基于共病的前列腺癌演化研究
發(fā)布時間:2020-07-10 23:15
【摘要】:前列腺癌是西方發(fā)達(dá)國家和地區(qū)發(fā)病率最高的泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤。近年來,在亞洲地區(qū)的發(fā)病率和死亡率也在逐年升高。目前針對前列腺癌的研究大多停留在臨床表型以及診斷治療方法等層面,而對其發(fā)病機制較少;诖,本文從共病的角度,探究心血管疾病、腦血管疾病、糖尿病和膀胱癌對前列腺癌發(fā)生發(fā)展過程的影響。本課題基于系統(tǒng)生物學(xué)思維和理論,從分子、網(wǎng)絡(luò)、信號通路等層次系統(tǒng)分析四種共病與前列腺癌發(fā)生和發(fā)展的相互作用關(guān)系。一方面,選擇對應(yīng)疾病基因芯片表達(dá)數(shù)據(jù),通過T檢驗鑒定差異表達(dá)基因,進(jìn)一步對差異表達(dá)基因進(jìn)行顯著性檢驗和生物功能分析。另一方面,利用WGCNA包構(gòu)建加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),獲得共表達(dá)模塊,通過顯著性分析,得到與疾病相關(guān)的重要模塊,再對模塊內(nèi)基因做功能富集分析。對比分析不同時期前列腺癌與四種共病在基因表達(dá)層面和共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)層面的結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn):在差異表達(dá)基因、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路以及基因本體論方面,這四種共病與前列腺癌轉(zhuǎn)移期的一致性更高,對應(yīng)相同的基因以及通路條目更多,且經(jīng)文獻(xiàn)驗證,這些代謝通路在四種共病和前列腺癌的發(fā)生發(fā)展過程中均發(fā)揮重要的作用;從共病的角度看,膀胱癌與前列腺癌的關(guān)系最為密切,其次是糖尿病,心血管疾病與腦血管疾病與前列腺癌關(guān)系最有限;從前列腺癌的發(fā)病階段看,糖尿病在前列腺癌初期和轉(zhuǎn)移期的變化最大,膀胱癌在前列腺癌初期和轉(zhuǎn)移期的變化和前列腺癌本身的變化趨勢基本一致,心血管疾病和腦血管疾病幾乎都是在轉(zhuǎn)移期前列腺癌才出現(xiàn)。共病在前列腺癌的演化過程中扮演著重要的角色,本課題結(jié)合系統(tǒng)生物學(xué)的方法在分子和系統(tǒng)層面探究前列腺癌與四種共病的關(guān)系,為前列腺癌的發(fā)病機理研究和個性化治療提供了新思路、新方法,具有一定的研究意義和價值。
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R737.25
【圖文】:
但越來越多的臨床實例反映了過度診斷和多度治療對于前列腺癌的危害[11影響臨床判斷的重要因素有年齡[12]、共病[13]、前列腺癌的階段等。共病指數(shù)較高相對年輕以及前列腺癌初期的患者接受激進(jìn)的治療手段的可能性較大[14]。前列腺癌誤判因素多研究顯示,激進(jìn)的治療手段不能使前列腺癌的死亡率顯著降低,而一些沒有接受治療的前列腺癌初期患者生存率反而更高[15]。近年來,共。–omorbidity)作為前列腺癌的風(fēng)險因素受到了越來越多的重視和研究。我們通過 Pubmed 檢索發(fā)現(xiàn),從 1998 年至今,對前列腺癌和共病的研究總體處于上升狀態(tài)(圖 1.1)。研究前列腺癌和共病,更多是為了通過共病指數(shù)對臨床病人死亡率和存活時間進(jìn)行預(yù)期判斷。最常見的兩個共病指數(shù)是 the Charlson ComorbiditIndex(CCI)和 the Elixhauser et al. Comorbidity Measure (ECM)[16]。CCI 是直接通過臨床病人死亡率數(shù)據(jù)獲得 16 種疾病數(shù)據(jù),根據(jù)權(quán)重,計算其對于死亡率的影響ECM 則是通過搜集 30 種共病,觀察著 30 種共病對急性住院患者的短期預(yù)后。
IPA 通路富集條數(shù) 55 26 119 3 13 65 91注:Pca: 前列腺癌(Prostate Cancer, PCa)PCa-BP:前列腺癌初期(Primary Prostate Cancer, PCa-BP)PCa-BM:前列腺癌轉(zhuǎn)移期(Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM)CVD: 心血管疾病(Cardiovascular Disease CVD)CEVD: 腦血管疾。–erebrovascular Disease, CEVD)DM: 糖尿。―iabetes Mellitus, DM)BCa: 膀胱癌(Bladder Cancer, BCa)在獲得顯著性 IPA 通路后,我們將四種共病的顯著性 IPA 通路分別與前列腺癌期和轉(zhuǎn)移期顯著性 IPA 通路進(jìn)行對比分析,獲得共病與前列腺癌初期和轉(zhuǎn)移期重疊通路條目,重點對重疊 IPA 通路進(jìn)行分析。按通路重疊數(shù)量由大到小排列,直觀地示了前列腺癌與四種共病 IPA 通路重疊關(guān)系,從整體上看為:膀胱癌>糖尿病>腦血管疾病>心血管疾病。其中,前列腺癌轉(zhuǎn)移期與四種共病的 IPA 通路重疊數(shù)量均大初期,說明轉(zhuǎn)移期的前列腺癌患者得共病的可能性更大(圖 3.1)。具體初期和轉(zhuǎn)移前列腺癌分別與四種共病共享的 IPA 通路條目見附表 2。
第三章 前列腺癌與共病分子機理研究 基于共病的前列腺癌演化研究表 3.6 KEGG 分析全部數(shù)據(jù)列表PCa PCa-BP PCa-BM CVD CEVD DM BCaKEGG 通路富集條數(shù) 30 12 43 0 3 9 16注:Pca: 前列腺癌(Prostate Cancer, PCa)PCa-BP:前列腺癌初期(Primary Prostate Cancer, PCa-BP)PCa-BM:前列腺癌轉(zhuǎn)移期(Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM)CVD: 心血管疾病(Cardiovascular Disease CVD)CEVD: 腦血管疾。–erebrovascular Disease, CEVD)DM: 糖尿。―iabetes Mellitus, DM)BCa: 膀胱癌(Bladder Cancer, BCa)
本文編號:2749582
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R737.25
【圖文】:
但越來越多的臨床實例反映了過度診斷和多度治療對于前列腺癌的危害[11影響臨床判斷的重要因素有年齡[12]、共病[13]、前列腺癌的階段等。共病指數(shù)較高相對年輕以及前列腺癌初期的患者接受激進(jìn)的治療手段的可能性較大[14]。前列腺癌誤判因素多研究顯示,激進(jìn)的治療手段不能使前列腺癌的死亡率顯著降低,而一些沒有接受治療的前列腺癌初期患者生存率反而更高[15]。近年來,共。–omorbidity)作為前列腺癌的風(fēng)險因素受到了越來越多的重視和研究。我們通過 Pubmed 檢索發(fā)現(xiàn),從 1998 年至今,對前列腺癌和共病的研究總體處于上升狀態(tài)(圖 1.1)。研究前列腺癌和共病,更多是為了通過共病指數(shù)對臨床病人死亡率和存活時間進(jìn)行預(yù)期判斷。最常見的兩個共病指數(shù)是 the Charlson ComorbiditIndex(CCI)和 the Elixhauser et al. Comorbidity Measure (ECM)[16]。CCI 是直接通過臨床病人死亡率數(shù)據(jù)獲得 16 種疾病數(shù)據(jù),根據(jù)權(quán)重,計算其對于死亡率的影響ECM 則是通過搜集 30 種共病,觀察著 30 種共病對急性住院患者的短期預(yù)后。
IPA 通路富集條數(shù) 55 26 119 3 13 65 91注:Pca: 前列腺癌(Prostate Cancer, PCa)PCa-BP:前列腺癌初期(Primary Prostate Cancer, PCa-BP)PCa-BM:前列腺癌轉(zhuǎn)移期(Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM)CVD: 心血管疾病(Cardiovascular Disease CVD)CEVD: 腦血管疾。–erebrovascular Disease, CEVD)DM: 糖尿。―iabetes Mellitus, DM)BCa: 膀胱癌(Bladder Cancer, BCa)在獲得顯著性 IPA 通路后,我們將四種共病的顯著性 IPA 通路分別與前列腺癌期和轉(zhuǎn)移期顯著性 IPA 通路進(jìn)行對比分析,獲得共病與前列腺癌初期和轉(zhuǎn)移期重疊通路條目,重點對重疊 IPA 通路進(jìn)行分析。按通路重疊數(shù)量由大到小排列,直觀地示了前列腺癌與四種共病 IPA 通路重疊關(guān)系,從整體上看為:膀胱癌>糖尿病>腦血管疾病>心血管疾病。其中,前列腺癌轉(zhuǎn)移期與四種共病的 IPA 通路重疊數(shù)量均大初期,說明轉(zhuǎn)移期的前列腺癌患者得共病的可能性更大(圖 3.1)。具體初期和轉(zhuǎn)移前列腺癌分別與四種共病共享的 IPA 通路條目見附表 2。
第三章 前列腺癌與共病分子機理研究 基于共病的前列腺癌演化研究表 3.6 KEGG 分析全部數(shù)據(jù)列表PCa PCa-BP PCa-BM CVD CEVD DM BCaKEGG 通路富集條數(shù) 30 12 43 0 3 9 16注:Pca: 前列腺癌(Prostate Cancer, PCa)PCa-BP:前列腺癌初期(Primary Prostate Cancer, PCa-BP)PCa-BM:前列腺癌轉(zhuǎn)移期(Metastatic Prostate Cancer, PCa-BM)CVD: 心血管疾病(Cardiovascular Disease CVD)CEVD: 腦血管疾。–erebrovascular Disease, CEVD)DM: 糖尿。―iabetes Mellitus, DM)BCa: 膀胱癌(Bladder Cancer, BCa)
【參考文獻(xiàn)】
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1 黨強;周小果;仝建;;前列腺癌相關(guān)長鏈非編碼RNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物1在非小細(xì)胞肺癌組織中的表達(dá)及意義[J];中華實驗外科雜志;2016年05期
2 王斌;王超;李晶;;大差異網(wǎng)絡(luò)異常數(shù)據(jù)特征檢測算法的仿真分析[J];計算機仿真;2013年08期
3 王耀珍;張志利;;糖尿病腎病發(fā)病機制的研究進(jìn)展[J];中國藥物與臨床;2008年01期
4 劉靜,趙冬,秦蘭萍,王薇,吳桂賢,曾哲淳,王文化,吳兆蘇;低密度脂蛋白膽固醇與心血管病發(fā)病關(guān)系的前瞻性研究[J];中華心血管病雜志;2001年09期
本文編號:2749582
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