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胃癌XELOX、肺癌GP化療對腸道微生物的影響及口服地衣芽孢桿菌干預(yù)的研究

發(fā)布時(shí)間:2020-09-07 13:31
   背景及目的:腫瘤化療胃腸道反應(yīng)為一種主要的毒副作用,在臨床上可表現(xiàn)為惡心、嘔吐、腹痛及腹瀉等一系列癥狀。近期的研究提示有的化療藥物相關(guān)腸道毒副反應(yīng)與腸道菌群及其代謝產(chǎn)物改變密切相關(guān)。目前,針對胃癌、肺癌的化療對腸道微生物的影響尚未見詳細(xì)報(bào)道,地衣芽孢桿菌對腫瘤化療期間腸道菌群是否具有保護(hù)作用缺乏研究。本課題研究胃癌、肺癌化療對腸道菌群的影響,以及益生菌制劑地衣芽孢桿菌膠囊(整腸生)在胃癌、肺癌化療過程中對腸道菌群的作用。方法:選取行胃癌術(shù)后輔助化療以及無法手術(shù)治療的非小細(xì)胞肺癌患者各20例。隨后將胃癌及化療患者肺癌化療患者隨機(jī)等分為兩組,其中整腸生組在化療期間全程服用整腸生(地衣芽孢桿菌活菌膠囊),對照組僅給予化療常規(guī)用藥。于化療開始前留取糞便標(biāo)本,此后在化療期間每隔5日、連續(xù)留取患者糞便標(biāo)本。使用PCR法提取糞便標(biāo)本的DNA,隨后采用高通量測序的方法檢測16SrDNA的V4和V5高變區(qū)。首先動(dòng)態(tài)觀察各組患者化療期間腸道菌群結(jié)構(gòu)的變化,隨后分胃癌部分和肺癌部分、分別對比整腸生組和對照組之間不同時(shí)間點(diǎn)上腸道微生物結(jié)構(gòu)變化的差異。統(tǒng)計(jì)軟件使用SPSS 19.0.兩組間均數(shù)的比較使用Student-t方法,多組間的比較采用單因素方差分析(ANOVA)或Post-hoc Tukey檢驗(yàn),隨后再將多個(gè)組之間均數(shù)的差異使用Post-hoc Tukey檢驗(yàn)或Post-hoc Conover-Inman法的方法進(jìn)行兩兩比較。檢驗(yàn)水準(zhǔn)取0.05,當(dāng)P值0.05時(shí)即認(rèn)為結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果:按照研究制定的入組標(biāo)準(zhǔn),共有20名胃癌術(shù)后輔助化療患者以及20名肺癌化療患者入選本項(xiàng)研究。20名胃癌患者及20名肺癌患者分別隨機(jī)為益生菌組及對照組。兩組的各項(xiàng)基線資料無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。兩種腫瘤的整腸生組化療相關(guān)腹瀉的發(fā)生率顯著低于對照組(20% vs 45%,P0.05)。胃癌及肺癌患者在化療的初始階段(即給藥后第5日)腸道菌群的多樣性明顯下降,化療第10日后菌群多樣性有所回升,直至化療末期逐漸恢復(fù)至化療前的水平,化療期間全程服用整腸生可加速患者腸道菌群多樣性的恢復(fù)。整腸生組患者的腸道菌群厚壁菌門豐度顯著高于對照組,而對照組的擬桿菌門豐度要顯著高于益生菌干預(yù)組。在腸道菌群總數(shù)及多樣性下降最為明顯的化療初始期(化療第5日),整腸生組的Prausnitzii菌屬、糞桿菌屬Faecalibacterium、瘤胃球菌屬Ruminococcus以及布氏瘤胃球菌bromii等菌屬等菌的豐度顯著升高,而克雷伯桿菌Klebsiella.大腸桿菌Escherichia coli,腸球菌Enterobacteriaceae,變形桿菌Proteobacteria以及Gamma變形桿菌Gammaproteobacteria等菌的豐度則顯著低于對照組。結(jié)論:1.胃癌XELOX、肺癌GP化療期間給予益生菌制劑地衣芽孢桿菌口服可顯著降低腹瀉癥狀的發(fā)生率;2.化療期間,給藥后第5日腸道菌群多樣性下降最為明顯,給予益生菌制劑地衣芽孢桿菌口服可加速腸道菌群多樣性的恢復(fù);3.給予地衣芽孢桿菌口服可在化療第5日顯著改變腸道菌群的構(gòu)成。
【學(xué)位單位】:中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位年份】:2016
【中圖分類】:R735.2;R734.2
【部分圖文】:

流程圖,生物信息學(xué)分析,流程,產(chǎn)品使用說明書


兩個(gè)樣品間數(shù)P-多樣性的數(shù)值越低,他們之間在物種構(gòu)成比則越為類逡逑,反之亦然。本部分運(yùn)算同樣使用QIIME軟件完成,結(jié)果使用主坐標(biāo)分析命令逡逑圖展示(具體運(yùn)算方法及公式見產(chǎn)品使用說明書)逡逑(4)生物信息學(xué)分析流程及結(jié)果表達(dá)逡逑

曲線,高通量,測序,堿基


圖2.1.糞便樣品的DNA提取結(jié)果(部分展示)逡逑2.高通量測序初步結(jié)果逡逑(1)測序數(shù)據(jù)處理逡逑使用Illumina邋Hiseq高通量測序平臺(tái)所測得的初始數(shù)據(jù)(Raw邋Data)控制后所計(jì)算出的平均末端配對數(shù)(RawP巧:279541;邋Combinednum為2QuaKfied邋為邋235649;邋Nochime邋為邋212496;邋Base邋(nt)邋578963;平均測(AvgNen):254;邋Q20和Q30值分別為98.6和93.3;GC堿基所占的示Clean邋Tags中的中GC堿基的含量)為53.4%。逡逑)稀釋度曲線及Rank邋Abundance曲線逡逑

曲線,序列數(shù),隨機(jī)生成,縱坐標(biāo)


如圖所示,隨著物種組成豐富稱度的增加,曲線越平坦。當(dāng)樣品中相逡逑對豐度在10?"時(shí),曲線的走勢趨于水平。不同樣本在不同的OTUs豐度達(dá)到平臺(tái)逡逑期(圖2.3)。逡逑§1邐r^—邋H逡逑'?邐00?邐0P19逡逑OQ。QP3,逡逑004邐0P22逡逑00?邐?邋V2A逡逑oOlC邋ora邋4逡逑W,邋?邋OPJ,逡逑-on*邋0f>??逡逑009邐?邋an.7逡逑—邐-?邋0i邋1逡逑8 ̄邐0,3邋*邋an?逡逑■邐.邋?邋■邐々邋Ql邋S邐OP91逡逑*邐a邐oi4邐?邋opss逡逑2".??一:邐?邋a"邐QP3,逡逑.?冰私I;::以!邐?邋S;;邋?其;逡逑菱邐-公;邐\邐,巖邋*邋潔,逡逑||邐播?邋^"1品古:勊逡逑I邋冷。海儒义希赶模姡椋榻赃姡迤鳎;;;逡逑著i邐0邐多邋C邐OPO邋一逡逑S邐-?邋OH3?邐FZ3逡逑?邐OP09邋?邋n.*逡逑Sr邐<■/"邐?邋OF%2邋PZA逡逑U邐gm.邐onj邋*邋ns逡逑gg:邐A邋w_4邐n7逡逑5V邐OF15邋P94逡逑I雪邐^—逡逑0邐10000邐20000邐30000邐40000邐50000邐60000逡逑Sequ色nces邋Number逡逑圖2.2稀釋曲線逡逑(橫坐標(biāo)代表隨機(jī)生成的序列數(shù),縱坐標(biāo)代表observed邋species邋number)逡逑33逡逑

【相似文獻(xiàn)】

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2 謝健;累及野放療同步XELOX化療治療胃癌術(shù)后復(fù)發(fā)的臨床研究[D];山東大學(xué);2014年



本文編號(hào):2813404

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