利用CRISPR/Cas9系統(tǒng)構(gòu)建HMGA2敲除肝癌細胞系與兔模型
發(fā)布時間:2021-02-27 07:46
研究背景及目的:高遷移率蛋白A2(high-mobilitygroup AT-hook2,HMGA2)屬于高遷移率蛋白超家族成員,是一種非組蛋白染色質(zhì)結(jié)合蛋白。通過三個AT-hook區(qū)高親和力的結(jié)合到基因組中AT富集的區(qū)域,從而改變?nèi)旧|(zhì)的空間構(gòu)象,進而發(fā)揮基因表達調(diào)控功能。HMGA2主要在動物的胚胎期高表達,而在正常成體組織中表達量很低或幾乎不表達,HMGA2突變或缺失的動物表現(xiàn)出嚴重的胎兒發(fā)育阻滯以及明顯的侏儒表型,表明HMGA2主要與動物的胚胎發(fā)育有關(guān),參與動物的生長發(fā)育調(diào)節(jié);此外,研究發(fā)現(xiàn)在大部分腫瘤細胞中HMGA2也相對于癌旁組織高表達,而且參與了腫瘤細胞的增殖、遷移、侵襲等致瘤過程,還與患者的預(yù)后不良有關(guān),表明HMGA2也是一個重要的致癌因子。綜合以上信息,本課題首先探究了 HMGA2在肝癌細胞系HepG2中的作用,檢測HMGA2的失活對于肝癌細胞相關(guān)代謝、生長、增殖的影響;其次,以兔為模式動物,期望采用CRISPR/Cas9系統(tǒng)敲除HMGA2基因制備侏儒兔模型,為實驗動物微型化以及侏儒癥研究提供一種模型動物。研究方法:(1)在人的HMGA2基因第一外顯子和第二外顯子處各設(shè)...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1?HMGA2在不同組織樣本中的表達??Figure?2-1?Different?expression?of?HMGA2?in?different?tumor?tissues??
?頌士學(xué)位論文???2.4.2?sgRNA?設(shè)計??采用在線sgRNA設(shè)計軟件,在人HMGA2基因的第一外顯子與第二外顯子處各設(shè)計??一對sgRNA,分別命名為sgEl和sgE2?(如圖2-2)。為了便于與Bbsl酶切的PX458載體??連接,需在sgRNA正義鏈的5'端添加CACC接頭,反義鏈的3端添加AAAC接頭。此外,??由于sgE2的5端不是以G開頭,為了提高U6啟動子的活性,需在sgE2的5'端額外添加一??個G。最終得到的sgRNA?oligo序列如表2-1所示。??ACAATTAGGAACCAACCGGTGAGCCCTCTCCTAAGAGACCCAGGGGA??TGTTAATCCTTGGrTGGCCACTCGGGAGAGGATTCTCTGGGTCCCCT??—??PAM?sbE2???????El?E2?E3?E4?E5??_?t?—?:.6kb?_??^CAACCTGCCGCCCCAGCGCCTCAGAAGAGAGGACGCGGCCGCCCCAGG??GTTGGACGGCGGGGTCGCGGAGTCTTCTCTCCTGCGCCGGCGGGGTCC??PAM??圖2-2?sgRNA位點??Figure?2-2?The?locus?of?sgRNA??表2-1?sgRNA?oligo序列??Table?2-11'he?sequence?of?sgRNA?oligo??序列名稱?序列(5'—3')??Name?Sequence?(5’—3')??sgEl-T?CACCGTCCTCTCTTCTGAGGCGCT??sgEl-B?AAACAGCGCCTCAGAAGAGA
圖2-3?PX458酶切結(jié)果(M:?DL15000marker,?Linel:PX458,Line2:PX458酶切)??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]高遷移率族蛋白A2與原發(fā)性肝細胞癌患者臨床病理特征及其預(yù)后的關(guān)系[J]. 楊晉,夏先明,賀凱,張孟瑜,馮春紅,秦蜀. 中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2019(24)
[2]PCOS易感基因Hmga2在小鼠子宮蛻膜化中的表達與調(diào)節(jié)[J]. 曹永芝,趙躍然,林德貴. 中國實驗動物學(xué)報. 2017(05)
本文編號:3053919
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1?HMGA2在不同組織樣本中的表達??Figure?2-1?Different?expression?of?HMGA2?in?different?tumor?tissues??
?頌士學(xué)位論文???2.4.2?sgRNA?設(shè)計??采用在線sgRNA設(shè)計軟件,在人HMGA2基因的第一外顯子與第二外顯子處各設(shè)計??一對sgRNA,分別命名為sgEl和sgE2?(如圖2-2)。為了便于與Bbsl酶切的PX458載體??連接,需在sgRNA正義鏈的5'端添加CACC接頭,反義鏈的3端添加AAAC接頭。此外,??由于sgE2的5端不是以G開頭,為了提高U6啟動子的活性,需在sgE2的5'端額外添加一??個G。最終得到的sgRNA?oligo序列如表2-1所示。??ACAATTAGGAACCAACCGGTGAGCCCTCTCCTAAGAGACCCAGGGGA??TGTTAATCCTTGGrTGGCCACTCGGGAGAGGATTCTCTGGGTCCCCT??—??PAM?sbE2???????El?E2?E3?E4?E5??_?t?—?:.6kb?_??^CAACCTGCCGCCCCAGCGCCTCAGAAGAGAGGACGCGGCCGCCCCAGG??GTTGGACGGCGGGGTCGCGGAGTCTTCTCTCCTGCGCCGGCGGGGTCC??PAM??圖2-2?sgRNA位點??Figure?2-2?The?locus?of?sgRNA??表2-1?sgRNA?oligo序列??Table?2-11'he?sequence?of?sgRNA?oligo??序列名稱?序列(5'—3')??Name?Sequence?(5’—3')??sgEl-T?CACCGTCCTCTCTTCTGAGGCGCT??sgEl-B?AAACAGCGCCTCAGAAGAGA
圖2-3?PX458酶切結(jié)果(M:?DL15000marker,?Linel:PX458,Line2:PX458酶切)??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]高遷移率族蛋白A2與原發(fā)性肝細胞癌患者臨床病理特征及其預(yù)后的關(guān)系[J]. 楊晉,夏先明,賀凱,張孟瑜,馮春紅,秦蜀. 中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志. 2019(24)
[2]PCOS易感基因Hmga2在小鼠子宮蛻膜化中的表達與調(diào)節(jié)[J]. 曹永芝,趙躍然,林德貴. 中國實驗動物學(xué)報. 2017(05)
本文編號:3053919
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/zlx/3053919.html
最近更新
教材專著