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circSETD3在非小細(xì)胞肺癌吉非替尼獲得性耐藥中的作用研究

發(fā)布時(shí)間:2020-08-22 15:27
【摘要】:目的:研究環(huán)狀RNA分子circSETD3在非小細(xì)胞肺癌吉非替尼獲得性耐藥產(chǎn)生過程中的作用及其分子機(jī)制,為臨床非小細(xì)胞肺癌吉非替尼獲得性耐藥的早期診斷與干預(yù)提供新的生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)。方法:選取吉非替尼敏感性非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株H292(簡稱為H292_S)和PC 9(簡稱為PC 9_S),采用逐步遞增法構(gòu)建吉非替尼獲得性耐藥細(xì)胞模型(分別命名為H292_R和PC 9_R);CCK-8和Western blotting法檢測耐藥前后細(xì)胞對吉非替尼的敏感性變化;RNA測序(RNA sequencing,RNA-seq)法篩選耐藥前后差異表達(dá)的circRNAs;Real-time PCR法驗(yàn)證RNA測序的篩選結(jié)果;構(gòu)建circSETD3過表達(dá)和敲低的非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞模型,通過CCK-8和流式細(xì)胞技術(shù)觀察其對細(xì)胞吉非替尼敏感性的影響;生物信息學(xué)分析及雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)篩選并驗(yàn)證circSETD3與微小RNA(microRNA,miRNA)miR-520h的相互作用;生物信息學(xué)分析、Real-time PCR以及Western blotting法對circSETD3—miR-520h—ABCG2之間的三元關(guān)系進(jìn)行分析鑒定。結(jié)果:1.耐藥前后差異表達(dá)的circRNAs的篩選及驗(yàn)證:Real-time PCR方法驗(yàn)證了6個(gè)共同上調(diào)的circRNAs在敏感株和耐藥株中的表達(dá)情況。結(jié)果表明:has_circ_0000567、has_circ_0000620、has_circ_0000655、has_circ_0006867這4個(gè)環(huán)狀RNA在2種耐藥株中均表達(dá)上調(diào)(P0.05);has_circ_0001147在2種耐藥株中均表達(dá)下調(diào)(P0.05)。其中has_circ_0000567(circSETD3)的差異變化最明顯。2.circSETD3功能研究:CCK-8結(jié)果表明,與陰性對照組相比,circSETD3過表達(dá)會(huì)提高細(xì)胞的生長增殖能力,而circSETD3敲低組細(xì)胞的增殖能力顯著降低。流式細(xì)胞儀檢測結(jié)果表明,與陰性對照組相比,circSETD3過表達(dá)組的細(xì)胞凋亡能力顯著下降,然而circSETD3敲低組的細(xì)胞凋亡能力明顯增強(qiáng)。3.circSETD3作用機(jī)制研究:首先,對circSETD3和miR-520h二元關(guān)系的驗(yàn)證。熒光定量PCR結(jié)果表明,在H292_S和PC 9_S細(xì)胞中過表達(dá)circSETD3后,細(xì)胞中miR-520h的表達(dá)水平均降低;而在H292_R和PC 9_R細(xì)胞中敲低circSETD3后,細(xì)胞中miR-520h的表達(dá)水平均升高。其次,對mi R-520h和ABCG2二元關(guān)系的驗(yàn)證。熒光定量PCR結(jié)果表明,在H292_S和PC 9_S細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-520h mimics后,細(xì)胞中ABCG2的表達(dá)量均降低;而在H292_R和PC 9_R細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-520h inhibitor后,細(xì)胞中ABCG2的表達(dá)量均升高。最后,對circSETD3—miR-520h—ABCG2三元關(guān)系的驗(yàn)證。當(dāng)在H292_S和PC 9_S細(xì)胞中過表達(dá)circSETD3后,ABCG2的表達(dá)水平均升高,在此基礎(chǔ)上轉(zhuǎn)染miR-520h mimics后,ABCG2的表達(dá)水平均降低,其經(jīng)典底物Hoechst 33342的胞內(nèi)蓄積濃度隨之升高;當(dāng)在H292_R和PC 9_R細(xì)胞中干擾circSETD3后,ABCG2的表達(dá)水平均降低,在此基礎(chǔ)上轉(zhuǎn)染miR-520h inhibitor時(shí),ABCG2的表達(dá)水平均升高。結(jié)論:環(huán)狀RNA分子circSETD3在非小細(xì)胞肺癌吉非替尼獲得性耐藥的產(chǎn)生過程中出現(xiàn)表達(dá)上調(diào),降低了細(xì)胞對吉非替尼的藥物敏感性;circSETD3主要通過ceRNA機(jī)制發(fā)揮其生物學(xué)功能:circSETD3通過下調(diào)miR-520h的表達(dá),解除miR-520h對外排性轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白ABCG2的降解作用,從而使ABCG2對細(xì)胞內(nèi)吉非替尼的外排功能增強(qiáng),最終導(dǎo)致吉非替尼獲得性耐藥的產(chǎn)生。
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R734.2
【圖文】:

存活率,細(xì)胞,獲得性耐藥,半數(shù)抑制濃度


3 結(jié)果3.1 吉非替尼獲得性耐藥非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株的驗(yàn)證CCK-8 結(jié)果顯示,吉非替尼對 H292_S 和 H292_R 細(xì)胞生長增殖的半數(shù)抑制濃度(Half maximal inhibitory concentration,IC50)分別為 108.63 nmol/L 和 982.37nmol/L,耐藥指數(shù)為 9.04;吉非替尼對 PC9_S 和 PC9_R 細(xì)胞生長增殖的 IC50值分別為 752.56 nmol/L 和 7875.62 nmol/L,耐藥指數(shù)為 10.5(圖 3.1.1)。Western blotting 結(jié)果表明,與吉非替尼敏感株 H292_S、PC9_S 細(xì)胞相比,耐藥株 H292_R、PC9_R 細(xì)胞用吉非替尼(1.5 μmol/L)處理后,p-EGFR、p-PI3K、p-AKT 表達(dá)下降的幅度顯著減少,而總的 EGFR、PI3K、AKT 表達(dá)量沒有明顯變化(圖 3.1.2)。由于 p-EGFR、p-PI3K、p-AKT 是 EGFR 通路的活化形式,因此該結(jié)果表明在耐藥細(xì)胞 H292_R、PC9_R 中,吉非替尼處理后對 EGFR 信號(hào)通路的抑制功能顯著下降,細(xì)胞對吉非替尼的敏感性顯著降低。

信號(hào)通路,獲得性耐藥,生物信息學(xué)分析,前后差異


圖3.1.2吉非替尼對敏感細(xì)胞(H292_S和PC9_S)和耐藥細(xì)胞(H292_R和PC9_R)EGFR/PI3K/AKT信號(hào)通路的影響Fig 3.1.2 the effects of gefitinib on EGFR/PI3K/AKT signaling pathway in Parental Cells(H292_S and PC9_S)and resistant cells(H292_R and PC9_R)were detected by Westernblotting (*:P<0.05, vs the control group, n=3)3.2 非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株吉非替尼獲得性耐藥前后差異表達(dá) circRNAs的篩選提取吉非替尼敏感性與耐藥性非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株總 RNA,進(jìn)行 RNA-seq 分析。采用 RPM (spliced reads per millon, RPM)法計(jì)算 circRNAs 的表達(dá)量,并利用生物信息學(xué)分析共同繪制差異表達(dá) circRNAs 的火山圖(圖 3.2.1)。圖中灰色為沒有顯著性差異的 circRNA;紅色為顯著性上調(diào)的 circRNAs(P<0.05 且 FC≥2);綠色為顯著性下調(diào)的 circRNAs(P<0.05 且 FC≥2)。RNA-seq 測序結(jié)果表明,

散點(diǎn)圖,差異表達(dá),火山,散點(diǎn)圖


圖 3.2.1 敏感細(xì)胞和耐藥細(xì)胞中差異表達(dá) circRNA 分布的火山散點(diǎn)圖。左:H292_S vs H292_R;右:PC9_S vs PC9_RFig3.2.1 The volcanic scatter plot of the differentially expressed circRNAs in cell lines. Left:H292_S vs H292_R; right: PC9_S vs PC9_R圖 3.2.2 H292_S vs H292_R 中,24 個(gè) circRNA 顯著上調(diào); PC 9_S vs PC 9_R 中,25 個(gè) cirRNA顯著上調(diào),其中有 6 個(gè) cirRNA 共同上調(diào)(P<0.05 且 FC≥2)

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