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人的ARID1A啟動子區(qū)域G-四鏈體結(jié)構(gòu)的鑒定及其功能的研究

發(fā)布時間:2021-02-04 12:21
  人的ARID1A是SWI/SNF家族的一員,在調(diào)節(jié)染色體結(jié)構(gòu)和基因的表達(dá)方面發(fā)揮著重要作用。ARID1A的抑癌作用已經(jīng)被明確確定,其轉(zhuǎn)錄活性在很多腫瘤中都被抑制。在腫瘤細(xì)胞中,ARID1A表達(dá)的下調(diào)可能與基因組缺失、DNA甲基化和microRNA介導(dǎo)的抑制作用有關(guān),能否將恢復(fù)ARID1A的轉(zhuǎn)錄活性作為抗癌藥物的研制思路有待證實(shí)。G-四鏈體結(jié)構(gòu)廣泛存在于基因組中,對染色體DNA復(fù)制和RNA剪切及其穩(wěn)定性等方面有重要的調(diào)節(jié)作用,而靶向存在于啟動子區(qū)域G-四鏈體結(jié)構(gòu)治療疾病的研究并不多,還有很大的研究空間。在本研究中我們利用多種實(shí)驗(yàn)方法證實(shí)了在ARID1A啟動子區(qū)域形成了 G-四鏈體結(jié)構(gòu),同時發(fā)現(xiàn)G-四鏈體結(jié)構(gòu)可以激活A(yù)RID1A基因轉(zhuǎn)錄,以此提供了一種治療癌癥的思路。具體研究結(jié)果如下:1.利用QGRS Mapper方法預(yù)測到人的ARID1A啟動子區(qū)域可能存在G-四鏈體結(jié)構(gòu);根據(jù)ARID1A啟動子可能形成G-四鏈體區(qū)域的序列合成寡核苷酸,通過圓二色性以及熱穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)評估了對這些寡核苷酸形成G-四鏈體的影響,利用非變性聚丙烯凝膠電泳,驗(yàn)證不同條件下這些寡核苷酸形成結(jié)構(gòu)差異:染色質(zhì)免疫共沉淀證實(shí)... 

【文章來源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:115 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

人的ARID1A啟動子區(qū)域G-四鏈體結(jié)構(gòu)的鑒定及其功能的研究


圖1-1?G-四鏈體的模式圖[74】??

過程圖,鏈體,橙色,過程


?復(fù)制過程中發(fā)生的錯誤。當(dāng)解旋酶的作用失調(diào)時,基因組編碼信息的完整性會受到影??響,這不僅會導(dǎo)致復(fù)制或者轉(zhuǎn)錄發(fā)生錯誤,還會引起細(xì)胞衰老、死亡、癌變、組織水平??的老化以及神經(jīng)相關(guān)的病變[74]。某些轉(zhuǎn)朵丨A:]子的結(jié)合位點(diǎn)與形成G-四鏈體區(qū)域的部分??序列相同,因此這些調(diào)控因子對基因表達(dá)的調(diào)節(jié)會受到啟動子K域是否形成G-四鏈體??結(jié)構(gòu)的影響,這些G-四鏈體結(jié)構(gòu)對基因的調(diào)節(jié)有可能是促進(jìn)作用(作為轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)??合位點(diǎn))也有可能是抑制作用(作為一種屏障或者破壞雙鏈結(jié)合位點(diǎn))[1()7](圖1-2)。??A?'⑶?8??I?v?11?tTtttttttttttttttt?tttttttttttttttt?'iVVWVii?rTT^^^^TTTm??tlllllillllllllllillllllllllllillllllll?1?i?金?I?1?I?1?I?I?I?皇?I?I?1?I?I?I?1?1?1?I?I?1?I?I?1?1?童?I?i?i?里?I?I??Itj??c?m.?d??1?'?*?*?k?'?'?1?'?'?'?1???i???1?'?'?、’?pTTTTTTTTTTTTT?iWIiiHiiiIIiiIiiT?^TT?.TTTTTTTTTTTTT??liilllii?里?1魚量.11111皇1息1?魚魚???tiiii?皇?iiiiii??圖1-2?DNA的G-四鏈體結(jié)構(gòu)在RNA聚合酶參與轉(zhuǎn)錄過程中可能#在的作用[74】??A.?[?11斷轉(zhuǎn)泌(橙色表。遥危辆酆厦福。B.促進(jìn)轉(zhuǎn)珙。C.激活轉(zhuǎn)氽(藍(lán)色表示與G-四鏈體結(jié)合的轉(zhuǎn)??錄因子)。D.轉(zhuǎn)錄抑制:G-四鏈體結(jié)構(gòu)iif以結(jié)合轉(zhuǎn)氽抑制蛋白(綠色)

示意圖,解旋,結(jié)構(gòu)域,結(jié)合區(qū)


植物的同源結(jié)構(gòu)一鋅指結(jié)構(gòu)域,并且都是作為??核小體重塑以及組蛋白脫乙酰酶復(fù)合物中的亞基發(fā)揮作用的[114,?116]。而第三個亞科包括??CHD5、CHD6、CHD7、CHD8和CHD9[U1]。CHD家族的大多數(shù)基因在人類組織中廣??泛表達(dá),但是這里只有CHD5的表達(dá)主要局限于神經(jīng)元中[114__。??1.4.2.2?CHD2與CHD8的生物功能??CHD2作為一種ATP依賴性酶,可以重塑染色質(zhì)結(jié)構(gòu)[117]。CHD2由N端的兩個功??能域、一個ATP結(jié)合域和一個DNA結(jié)合域構(gòu)成(圖1-3)。通過研宄發(fā)現(xiàn)CHD2的N-??末端區(qū)域是CHD2發(fā)揮染色質(zhì)重塑功能的必須結(jié)構(gòu)域。CHD2現(xiàn)在己經(jīng)廣泛被用作癲癇??病基因鑒定的靶基因,尤其是兒童期嚴(yán)重癲癇病的發(fā)作與CHD2基因缺失密不可分??[118]。含有CHD2基因突變的純合子小鼠會死亡,雜合子小鼠的存活率也會顯著的降低??[119]。利用基因敲除技術(shù)產(chǎn)生的CHD2基因雜合的斑馬魚會發(fā)生癲癇并且生長發(fā)育遲緩??[12<)]。在人類中,CHD2雜合的患者有多種發(fā)育缺陷[121]。對人成肌細(xì)胞中CHD2的研宄??發(fā)現(xiàn),如果CHD2缺失會降低成肌細(xì)胞向肌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化過程t122L這些發(fā)現(xiàn)表明了??CHD2在人和動物的生長發(fā)育過程中非常重要。??1?1828??Chromodomains?ATP-helicase?domain??DEDX-helicase?domain??圖1-3?CHD2蛋白結(jié)構(gòu)示意圖[1231??兩個染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域(Chromodomains),兩個解旋酶結(jié)合區(qū)(ATP-helicase?domain和DEDX-helicase??domain),?一個D

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3018299

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