背景:長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）是腫瘤免疫微環(huán)境的重要調(diào)節(jié)劑,并且,lncRNAs可以通過lncRNA-TF-gene調(diào)控網(wǎng)絡(luò)參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控。目的:本研究通過分析腎透明細(xì)胞癌（ccRCC）中差異表達(dá)并與免疫相關(guān)的lncRNAs,尋找與ccRCC診斷和預(yù)后密切相關(guān)的生物標(biāo)志物,并結(jié)合患者臨床特征構(gòu)建預(yù)后模型。方法:這項(xiàng)研究通過從癌癥基因組圖譜（TCGA）中提取了 ccRCC的高通量測序數(shù)據(jù),結(jié)合LncMAP數(shù)據(jù)庫及ImmPort數(shù)據(jù)庫,篩選出被認(rèn)為可能與腫瘤免疫相關(guān)的差異表達(dá)的lncRNAs。使用單變量Cox回歸分析初步評(píng)估了lncRNAs的預(yù)后意義,經(jīng)LASSO Cox回歸進(jìn)一步篩選與預(yù)后相關(guān)的lncRNAs,再由多因素Cox回歸分析計(jì)算回歸系數(shù),風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分公式計(jì)算患者風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分,并將ccRCC患者分為高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組。其中TCGA數(shù)據(jù)集的樣本分為訓(xùn)練集和測試集,分別用于構(gòu)建和驗(yàn)證預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型。結(jié)果:CTA-384D8.34,CTD-2035E11.5,FIRRE 和 RP11-348J24.2 的表達(dá)與腫瘤的T分期,轉(zhuǎn)移,臨床分期和病理分級(jí)均有相關(guān)（P<0.05）,基于4... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖３－１在５３９個(gè)腫瘤組織和７２個(gè)正常組織之間的差異表達(dá)基因的火山圖，藍(lán)點(diǎn)代表下調(diào)，??紅點(diǎn)代表上調(diào)

．。１１個(gè)ＩｎｃＲＮＡ－ＴＦ－ｇｅｎｅ三聯(lián)體（補(bǔ)充表１）。還評(píng)估了?ｃｃＲＣＣ癌組織和正常組織??之間這４個(gè)ＩｎｃＲＮＡｓ的表達(dá)差異。注意到ｃｃＲＣＣ樣品中ＦＩＲＲＥ，?ＲＰ１１－３４８Ｊ２４．２，??ＣＴＡ－３８４Ｄ８．３４和ＣＴＤ－２０３５Ｅ１１．５的表達(dá)水平均明顯癌旁組織較高（圖３－４Ａ；??均Ｐ?＜０．０５）。我們進(jìn)一步分析了這４個(gè)關(guān)鍵ＩｎｃＲＮＡｓ的表達(dá)與臨床病理特征之??間的關(guān)聯(lián)，發(fā)現(xiàn)這４個(gè)ＩｎｃＲＮＡｓ的表達(dá)與腫瘤的Ｔ分期，轉(zhuǎn)移，臨床分期和病??理分級(jí)均有相關(guān)，ＨＲＲＥ、ＣＴＡ－３８４Ｄ８．３４和ＣＴＡ－３８４Ｄ８．３４隨著腫瘤的Ｔ分期，??轉(zhuǎn)移，臨床分期和病理分級(jí)的進(jìn)展而出現(xiàn)表達(dá)上調(diào)，ＲＰ１１－３４８Ｊ２４．２的表達(dá)量則??此變化相反（圖３－４Ｂ、Ｃ、Ｄ、Ｅ；均Ｐ＜０．０５）。??１４

１?００?＇〇〇?／？??＾?１：ｉ—??ｉｌ?＼?！，ｋ?ｆ?，?ｌｕｅ／：?－．；：?．．．Ｋ．??ｒ：ｔｉ＝ｘ?￥－－ｉｊ�。�?＾ｒｕｒ??Ｄ，〇°?Ｅ?＂?Ｆ?！?ｉ?＾一??Ｉｆ??ｌｉ?＼?卜，，．二??Ｌｏ〇？？ｋＰ＜ＯＯＯｌＶ＾?？?‘?／?…?‘一?■?■二??」一：一?�。海В�??Ｇ，。〇ｊ?Ｈ?？?，ｊ?ｉ￣??—。，，：?？－?１?：Ｌ＿＿—－Ｊ－７－??ｌ］〇Ｍ?Ｉ＇＂?ｆ?編??￡?：ｔ＾??圖３－５訓(xùn)練集、測試集及整組集合中４－ｌｎｃＲＮＡ風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分的鑒定和性能評(píng)估。Ａ，在訓(xùn)練集??中使用４－ｌｎｃＲＮＡ風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分對(duì)ｃｃＲＣＣ患者的總體生存進(jìn)行的Ｋ－Ｍ生存曲線分析；Ｂ，訓(xùn)練集??中４－ｌｎｃＲＮＡ風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分的ＲＯＣ曲線分析；Ｃ，訓(xùn)練集中患者的４－ｌｎｃＲＮＡ的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分分布，??存活狀態(tài)和表達(dá)譜，Ｄ，在測試集中使用４－ｌｎｃＲＮＡ風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分對(duì)ｃｃＲＣＣ患者的總體生存進(jìn)行??的Ｋ－Ｍ生存曲線分析；Ｅ，測試集中４－ｌｎｃＲＮＡ風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分的ＲＯＣ曲線分析；Ｆ，測試集中患??者的４－ｌｎｃＲＮＡ的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分分布，存活狀態(tài)和表達(dá)譜，Ｇ，在整組集合中使用４－〖ｎｃＲＮＡ風(fēng)??險(xiǎn)評(píng)分對(duì)ｃｃＲＣＣ患者的總體生存進(jìn)行的Ｋ－Ｍ生存曲線分析；Ｈ，整組集合中４－ｌｎｃＲＮＡ風(fēng)險(xiǎn)??評(píng)分的ＲＯＣ曲線分析；Ｉ，整組集合中患者的４－ｌｎｃＲＮＡ的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分分布，存活狀態(tài)和表達(dá)??譜。??Ｆｉｇｕｒｅ?３－５．?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ａｎｄ?ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ?ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ?ｏｆ?４－ｌｎｃＲＮＡ?ｒｉｓｋ?ｓｃｏｒｅ?ｉｎ?ｔｒａｉｎｉｎｇ，?ｔｅｓｔｉｎｇ，


本文編號(hào)：3088744