肺癌細(xì)胞的增殖
3.3 敲低LCAT1可以在體內(nèi)抑制肺癌細(xì)胞的增殖
3.4 LCAT1沉默能在體內(nèi)和體外抑制肺癌細(xì)胞遷移和侵襲
3.5 敲低LCAT1會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞周期阻滯并造成基因表達(dá)譜改變
3.6 LCAT1 作為內(nèi)源競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合的RNA起作用(Competing endogenous RNA)
3.7 LCAT1 的生物學(xué)功能至少一部分是通過(guò)調(diào)控miR-4715-5p來(lái)實(shí)現(xiàn)的
3.8 RAC1 作為miR-4715-5p的靶基因受到LCAT1 間接調(diào)控
3.9 RAC1促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲
3.10 LCAT1 通過(guò)吸附miR-4715-5p來(lái)調(diào)控下游RAC1/PAK1 的功能從而促進(jìn)肺癌細(xì)胞的增殖以及進(jìn)程
3.11 RAC1抑制劑作為佐劑能夠在體外提高紫杉醇對(duì)肺癌細(xì)胞的殺傷
4 討論
5 結(jié)論與展望
參考文獻(xiàn)
第二部分 :長(zhǎng)鏈非編碼RNA-LCAT1 通過(guò)調(diào)節(jié)c-Myc功能從而促進(jìn)肺癌細(xì)胞的進(jìn)程
1 引言
2 實(shí)驗(yàn)材料與方法
2.1 常用儀器和試劑
2.2 主要試劑耗材
2.3 細(xì)胞系
2.4 實(shí)驗(yàn)方法
3 結(jié)果
3.1 LCAT1與FUBP3 蛋白相互結(jié)合
3.2 FUBP3在肺癌細(xì)胞中的生物學(xué)功能探究
3.3 si RNA敲低FUBP3 導(dǎo)致c-Myc蛋白水平下降而不影響其m RNA的表達(dá)
3.4 LCAT1 敲低不影響c-Myc的 m RNA表達(dá)卻顯著降低蛋白表達(dá)
3.5 FUBP3 敲低不影響c-Myc蛋白的半衰期
3.6 LCAT1 敲減不改變c-Myc蛋白的穩(wěn)定性
3.7 FUBP3和LCAT1 敲低不影響c-Myc m RNA穩(wěn)定性
4 討論
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述 非編 RNA在腫瘤中作用研究
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷及在學(xué)期間取的科研成果
本文編號(hào):3149954
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