轉(zhuǎn)錄因子SLAP2在乳腺癌發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2020-06-19 15:33
【摘要】:第一部分轉(zhuǎn)錄因子SLAP2調(diào)控基因預(yù)測(cè)乳腺癌患者的生存率目的:本部分旨在探討乳腺癌患者腫瘤發(fā)生相關(guān)分子的表達(dá)改變與乳腺癌患者生存率的相關(guān)性。方法:本部分研究中的基因表達(dá)與臨床信息資料來(lái)源于GSE62944庫(kù)中1119例乳腺癌標(biāo)本和113例正常乳腺標(biāo)本。本次研究通過(guò)Cox得分來(lái)評(píng)價(jià)表達(dá)顯著改變的蛋白,從而探討基因表達(dá)與患者生存率的相關(guān)性。結(jié)果:首先,獲得最大Cox評(píng)分的mRNAs進(jìn)一步將患者分為4個(gè)亞組。在本次研究中,我們共獲得了 12019個(gè)差異表達(dá)的基因,通過(guò)共表達(dá)分析揭示各模塊之間不同亞群的改變情況。基于以上研究,我們構(gòu)建了轉(zhuǎn)錄因子(TF)調(diào)控網(wǎng)絡(luò),進(jìn)而發(fā)現(xiàn)與癌癥生存相關(guān)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子。按照Cox評(píng)分最高的25個(gè)基因,我們將所有樣本分為4個(gè)亞組。這4個(gè)亞組的生存曲線有顯著差異,根據(jù)不同的存活曲線,我們篩選了將1、2、4亞組來(lái)進(jìn)一步探討下游的分子機(jī)制。然后,共表達(dá)模塊分析表明,其適應(yīng)性免疫反應(yīng)的基因可以用于分析三個(gè)亞組之間的生存差異。結(jié)果顯示差異表達(dá)最明顯的25個(gè)基因都可以被轉(zhuǎn)錄因子SLAP2所調(diào)節(jié)。SLAP2在預(yù)測(cè)乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中有較強(qiáng)的靈敏性。結(jié)論:結(jié)果表明,參與適應(yīng)性免疫應(yīng)答的轉(zhuǎn)錄因子SLAP2所調(diào)節(jié)的基因與乳腺癌患者的生存率相關(guān)。第二部分SLAP2通過(guò)抑制mTOR通路調(diào)控乳腺癌的惡性發(fā)展目的:近些年來(lái),乳腺癌的治療技術(shù)已經(jīng)發(fā)生了很大的提高和進(jìn)步,大多數(shù)乳腺癌患者通過(guò)手術(shù)、放療、化療、內(nèi)分泌治療及分子靶向治療等手段,預(yù)后得到了極大的改善。但是,仍然有很多乳腺癌患者遭受腫瘤復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移的困擾。積極尋求新的乳腺癌治療的方法及克服腫瘤耐藥性等問(wèn)題,成為當(dāng)前乳腺癌治療的焦點(diǎn)。Src類似接頭蛋白(Src-like adaptor protein,SLAP)在各種類型細(xì)胞中廣泛表達(dá),但在淋巴細(xì)胞中研究最為深入。SLAP主要包含兩個(gè)異構(gòu)體,SLAPl和SLAP2。基于上一章的研究結(jié)果,SLAP2可以更好的預(yù)測(cè)乳腺癌的生存率,因此,本文主要探討SLAP2在乳腺癌發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制。方法:首先,我們用real time PCR和western blot的方法檢測(cè)了乳腺癌組織與正常對(duì)照中SLAP2的mRNA和蛋白水平。同時(shí),在MDA-MB-231細(xì)胞中,通過(guò)腺病毒載體高低表達(dá)SLAP2,檢測(cè)其對(duì)腫瘤細(xì)胞惡性增殖、遷移、侵襲、凋亡的影響。此外,我們還進(jìn)一部探討了 SLAP2表達(dá)異常對(duì)mTOR信號(hào)通路活化的影響。結(jié)果:首先,與正常對(duì)照相比,在乳腺癌樣本中,SLAP2的mRNA和蛋白水平都明顯降低。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn),乳腺癌細(xì)胞中降低SLAP2的表達(dá),可以顯著促進(jìn)mTOR信號(hào)通路的活化,從而引起乳腺癌細(xì)胞MDA-MB-231的惡性增殖、遷移和侵襲,并降低乳腺癌細(xì)胞的凋亡水平。與此相反,乳腺癌細(xì)胞中過(guò)表達(dá)SLAP2可以顯著抑制mTOR通路的活化,降低MDA-MB-231細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力,并誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞發(fā)生凋亡。結(jié)論:結(jié)果表明,在乳腺癌的發(fā)生與發(fā)展過(guò)程中,SLAP2是一個(gè)抑癌因子,其作用機(jī)制主要通過(guò)抑制mTOR信號(hào)通路活化,從而阻礙乳腺癌的惡性發(fā)展。這些結(jié)果提示我們,SLAP2可能是未來(lái)乳腺癌治療的一個(gè)潛在靶標(biāo)。
【學(xué)位授予單位】:武漢大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R737.9
【圖文】:
3.2共表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)與不同預(yù)后相關(guān)的模塊逡逑為/找到與患者牛存相關(guān)的井表達(dá)模塊,我們進(jìn)行/邋DEGS和共表達(dá)分析。逡逑首先,DEGs分析了丨,2和4亞俎,共〖2019個(gè)DEGs被發(fā)現(xiàn)(圖2-2A)。在構(gòu)逡逑建/共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)在差異表達(dá)基因中共發(fā)現(xiàn)/邋23個(gè)共表達(dá)功能模塊。這些功逡逑能模塊包括㈣種細(xì)胞質(zhì)膜-膜粘附模塊、肽類激素分泌調(diào)節(jié)模塊、免疫砬答自適逡逑應(yīng)模塊和脂肪酸的生物合成模塊(圖2-2B)。其中,有560個(gè)基因參與適應(yīng)性免逡逑疫應(yīng)答,36個(gè)基因?qū)儆谕N細(xì)胞黏附分子,63個(gè)基因負(fù)責(zé)脂肪酸生物合成過(guò)程逡逑中,59個(gè)基因調(diào)節(jié)肽激素分泌(圖2-2C)?傊,研究結(jié)果提示,差異表達(dá)基因逡逑共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)綜合分析可以進(jìn)一步縮小搜索范圍并有助于發(fā)現(xiàn)有意義的模塊空間。逡逑19逡逑
我們構(gòu)建了基于整個(gè)數(shù)據(jù)集的轉(zhuǎn)錄因子網(wǎng)絡(luò)。上述四個(gè)模塊中的基因己成為關(guān)注逡逑的焦點(diǎn)。在適應(yīng)性免疫應(yīng)答基因的共表達(dá)分析模塊中,有29個(gè)轉(zhuǎn)錄因子與至少逡逑10個(gè)靶基因調(diào)控的信號(hào)通路相關(guān)(圖2-3A)。有趣的是,其中兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,即逡逑SLAP2和干擾素調(diào)節(jié)因子(IRF),可以獨(dú)立調(diào)節(jié)大部分基因。在脂肪酸生物合逡逑成過(guò)程的模塊中,32個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可以共同調(diào)控這一模塊(圖2-3B)。然而,32逡逑個(gè)轉(zhuǎn)錄因子中的26個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可以在這一模塊中控制2-3個(gè)靶基因。通過(guò)富集逡逑分析轉(zhuǎn)錄因子共同調(diào)節(jié)基因分析發(fā)現(xiàn),6個(gè)肽激素的分泌調(diào)節(jié)模塊和9個(gè)在細(xì)胞逡逑膜粘附分子中具有調(diào)節(jié)作用的轉(zhuǎn)錄因子被發(fā)現(xiàn)(圖2-3C和2-3D)?偟膩(lái)說(shuō),逡逑結(jié)果表明,轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控的共表達(dá)模塊可能在患者生存率中起著重要作用。逡逑20逡逑
本文編號(hào):2720990
【學(xué)位授予單位】:武漢大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R737.9
【圖文】:
3.2共表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)與不同預(yù)后相關(guān)的模塊逡逑為/找到與患者牛存相關(guān)的井表達(dá)模塊,我們進(jìn)行/邋DEGS和共表達(dá)分析。逡逑首先,DEGs分析了丨,2和4亞俎,共〖2019個(gè)DEGs被發(fā)現(xiàn)(圖2-2A)。在構(gòu)逡逑建/共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)在差異表達(dá)基因中共發(fā)現(xiàn)/邋23個(gè)共表達(dá)功能模塊。這些功逡逑能模塊包括㈣種細(xì)胞質(zhì)膜-膜粘附模塊、肽類激素分泌調(diào)節(jié)模塊、免疫砬答自適逡逑應(yīng)模塊和脂肪酸的生物合成模塊(圖2-2B)。其中,有560個(gè)基因參與適應(yīng)性免逡逑疫應(yīng)答,36個(gè)基因?qū)儆谕N細(xì)胞黏附分子,63個(gè)基因負(fù)責(zé)脂肪酸生物合成過(guò)程逡逑中,59個(gè)基因調(diào)節(jié)肽激素分泌(圖2-2C)?傊,研究結(jié)果提示,差異表達(dá)基因逡逑共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)綜合分析可以進(jìn)一步縮小搜索范圍并有助于發(fā)現(xiàn)有意義的模塊空間。逡逑19逡逑
我們構(gòu)建了基于整個(gè)數(shù)據(jù)集的轉(zhuǎn)錄因子網(wǎng)絡(luò)。上述四個(gè)模塊中的基因己成為關(guān)注逡逑的焦點(diǎn)。在適應(yīng)性免疫應(yīng)答基因的共表達(dá)分析模塊中,有29個(gè)轉(zhuǎn)錄因子與至少逡逑10個(gè)靶基因調(diào)控的信號(hào)通路相關(guān)(圖2-3A)。有趣的是,其中兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,即逡逑SLAP2和干擾素調(diào)節(jié)因子(IRF),可以獨(dú)立調(diào)節(jié)大部分基因。在脂肪酸生物合逡逑成過(guò)程的模塊中,32個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可以共同調(diào)控這一模塊(圖2-3B)。然而,32逡逑個(gè)轉(zhuǎn)錄因子中的26個(gè)轉(zhuǎn)錄因子可以在這一模塊中控制2-3個(gè)靶基因。通過(guò)富集逡逑分析轉(zhuǎn)錄因子共同調(diào)節(jié)基因分析發(fā)現(xiàn),6個(gè)肽激素的分泌調(diào)節(jié)模塊和9個(gè)在細(xì)胞逡逑膜粘附分子中具有調(diào)節(jié)作用的轉(zhuǎn)錄因子被發(fā)現(xiàn)(圖2-3C和2-3D)?偟膩(lái)說(shuō),逡逑結(jié)果表明,轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控的共表達(dá)模塊可能在患者生存率中起著重要作用。逡逑20逡逑
【參考文獻(xiàn)】
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1 Joycelyn JX Lee;Kiley Loh;Yoon-Sim Yap;;PI3K/Akt/mTOR inhibitors in breast cancer[J];Cancer Biology & Medicine;2015年04期
2 劉民鋒;郭昭澤;董建宇;楊翼鵬;嵇健;劉潤(rùn)奇;延艷;葉長(zhǎng)生;;pcDNA3.1-mTOR質(zhì)粒體外轉(zhuǎn)染對(duì)乳腺癌細(xì)胞生長(zhǎng)的影響[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2015年02期
本文編號(hào):2720990
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