【摘要】：目的:通過(guò)對(duì)漢族、維吾爾族局部晚期或晚期食管鱗癌患者放化療前后、近期及遠(yuǎn)期療效血清蛋白的比較,探討兩個(gè)民族血清差異蛋白的表達(dá)特征,并初步篩選預(yù)測(cè)放化療近期及遠(yuǎn)期療效的差異血清蛋白并行相關(guān)通路分析。方法:1、納入局部晚期食管鱗癌漢族、維吾爾族分別35例、28例,正規(guī)放化療,療效評(píng)價(jià)及隨訪;同時(shí)采集患者治療前后的外周血。以健康體檢者作為對(duì)照組。2、各組血清利用i TRAQ技術(shù)進(jìn)行肽段標(biāo)記,利用PD軟件進(jìn)行質(zhì)譜譜圖的篩選,提取后的譜圖用mascot進(jìn)行檢索,并通過(guò)PD軟件進(jìn)一步定量分析,通過(guò)R軟件按照不同的分組篩選差異蛋白,將差異或目標(biāo)蛋白檢索功能數(shù)據(jù)庫(kù)的相關(guān)信息,進(jìn)行生物功能富集分析。結(jié)果:1.漢族、維族食管癌血清蛋白的差異表達(dá)特征:(1)漢族放化療前有46個(gè)血清差異蛋白,放化療后共有22個(gè)血清差異蛋白,放化療前對(duì)比放化療后共有21個(gè)血清差異蛋白;通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)的篩選及驗(yàn)證,選擇出差異倍數(shù)1.5-2倍,差異顯著且有意義的蛋白有血小板因子4(PLF4)、半乳糖結(jié)合凝集素-3結(jié)合蛋白(LG3BP)、分泌磷蛋白24(SPP24)、鋅-α-2-糖蛋白(ZA2G)、絲切蛋白(COF1)、C-反應(yīng)蛋白(CRP);(2)維吾爾族放化療前有105個(gè)血清差異蛋白,放化療后共有114個(gè)血清差異蛋白,放化療前對(duì)比放化療后共有24個(gè)血清差異蛋白。通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)的篩選及驗(yàn)證,選擇出差異倍數(shù)1.5-2倍,差異顯著且有意義的蛋白有轉(zhuǎn)鐵蛋白變體、激肽原1(KNG1)、間-α-胰蛋白酶抑制劑重鏈H1和H2、血清淀粉樣蛋白A(SAA)、組蛋白、胰島素樣生長(zhǎng)因子(insulin-like growth factor,IGF)、富含組氨酸糖蛋白(HRG)、脂多糖結(jié)合蛋白(LBP)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH);2.漢族、維族食管癌療效相關(guān)差異蛋白的表達(dá)特征:(1)漢族放化療后近期療效無(wú)效組與近期療效有效組比對(duì),共篩選出17個(gè)差異蛋白;OS:1~2年組的食管癌患者有15人,OS:2~3年組的食管癌患者有12人,共篩選出10個(gè)差異蛋白,且均是下調(diào)蛋白;OS:1~2年組的食管癌患者有15人,OS3年組的食管癌患者有8人,共篩選出10個(gè)差異蛋白;通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)的篩選及驗(yàn)證,選擇出差異倍數(shù)1.5-2倍,差異顯著且有意義的蛋白有聚合物免疫球蛋白受體(PIGR)、脂肪細(xì)胞因子、絲氨酸蛋白酶抑制劑、α-酸性糖蛋白、結(jié)合珠蛋白。(2)維吾爾族放化療后近期療效無(wú)效組與近期療效有效組比對(duì),共篩選出75個(gè)差異蛋白,PFS大于1年組的食管癌患者有16人,PFS小于1年組的食管癌患者有12人,兩組比較共篩選出153個(gè)差異蛋白;通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)的篩選及驗(yàn)證,選擇出差異倍數(shù)1.5-2倍,差異顯著且有意義的蛋白有血清淀粉樣蛋白、免疫球蛋白、視黃醇結(jié)合蛋白(RBP)、細(xì)胞外超氧化物岐化酶、纖連蛋白、內(nèi)凝集蛋白1;3.漢族、維吾爾族食管鱗癌血清差異蛋白相關(guān)KEGG通路分析:(1)將漢族食管癌治療前后差異蛋白導(dǎo)入KEGG數(shù)據(jù)庫(kù),得到P0.2的通路進(jìn)行分析,共篩選出腫瘤相關(guān)通路3個(gè),分別為小細(xì)胞肺癌通路、趨化因子信號(hào)通路、甲狀腺癌通路;(2)將維吾爾族食管癌治療前后差異蛋白導(dǎo)入信號(hào)通路,得到P0.05且和腫瘤相關(guān)的通路有2個(gè),即Toll-like receptors(TLR)通路、NF-k B信號(hào)通路;(3)將漢族食管癌療效相關(guān)差異蛋白導(dǎo)入KEGG通路后,在所有信號(hào)通路中篩選出與腫瘤相關(guān)通路有1個(gè),為HIF-1信號(hào)通路;(4)將維吾爾族食管癌療效相關(guān)差異蛋白導(dǎo)入KEGG通路,有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的KEGG通路有1個(gè)(P0.05),且為腫瘤相關(guān)通路有PPAR信號(hào)通路。結(jié)論:(1)通過(guò)漢族與維吾爾族食管癌外周血清差異蛋白的篩選,篩選出對(duì)診斷有價(jià)值的血清蛋白,一些蛋白驗(yàn)證了既往研究結(jié)果,一些蛋白為首次發(fā)現(xiàn),可能有潛在的診斷價(jià)值,如:血液結(jié)合素(HEMO)、結(jié)合珠蛋白(HPT)、SPP24等;(2)經(jīng)過(guò)食管癌近期療效及遠(yuǎn)期療效血清差異蛋白的對(duì)比,漢族及維吾爾族患者均篩查出對(duì)療效判斷有意義的血清蛋白;(3)兩民族經(jīng)不同組別的差異蛋白比較,對(duì)診斷及療效判斷有意義的蛋白有相似的,也有不同的,其中a-酸性糖蛋白、結(jié)合珠蛋白、組蛋白均在兩民族中提示預(yù)后不良蛋白;(4)TLR、NF-k B信號(hào)通路激活提示預(yù)后不佳,而趨化因子通路提示預(yù)后良好因素。PPAR、HIF-1、VEGF、Wnt通路,這些通路也證實(shí)為腫瘤的特殊相關(guān)通路,可以作為今后研究重點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】：新疆醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：R735.1
【圖文】：

新疆醫(yī)科大學(xué)博士學(xué)位論文1.2.4 數(shù)據(jù)處理及統(tǒng)計(jì)分析將質(zhì)譜輸出的原始文件輸入到PD（Proteome Discoverer 1.4）軟件，檢索數(shù)據(jù)庫(kù)（Uniprot_human 含20199條序列）得到蛋白質(zhì)以及肽段的鑒定和定量信息。結(jié)合PD軟件輸出的蛋白質(zhì)以及肽段的相對(duì)定量信息，通過(guò)R軟件（3.4.2）對(duì)肽段定量信息進(jìn)行數(shù)據(jù)篩選、合并以及統(tǒng)計(jì)計(jì)算，將所有用于定量蛋白質(zhì)的肽段相對(duì)定量信息通過(guò)One -Sample T Test方法計(jì)算兩兩比對(duì)樣本或組別間的P值。根據(jù)各組數(shù)據(jù)結(jié)果結(jié)合軟件分析設(shè)定選取滿足差異倍數(shù)≥1.2倍，即log2|Fold change|≥0.26，且P＜0.05的蛋白質(zhì)為差異蛋白質(zhì)。（質(zhì)譜檢測(cè)示意圖見(jiàn)圖1-1）1.2.5 生物信息學(xué)分析通過(guò)R軟件按照不同的分組篩選差異蛋白，將差異或目標(biāo)蛋白檢索功能數(shù)據(jù)庫(kù)Gene Ontaology（http://www.geneontology.org/）的相關(guān)信息，進(jìn)行生物功能富集分析。KOBAS（http://kobas.cbi.pku.edu.cn/）是代謝通路富集分析的開(kāi)源軟件，結(jié)合KEGG的 Pathway數(shù)據(jù)庫(kù)，分析差異表達(dá)蛋白質(zhì)的相關(guān)的代謝通路，推斷差異蛋白可能影響的代謝通路，以進(jìn)一步探討差異蛋白的功能。

的顯著差異血清蛋白共計(jì)2個(gè)，均為顯著下調(diào)蛋白，有補(bǔ)體C1q 亞成分B組、Ig重鏈可變區(qū)。差異倍數(shù)2 倍篩選條件：（log2|Fold change|＞1），P＜0.05。（見(jiàn)表1-8）。圖1-2 局部晚期或晚期漢族食管癌患者放化療前組與健康對(duì)照組比對(duì)篩選的血清差異蛋白分布Fig 1-2 the distribution of serum differential protein in the pretreatment group and thehealthy control group of han patients with Local late or late esophageal cancer圖1-3 局部晚期或晚期漢族食管癌患者放化療后組與健康對(duì)照組比對(duì)篩選的血清差異蛋白分布Fig 1-3 the distribution of serum differential protein in after chemoradiotherapy group andhealthy control group of han patients with local or late esophageal cancer

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 黃志軍;許天文;林建清;;食管鱗癌患者血清血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子C的檢測(cè)及臨床意義[J];中國(guó)腫瘤臨床與康復(fù);2013年01期

2 李銓;劉學(xué)奎;劉巍巍;李浩;郭朱明;楊安奎;張?jiān)?曾宗淵;;頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移對(duì)硬腭鱗癌患者預(yù)后的影響[J];中國(guó)腫瘤臨床;2010年19期

3 劉玉輝;馬楠;陳嘵夏;徐龍;劉兆U

本文編號(hào)：2719281