FNDC3B circular RNA通過(guò)調(diào)控CD44的表達(dá)促進(jìn)胃癌細(xì)胞遷移和侵襲
發(fā)布時(shí)間:2021-01-14 08:30
目的:環(huán)狀RNA(circRNA)是一類由5’和3’末端共價(jià)連接形成的環(huán)狀RNA分子,研究表明其在人類癌癥中起著重要的調(diào)控作用,但circRNA在胃癌中的相關(guān)研究仍鮮少報(bào)道。本研究發(fā)現(xiàn)FND3B環(huán)狀RNA(circFNDC3B)表達(dá)水平在胃癌組織中下降,提示circFNDC3B在胃癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中可能發(fā)揮著重要的作用。因此,本文以兩種具有不同的circFNDC3B表達(dá)水平的胃癌細(xì)胞為主要的研究對(duì)象來(lái)探索circFNDC3B在胃癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的作用與分子機(jī)制。方法:首先,利用qRT-PCR驗(yàn)證circFNDC3B在胃癌臨床樣本和胃癌細(xì)胞系中的表達(dá)水平;其次,采用無(wú)縫克隆技術(shù)構(gòu)建circFNDC3B過(guò)表達(dá)載體和siRNA技術(shù)分別對(duì)MGC-803細(xì)胞和BGC-823細(xì)胞進(jìn)行circFNDC3B表達(dá)水平的介入干擾,再通過(guò)一系列western blot、劃痕實(shí)驗(yàn)、transwell實(shí)驗(yàn)和qRT-PCR等實(shí)驗(yàn)對(duì)circFNDC3B在胃癌細(xì)胞中的表型和功能作用進(jìn)行探究;最后,采用RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀分析(RIP)和RNApull-down實(shí)驗(yàn)分析證實(shí)circFNDC3B與IGF2BP3、CD44...
【文章來(lái)源】:廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.?circRNAs生物合成模型
雙鏈RNA通過(guò)解鎖莖環(huán)結(jié)構(gòu)以拮抗circRNAs的生物發(fā)生[18]。隨著探索circRNAs??生物合成的持續(xù)進(jìn)展,張等人提出了類似于可變剪接的可變環(huán)化模型以系統(tǒng)性地??解釋circRNAs的生成機(jī)制[7](如圖2所示)。在RNA配對(duì)過(guò)程中,重復(fù)或非重??復(fù)的側(cè)翼內(nèi)含子互補(bǔ)序列的競(jìng)爭(zhēng)會(huì)影響剪接選擇和外顯子環(huán)化,且橫跨于側(cè)翼內(nèi)??含子的互補(bǔ)序列可明顯促進(jìn)外顯子的環(huán)化。反向互補(bǔ)序列可以導(dǎo)致多個(gè)circRNAs??來(lái)源于同一個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄本。由于互補(bǔ)序列在不同物種間的分布不同,可變環(huán)化??可導(dǎo)致物種之間的特異性環(huán)化;パa(bǔ)序列的存在可促進(jìn)轉(zhuǎn)錄本通過(guò)可變環(huán)化形成??circRNAs,但互補(bǔ)序列對(duì)于外顯子環(huán)化來(lái)說(shuō)是必要但不充分條件[7],這個(gè)模型暗??示可變環(huán)化的復(fù)雜性和circRNAs的多樣性,且一定程度上可能受其他因素的影??響,如RBPs正向或負(fù)向調(diào)控circRNAs的形成[5]。??2??
利用qRT-PCR檢測(cè)5種胃癌細(xì)胞系(GES-l,AGS,SGC-7901,??MGC-803,?BGC-823)中?circFNDC3B?表達(dá)水平的差異,發(fā)現(xiàn)?circFNDC3B?的表??達(dá)水平在不同細(xì)胞系中呈現(xiàn)出不同的表達(dá)水平,結(jié)果如圖3.2所示。SGC-7901??細(xì)胞和MGC-803細(xì)胞中circFNDC3B的表達(dá)水平明顯低于GES-1細(xì)胞(正常胃??粘膜細(xì)胞系),分別為p<〇.〇〇〇l和P=〇.〇〇32,但BGC-823細(xì)胞的表達(dá)水平卻明??顯高于GES-1細(xì)胞(p=0.0007)。此外,本文還分析了每個(gè)細(xì)胞系中的FNDC3B??mRNA的表達(dá)水平,結(jié)果顯示在MGC-803細(xì)胞中FNDC3B?mRNA明顯增加??32??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu. World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[2]Minute signet ring cell carcinoma occurring in gastric hyperplastic polyp[J]. Shoji Hirasaki,Seiyuu Suzuki,Hiromitsu Kanzaki,Kohei Fujita,Shuji Matsumura,Eiji Matsumoto. World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
[3]Frequent loss of heterozygosity at 8p22 chromosomal region in diffuse type of gastric cancer[J]. Hedayat Allah Hosseini,Ali Ahani,Hamid Galehdari,Ali Mohammad Froughmand,Masoud Hosseini,Abdolrahim Masjedizadeh,Mohammad Reza Zali. World Journal of Gastroenterology. 2007(24)
本文編號(hào):2976572
【文章來(lái)源】:廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.?circRNAs生物合成模型
雙鏈RNA通過(guò)解鎖莖環(huán)結(jié)構(gòu)以拮抗circRNAs的生物發(fā)生[18]。隨著探索circRNAs??生物合成的持續(xù)進(jìn)展,張等人提出了類似于可變剪接的可變環(huán)化模型以系統(tǒng)性地??解釋circRNAs的生成機(jī)制[7](如圖2所示)。在RNA配對(duì)過(guò)程中,重復(fù)或非重??復(fù)的側(cè)翼內(nèi)含子互補(bǔ)序列的競(jìng)爭(zhēng)會(huì)影響剪接選擇和外顯子環(huán)化,且橫跨于側(cè)翼內(nèi)??含子的互補(bǔ)序列可明顯促進(jìn)外顯子的環(huán)化。反向互補(bǔ)序列可以導(dǎo)致多個(gè)circRNAs??來(lái)源于同一個(gè)基因的轉(zhuǎn)錄本。由于互補(bǔ)序列在不同物種間的分布不同,可變環(huán)化??可導(dǎo)致物種之間的特異性環(huán)化;パa(bǔ)序列的存在可促進(jìn)轉(zhuǎn)錄本通過(guò)可變環(huán)化形成??circRNAs,但互補(bǔ)序列對(duì)于外顯子環(huán)化來(lái)說(shuō)是必要但不充分條件[7],這個(gè)模型暗??示可變環(huán)化的復(fù)雜性和circRNAs的多樣性,且一定程度上可能受其他因素的影??響,如RBPs正向或負(fù)向調(diào)控circRNAs的形成[5]。??2??
利用qRT-PCR檢測(cè)5種胃癌細(xì)胞系(GES-l,AGS,SGC-7901,??MGC-803,?BGC-823)中?circFNDC3B?表達(dá)水平的差異,發(fā)現(xiàn)?circFNDC3B?的表??達(dá)水平在不同細(xì)胞系中呈現(xiàn)出不同的表達(dá)水平,結(jié)果如圖3.2所示。SGC-7901??細(xì)胞和MGC-803細(xì)胞中circFNDC3B的表達(dá)水平明顯低于GES-1細(xì)胞(正常胃??粘膜細(xì)胞系),分別為p<〇.〇〇〇l和P=〇.〇〇32,但BGC-823細(xì)胞的表達(dá)水平卻明??顯高于GES-1細(xì)胞(p=0.0007)。此外,本文還分析了每個(gè)細(xì)胞系中的FNDC3B??mRNA的表達(dá)水平,結(jié)果顯示在MGC-803細(xì)胞中FNDC3B?mRNA明顯增加??32??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu. World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[2]Minute signet ring cell carcinoma occurring in gastric hyperplastic polyp[J]. Shoji Hirasaki,Seiyuu Suzuki,Hiromitsu Kanzaki,Kohei Fujita,Shuji Matsumura,Eiji Matsumoto. World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
[3]Frequent loss of heterozygosity at 8p22 chromosomal region in diffuse type of gastric cancer[J]. Hedayat Allah Hosseini,Ali Ahani,Hamid Galehdari,Ali Mohammad Froughmand,Masoud Hosseini,Abdolrahim Masjedizadeh,Mohammad Reza Zali. World Journal of Gastroenterology. 2007(24)
本文編號(hào):2976572
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