研究背景和目的:環(huán)狀RNA（circular RNA,circRNAs）是一類不同于線性RNA分子的內源性非編碼RNA,沒有5’末端帽結構和3’末端poly（A）尾,是以共價鍵形成的閉合環(huán)狀結構,其廣泛存在于真核細胞中。研究表明大部分circRNAs分子在不同物種間是保守的,同時由于其具有組織及時空表達特異性、不易受RNA酶降解以及在疾病發(fā)生分子機理和疾病診斷中的重要潛在價值越來越受到大家的重視,近年來已成為繼微小RNA（microRNA,miRNA）和長鏈非編碼RNA（Long non-coding RNA,LncRNA）之后,RNA研究領域的又一全新熱點。原發(fā)性肝癌（Primary Liver Cancer,PLC）是世界第五大常見惡性腫瘤、第三大腫瘤常見死因。根據組織學類型,可將其分為肝細胞肝癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）、膽管細胞癌（cholangiocarcinoma,ICC）和混合型肝癌。其中,HCC是原發(fā)性肝癌的主要組織學類型。我國是肝癌大國,其每年診斷率、新發(fā)病例數以及相關致死率都居高不下。肝癌發(fā)病隱匿,大部分患者出現(xiàn)臨床癥狀時已處于晚期... 

【文章來源】：中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學上海市 211工程院校

【文章頁數】：60 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

高通量測序發(fā)現(xiàn)circRNAs在肝癌和癌旁組織中存在表達差異

2. 聚類基因分析中 circ-ZKSCAN1 在肝癌測序樣本中異常低表達，且與肝癌干性標EpCAM 表達呈負相關。) 肝組織特征 circRNAs 庫。) 10 例肝癌測序樣本 IHC (EpCAM)染色結果圖片（比例尺 100μm）。) mRNA 及 circRNA 在 EpCAMlow和 EpCAMhigh亞組中表達譜聚類。) 聚類基因分析中與肝癌干性標志物 EpCAM 表達呈負相關的所有 circRNAs。以上研究中，我們運用高通量測序技術對 10 對肝癌配對樣本進行了測circRNAs 和 mRNA 表達譜數據，證實 circRNAs 在肝癌和癌旁組織中存之后將肝臟癌旁 circRNAs 表達譜數據與已有其它組織來源的 circRNAs 比較，構建了肝組織特征 circRNAs 庫；進一步利用聚類基因分析篩選出癌干細胞分子表面標志物 EpCAM 呈負相關的 circRNAs，最終從中挑NA-ZKSCAN1 進行深入研究。

海軍軍醫(yī)大學碩士學位論文中腫瘤細胞的增殖有關[30]。在大腦中可以調節(jié)γ-氨基丁酸受體的表達[31]。ZKSCAN1基因可形成多種環(huán)狀 RNA，在我們的測序中，檢測到的是 hsa_circ_0001727；如圖 2A所示，circZKSCAN1是定位于7號染色體ZKSCAN1基因2-3號外顯子內的環(huán)狀RNA。之前 GENES & DEVELOPMENT 有文獻報道其通過使用 ZKSCAN1 基因位于 2 號外顯子上游和 3 號外顯子下游的 Alu 重復序列來實現(xiàn)自身環(huán)化[32]（圖 2B）。而這一結果與我們 circRNA 高通量測序的結果相一致。A


本文編號：3096564